RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566635.5

HERC2-208, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HERC2, Length 2,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2-208ENST00000566635 TRPM7Q96QT4 1865 aa20.04■□□□□ 0.8
HERC2-208ENST00000566635 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
HERC2-208ENST00000566635 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
HERC2-208ENST00000566635 TXKP42681 527 aa20.03■□□□□ 0.8
HERC2-208ENST00000566635 CHADLQ6NUI6 762 aa20.03■□□□□ 0.8
HERC2-208ENST00000566635 SLC30A10Q6XR72 485 aa20.03■□□□□ 0.8
HERC2-208ENST00000566635 UIMC1Q96RL1 719 aa20.03■□□□□ 0.8
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HERC2-208ENST00000566635 C2orf69Q8N8R5 385 aa20.03■□□□□ 0.8
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HERC2-208ENST00000566635 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
HERC2-208ENST00000566635 TEX13BQ9BXU2 312 aa20.03■□□□□ 0.8
HERC2-208ENST00000566635 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
HERC2-208ENST00000566635 TSPY26PQ9H489 355 aa20.03■□□□□ 0.8
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HERC2-208ENST00000566635 FAM86B2P0C5J1 330 aa20.02■□□□□ 0.8
HERC2-208ENST00000566635 CYP3A7P24462 503 aa20.02■□□□□ 0.8
HERC2-208ENST00000566635 TECP42680 631 aa20.02■□□□□ 0.8
HERC2-208ENST00000566635 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
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HERC2-208ENST00000566635 KRBA2Q6ZNG9 492 aa20.02■□□□□ 0.8
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HERC2-208ENST00000566635 TIGD1Q96MW7 591 aa20.02■□□□□ 0.8
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HERC2-208ENST00000566635 RPS6P62753 249 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
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HERC2-208ENST00000566635 DHX58Q96C10 678 aa20.02■□□□□ 0.79
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HERC2-208ENST00000566635 FOXN1O15353 648 aa20■□□□□ 0.79
HERC2-208ENST00000566635 STAT3P40763 770 aa20■□□□□ 0.79
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HERC2-208ENST00000566635 HERVK_113P62684 666 aa20■□□□□ 0.79
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HERC2-208ENST00000566635 RNF207Q6ZRF8 634 aa20■□□□□ 0.79
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HERC2-208ENST00000566635 KCNMB3Q9NPA1 279 aa20■□□□□ 0.79
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HERC2-208ENST00000566635 ZNF76P36508 570 aa19.99■□□□□ 0.79
HERC2-208ENST00000566635 KARSQ15046 597 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
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HERC2-208ENST00000566635 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
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HERC2-208ENST00000566635 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
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HERC2-208ENST00000566635 SASS6Q6UVJ0 657 aa19.97■□□□□ 0.79
HERC2-208ENST00000566635 CABP7Q86V35 215 aa19.97■□□□□ 0.79
HERC2-208ENST00000566635 PLIN2Q99541 437 aa19.97■□□□□ 0.79
HERC2-208ENST00000566635 CCSER1Q9C0I3 900 aa19.97■□□□□ 0.79
HERC2-208ENST00000566635 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
HERC2-208ENST00000566635 DISC1Q9NRI5 854 aa19.97■□□□□ 0.79
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