RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-208ENST00000564966 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 RMDN3Q96TC7 470 aa29.51■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 AMNQ9BXJ7 453 aa29.51■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 CCL23P55773 120 aa29.5■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 PURAQ00577 322 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 SART3Q15020 963 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
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PPP4C-208ENST00000564966 ARHGEF16Q5VV41 709 aa29.5■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 ZNF365Q70YC5 407 aa29.5■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 HOMER1Q86YM7 354 aa29.5■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 TMEM240Q5SV17 173 aa29.49■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 NCOA7Q8NI08 942 aa29.49■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 UMODL1Q5DID0 1318 aa29.48■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 WTAPQ15007 396 aa29.48■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 STXBP2Q15833 593 aa29.48■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 C16orf59Q7L2K0 433 aa29.48■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 CHST3Q7LGC8 479 aa29.48■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 IL23AQ9NPF7 189 aa29.48■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 COL20A1Q9P218 1284 aa29.48■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 E7EWF7 191 aa29.47■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 SGSM2O43147 1006 aa29.47■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa29.47■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 MYLIPQ8WY64 445 aa29.47■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 MAF1Q9H063 256 aa29.47■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 MAD2L2Q9UI95 211 aa29.47■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa29.46■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 DNAJB2P25686 324 aa29.46■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 IWS1Q96ST2 819 aa29.46■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa29.46■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 DLL1O00548 723 aa29.45■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 ZBTB5O15062 677 aa29.45■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 KPNA6O60684 536 aa29.45■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 ARIH2O95376 493 aa29.45■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 FGBP02675 491 aa29.45■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 LY6KQ17RY6 165 aa29.45■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 NBPF20Q3BBV1 942 aa29.45■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 TMEM67Q5HYA8 995 aa29.45■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 NOD1Q9Y239 953 aa29.45■■■□□ 2.31
PPP4C-208ENST00000564966 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
PPP4C-208ENST00000564966 A6NJR5 290 aa29.44■■■□□ 2.3
PPP4C-208ENST00000564966 GH1P01241 217 aa29.44■■■□□ 2.3
PPP4C-208ENST00000564966 CYP2C9P11712 490 aa29.44■■■□□ 2.3
PPP4C-208ENST00000564966 CATIPQ7Z7H3 387 aa29.44■■■□□ 2.3
PPP4C-208ENST00000564966 TAF6LQ9Y6J9 622 aa29.44■■■□□ 2.3
PPP4C-208ENST00000564966 GRXCR1A8MXD5 290 aa29.43■■■□□ 2.3
PPP4C-208ENST00000564966 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
PPP4C-208ENST00000564966 FOSL2P15408 326 aa29.43■■■□□ 2.3
PPP4C-208ENST00000564966 GRM4Q14833 912 aa29.43■■■□□ 2.3
PPP4C-208ENST00000564966 OTOP2Q7RTS6 562 aa29.43■■■□□ 2.3
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PPP4C-208ENST00000564966 TIFAQ96CG3 184 aa29.43■■■□□ 2.3
PPP4C-208ENST00000564966 SCLYQ96I15 445 aa29.43■■■□□ 2.3
PPP4C-208ENST00000564966 PIGSQ96S52 555 aa29.43■■■□□ 2.3
PPP4C-208ENST00000564966 SENP2Q9HC62 589 aa29.43■■■□□ 2.3
PPP4C-208ENST00000564966 PXMP2Q9NR77 195 aa29.43■■■□□ 2.3
PPP4C-208ENST00000564966 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
PPP4C-208ENST00000564966 TMEM265A0A087WTH1 108 aa29.42■■■□□ 2.3
PPP4C-208ENST00000564966 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
PPP4C-208ENST00000564966 AFG1LQ8WV93 481 aa29.42■■■□□ 2.3
PPP4C-208ENST00000564966 PIBF1Q8WXW3 757 aa29.42■■■□□ 2.3
PPP4C-208ENST00000564966 MRVI1Q9Y6F6 885 aa29.42■■■□□ 2.3
PPP4C-208ENST00000564966 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
PPP4C-208ENST00000564966 NR3C2P08235 984 aa29.41■■■□□ 2.3
PPP4C-208ENST00000564966 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
PPP4C-208ENST00000564966 TRAF1Q13077 416 aa29.41■■■□□ 2.3
PPP4C-208ENST00000564966 STOX1Q6ZVD7 989 aa29.41■■■□□ 2.3
PPP4C-208ENST00000564966 WNT8AQ9H1J5 351 aa29.41■■■□□ 2.3
PPP4C-208ENST00000564966 ZBBXA8MT70 800 aa29.4■■■□□ 2.3
PPP4C-208ENST00000564966 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
PPP4C-208ENST00000564966 CCDC62Q6P9F0 684 aa29.4■■■□□ 2.3
PPP4C-208ENST00000564966 MAP4K1Q92918 833 aa29.4■■■□□ 2.3
PPP4C-208ENST00000564966 PBX2P40425 430 aa29.39■■■□□ 2.3
PPP4C-208ENST00000564966 HSD17B4P51659 736 aa29.39■■■□□ 2.3
PPP4C-208ENST00000564966 NFRKBQ6P4R8 1299 aa29.39■■■□□ 2.3
PPP4C-208ENST00000564966 CASC1Q6TDU7 716 aa29.39■■■□□ 2.3
PPP4C-208ENST00000564966 DEFB128Q7Z7B8 93 aa29.39■■■□□ 2.3
PPP4C-208ENST00000564966 RETREG2Q8NC44 543 aa29.39■■■□□ 2.3
PPP4C-208ENST00000564966 HERVK_113Q902F9 699 aa29.39■■■□□ 2.3
PPP4C-208ENST00000564966 PBX4Q9BYU1 374 aa29.39■■■□□ 2.3
PPP4C-208ENST00000564966 ZNF576Q9H609 170 aa29.39■■■□□ 2.3
PPP4C-208ENST00000564966 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
PPP4C-208ENST00000564966 MSRAQ9UJ68 235 aa29.39■■■□□ 2.3
PPP4C-208ENST00000564966 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
PPP4C-208ENST00000564966 MMP3P08254 477 aa29.38■■■□□ 2.29
PPP4C-208ENST00000564966 POLR2MP0CAP2 368 aa29.38■■■□□ 2.29
PPP4C-208ENST00000564966 FCHSD1Q86WN1 690 aa29.38■■■□□ 2.29
PPP4C-208ENST00000564966 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP29.38■■■□□ 2.29
PPP4C-208ENST00000564966 MTMR8Q96EF0 704 aa29.38■■■□□ 2.29
PPP4C-208ENST00000564966 OPLAHO14841 1288 aa29.37■■■□□ 2.29
PPP4C-208ENST00000564966 SORBS3O60504 671 aa29.37■■■□□ 2.29
PPP4C-208ENST00000564966 CASTP20810 708 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
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