RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532457.5

PACSIN3-209, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-209ENST00000532457 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
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PACSIN3-209ENST00000532457 CA12O43570 354 aa24.96■■□□□ 1.59
PACSIN3-209ENST00000532457 BMP15O95972 392 aa24.96■■□□□ 1.59
PACSIN3-209ENST00000532457 AP3B2Q13367 1082 aa24.96■■□□□ 1.59
PACSIN3-209ENST00000532457 USP49Q70CQ1 688 aa24.96■■□□□ 1.59
PACSIN3-209ENST00000532457 TRERF1Q96PN7 1200 aa24.96■■□□□ 1.59
PACSIN3-209ENST00000532457 CSRNP2Q9H175 543 aa24.96■■□□□ 1.59
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PACSIN3-209ENST00000532457 CYP2C8P10632 490 aa24.95■■□□□ 1.58
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PACSIN3-209ENST00000532457 SAGE1Q9NXZ1 904 aa24.94■■□□□ 1.58
PACSIN3-209ENST00000532457 COL20A1Q9P218 1284 aa24.94■■□□□ 1.58
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PACSIN3-209ENST00000532457 MB21D1Q8N884 522 aa24.92■■□□□ 1.58
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PACSIN3-209ENST00000532457 CNMDO75829 334 aa24.91■■□□□ 1.58
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM160A1Q05DH4 1040 aa24.91■■□□□ 1.58
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PACSIN3-209ENST00000532457 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
PACSIN3-209ENST00000532457 MBOAT7Q96N66 472 aa24.9■■□□□ 1.58
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PACSIN3-209ENST00000532457 GJA10Q969M2 543 aa24.89■■□□□ 1.58
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PACSIN3-209ENST00000532457 FAM86B1E9PN63 330 aa24.89■■□□□ 1.57
PACSIN3-209ENST00000532457 CYP3A4P08684 503 aa24.89■■□□□ 1.57
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM86B2P0C5J1 330 aa24.89■■□□□ 1.57
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC30A10Q6XR72 485 aa24.89■■□□□ 1.57
PACSIN3-209ENST00000532457 HAS1Q92839 578 aa24.89■■□□□ 1.57
PACSIN3-209ENST00000532457 UIMC1Q96RL1 719 aa24.89■■□□□ 1.57
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PACSIN3-209ENST00000532457 CDC25AP30304 524 aa24.88■■□□□ 1.57
PACSIN3-209ENST00000532457 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
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PACSIN3-209ENST00000532457 SYCE3A1L190 88 aa24.87■■□□□ 1.57
PACSIN3-209ENST00000532457 LAD1O00515 517 aa24.87■■□□□ 1.57
PACSIN3-209ENST00000532457 TBC1D8O95759 1140 aa24.87■■□□□ 1.57
PACSIN3-209ENST00000532457 PRPHP41219 470 aa24.87■■□□□ 1.57
PACSIN3-209ENST00000532457 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
PACSIN3-209ENST00000532457 NSMFQ6X4W1 530 aa24.87■■□□□ 1.57
PACSIN3-209ENST00000532457 DTHD1Q6ZMT9 781 aa24.87■■□□□ 1.57
PACSIN3-209ENST00000532457 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
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