RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557477.1

PRPF39-212, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF39, Length 724 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-212ENST00000557477 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
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PRPF39-212ENST00000557477 JAMLQ86YT9 394 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF39-212ENST00000557477 LINC01599Q8WXQ3 324 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF39-212ENST00000557477 DPF3Q92784 378 aa6.52□□□□□ -1.37
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PRPF39-212ENST00000557477 CCDC39Q9UFE4 941 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF39-212ENST00000557477 UNC13AQ9UPW8 1703 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF39-212ENST00000557477 FADS2P1A8MWK0 482 aa6.51□□□□□ -1.37
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PRPF39-212ENST00000557477 SAMD15Q9P1V8 674 aa6.49□□□□□ -1.37
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PRPF39-212ENST00000557477 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PRPF39-212ENST00000557477 A0A1W2PQY0 241 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF39-212ENST00000557477 NOTOA8MTQ0 251 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF39-212ENST00000557477 WNT9AO14904 365 aa6.47□□□□□ -1.37
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PRPF39-212ENST00000557477 PYGMP11217 842 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF39-212ENST00000557477 FUT4P22083 530 aa6.47□□□□□ -1.37
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