RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550260.1

LARP4-215, Transcript of La ribonucleoprotein domain family member 4, human

TSL 3

Gene LARP4, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LARP4-215	ENST00000550260	NCAPH	Q15003	741 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260	SPATS1	Q496A3	300 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260	SPATA25	Q9BR10	227 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260	C7orf72	A4D263	438 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260	UNCX	A6NJT0	531 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260	ZBTB7A	O95365	584 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260	NTRK1	P04629	796 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260	PML	P29590	882 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260	CAP1	Q01518	475 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260	RTP5	Q14D33	572 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260	SV2C	Q496J9	727 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260	NETO2	Q8NC67	525 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260	PALD1	Q9ULE6	856 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260	LIPI	Q6XZB0	460 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260	GGN	Q86UU5	652 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260	FERMT3	Q86UX7	667 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260	GPR20	Q99678	358 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LARP4-215	ENST00000550260		K7ESM1	405 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	DDAH1	O94760	285 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	THBD	P07204	575 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	ECI1	P42126	302 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	KCNJ6	P48051	423 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	GJA9	P57773	515 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	VWA3B	Q502W6	1294 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	IQCE	Q6IPM2	695 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	DDX11	Q96FC9	970 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	MTA3	Q9BTC8	594 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	LGR4	Q9BXB1	951 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	ADAMTS20	P59510	1910 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	C22orf46	C9J442	243 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	MYO1B	O43795	1136 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	FBLN1	P23142	703 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	NFKB2	Q00653	900 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	ZNF827	Q17R98	1081 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	TNNI3K	Q59H18	835 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	COPS5	Q92905	334 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	MMP19	Q99542	508 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	CYP2C8	P10632	490 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	INSRR	P14616	1297 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	CNR2	P34972	360 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	EFEMP1	Q12805	493 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	INF2	Q27J81	1249 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	MBLAC2	Q68D91	279 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	CEP68	Q76N32	757 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	CARF	Q8N187	725 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LARP4-215	ENST00000550260	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64

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