RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531385.1

PTPRU-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 737 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-211ENST00000531385 FCHSD1Q86WN1 690 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 IL31RAQ8NI17 732 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 COPS5Q92905 334 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 USP26Q9BXU7 913 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 SPC25Q9HBM1 224 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 PXMP2Q9NR77 195 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 GOLGA8AA7E2F4 631 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 GOLGA8BA8MQT2 603 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 ARIH2O95376 493 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 RPS6KB1P23443 525 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 GHRHRQ02643 423 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 SNX17Q15036 470 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 RTN1Q16799 776 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 BRF1Q92994 677 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 LZTS2Q9BRK4 669 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 AP5M1Q9H0R1 490 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 STARD7Q9NQZ5 370 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 MOXD2PA6NHM9 499 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 POLR2MP0CAP2 368 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 DUSP28Q4G0W2 176 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 SEPT14Q6ZU15 432 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
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PTPRU-211ENST00000531385 SMARCA1P28370 1054 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 CDC27P30260 824 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 TLE2Q04725 743 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 PPP2R5BQ15173 497 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 CXCL17Q6UXB2 119 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP21.66■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 PDCD2LQ9BRP1 358 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 LTBP2Q14767 1821 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 NR3C2P08235 984 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 OR6J1Q8NGC5 347 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 SCFD2Q8WU76 684 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 VTI1AQ96AJ9 217 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 MAF1Q9H063 256 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 PRO3102Q9H379 93 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 B4DLN1 442 aa21.64■■□□□ 1.05
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PTPRU-211ENST00000531385 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
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PTPRU-211ENST00000531385 TRAF1Q13077 416 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 STXBP2Q15833 593 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 USP17L6PQ6QN14 398 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 GLT1D1Q96MS3 346 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 IWS1Q96ST2 819 aa21.64■■□□□ 1.05
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PTPRU-211ENST00000531385 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 LAMA3Q16787 3333 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 PSMA5P28066 241 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP21.63■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 PGM5Q15124 567 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 LY6KQ17RY6 165 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 GDF15Q99988 308 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 SORBS3O60504 671 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 PPFIA3O75145 1194 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 ADD1P35611 737 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 PSMC6P62333 389 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 TTLL4Q14679 1199 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 UBE2SQ16763 222 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 C1orf53Q5VUE5 145 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 WWC2Q6AWC2 1192 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 CCDC62Q6P9F0 684 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 Q9Y3F1 56 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 TRIM43BA6NCK2 446 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 MEIS2O14770 477 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 RGS20O76081 388 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 TYW1BQ6NUM6 668 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 RUFY3Q7L099 469 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 AGXT2Q9BYV1 514 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 V9GY48 417 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PTPRU-211ENST00000531385 ELP1O95163 1332 aa21.6■■□□□ 1.05
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