RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561136.1

TMOD3-209, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 803 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-209ENST00000561136 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa6.64□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 NCAPG2Q86XI2 1143 aa6.64□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 ANKMY2Q8IV38 441 aa6.64□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 DRC7Q8IY82 874 aa6.64□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 NGEFQ8N5V2 710 aa6.64□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 TANGO6Q9C0B7 1094 aa6.64□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 MRVI1Q9Y6F6 885 aa6.64□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 YDJCA8MPS7 323 aa6.63□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 ABCC4O15439 1325 aa6.63□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 PPIP5K2O43314 1243 aa6.63□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 RECKO95980 971 aa6.63□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 S100BP04271 92 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 TEFQ10587 303 aa6.63□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF792Q3KQV3 632 aa6.63□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 CCDC144BQ3MJ40 725 aa6.63□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 HGSNATQ68CP4 663 aa6.63□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.63□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 TTLL7Q6ZT98 887 aa6.63□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 ZAR1Q86SH2 424 aa6.63□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 GLMNQ92990 594 aa6.63□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 OTOFQ9HC10 1997 aa6.63□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 TMEM51Q9NW97 253 aa6.63□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 MIS18AQ9NYP9 233 aa6.63□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 GPRC5DQ9NZD1 345 aa6.63□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa6.63□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa6.63□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa6.63□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa6.63□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 KIF7Q2M1P5 1343 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 USP17L15C9J2P7 530 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 USP17L10C9JJH3 530 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 USP17L13C9JLJ4 530 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 USP17L12C9JPN9 530 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 USP17L11C9JVI0 530 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 USP17L21D6R901 530 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 USP17L18D6R9N7 530 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 USP17L22D6RA61 530 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 USP17L17D6RBQ6 530 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 USP17L19D6RCP7 530 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 USP17L20D6RJB6 530 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 RAD17O75943 681 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 TIAF1O95411 115 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 NTSR2O95665 410 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 DRD2P14416 443 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 PRKAR2BP31323 418 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 ECE1P42892 770 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 EIF6P56537 245 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 POU5F1BQ06416 359 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 CXCL9Q07325 125 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 USP17L24Q0WX57 530 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 NIM1KQ8IY84 436 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 SLC38A3Q99624 504 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 YY1AP1Q9H869 796 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 IFT122Q9HBG6 1241 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 RTL9Q8NET4 1388 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 GNAT3A8MTJ3 354 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 TIMM44O43615 452 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 ATG7O95352 703 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 ANXA1P04083 346 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 HUNKP57058 714 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 SUSD4Q5VX71 490 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 MOB2Q70IA6 237 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 NT5DC4Q86YG4 428 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 RTKN2Q8IZC4 609 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 JDP2Q8WYK2 163 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 PIK3R5Q8WYR1 880 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 FAM168AQ92567 244 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 USP26Q9BXU7 913 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 CYP4F12Q9HCS2 524 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 SLC5A6Q9Y289 635 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 LAMB1P07942 1786 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 TRPA1O75762 1119 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 RFX1P22670 979 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 ARL4DP49703 201 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 C19orf57Q0VDD7 668 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 TCEAL1Q15170 157 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 PROSER3Q2NL68 480 aa6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms