RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563298.1

PPCDC-204, Transcript of phosphopantothenoylcysteine decarboxylase, human

TSL 5

Gene PPCDC, Length 476 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPCDC-204	ENST00000563298	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	NFIX	Q14938	502 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	KRT31	Q15323	416 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	CALCRL	Q16602	461 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	MEA1	Q16626	185 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	HYI	Q5T013	277 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	CENPP	Q6IPU0	288 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	HDX	Q7Z353	690 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	TMEM139	Q8IV31	216 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	MB21D1	Q8N884	522 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	TRIM58	Q8NG06	486 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	ZNF384	Q8TF68	577 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	FBXW7	Q969H0	707 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	TEKT1	Q969V4	418 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	TRIM47	Q96LD4	638 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	FAM20A	Q96MK3	541 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	INCENP	Q9NQS7	918 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	GINM1	Q9NU53	330 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	NYAP2	Q9P242	653 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	MYO6	Q9UM54	1294 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	ATP8B3	O60423	1300 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	FLT1	P17948	1338 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	BTAF1	O14981	1849 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	C6orf229	H3BNL8	230 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	ZBTB5	O15062	677 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	PPFIA3	O75145	1194 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	GFPT2	O94808	682 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	NDUFA10	O95299	355 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	USP17L8	P0C7I0	530 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	CCDC172	P0C7W6	258 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	CYP3A7	P24462	503 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	CASP14	P31944	242 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	ABCD1	P33897	745 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	PRCP	P42785	496 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	RHBDL3	P58872	404 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	CHMP4BP1	P59074	171 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	GABPA	Q06546	454 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	PDE4D	Q08499	809 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	MAN2A1	Q16706	1144 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	ISM2	Q6H9L7	571 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	WDR93	Q6P2C0	686 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	DPF2	Q92785	391 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	MASTL	Q96GX5	879 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	CCDC42	Q96M95	316 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPCDC-204	ENST00000563298	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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