RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522344.1

CPEB4-210, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene CPEB4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4-210ENST00000522344 NTRK1P04629 796 aa6.64□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 GLI4P10075 376 aa6.64□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 PI3P19957 117 aa6.64□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 GFRA1P56159 465 aa6.64□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 SSPNQ14714 243 aa6.64□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 IQCEQ6IPM2 695 aa6.64□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 CCDC103Q8IW40 242 aa6.64□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 SIGLEC10Q96LC7 697 aa6.64□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 IER2Q9BTL4 223 aa6.64□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 BCAS3Q9H6U6 928 aa6.64□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 IQCA1LA6NCM1 817 aa6.63□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 RFXAPO00287 272 aa6.63□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 MYO1BO43795 1136 aa6.63□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 SCG5P05408 212 aa6.63□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF385BQ569K4 471 aa6.63□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 WWC2Q6AWC2 1192 aa6.63□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 CILP2Q8IUL8 1156 aa6.63□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 KREMEN2Q8NCW0 462 aa6.63□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 DPF3Q92784 378 aa6.63□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 NUDT5Q9UKK9 219 aa6.63□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.63□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 SIT1Q9Y3P8 196 aa6.63□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 C22orf46C9J442 243 aa6.62□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 FPR2P25090 351 aa6.62□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 BCL6P41182 706 aa6.62□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 KCNAB2Q13303 367 aa6.62□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 USP53Q70EK8 1073 aa6.62□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 CEP68Q76N32 757 aa6.62□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 IGDCC3Q8IVU1 814 aa6.62□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 NETO2Q8NC67 525 aa6.62□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 PANK1Q8TE04 598 aa6.62□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 KCTD13Q8WZ19 329 aa6.62□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 ALG3Q92685 438 aa6.62□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.62□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa6.62□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 ARNTLO00327 626 aa6.61□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 PDPK1O15530 556 aa6.61□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 PRODHO43272 600 aa6.61□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 LCP1P13796 627 aa6.61□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 PFKLP17858 780 aa6.61□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 LTBRP36941 435 aa6.61□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 MTERF2Q49AM1 385 aa6.61□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 DENND5AQ6IQ26 1287 aa6.61□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 C1QL4Q86Z23 238 aa6.61□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 RCBTB1Q8NDN9 531 aa6.61□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 PLEKHO2Q8TD55 490 aa6.61□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 PEX11GQ96HA9 241 aa6.61□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 SGSM3Q96HU1 749 aa6.61□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 FAN1Q9Y2M0 1017 aa6.61□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa6.61□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 LIMS1P48059 325 aa6.6□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 GTF2A2P52657 109 aa6.6□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 SPATC1Q76KD6 591 aa6.6□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa6.6□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 C1orf159Q96HA4 380 aa6.6□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM169Q96HH4 297 aa6.6□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 ARHGEF4Q9NR80 690 aa6.6□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 DLX3O60479 287 aa6.59□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 MAP4K2Q12851 820 aa6.59□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa6.59□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 NBPF6Q5VWK0 638 aa6.59□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 CNKSR3Q6P9H4 555 aa6.59□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.59□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 TMEFF1Q8IYR6 380 aa6.59□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 NBPF4Q96M43 638 aa6.59□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 AP5M1Q9H0R1 490 aa6.59□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 SIRPGQ9P1W8 387 aa6.59□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.59□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 MSRB2Q9Y3D2 182 aa6.59□□□□□ -1.35
CPEB4-210ENST00000522344 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.58□□□□□ -1.36
CPEB4-210ENST00000522344 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CPEB4-210ENST00000522344 ASGR2P07307 311 aa6.58□□□□□ -1.36
CPEB4-210ENST00000522344 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CPEB4-210ENST00000522344 NCAM1P13591 858 aa6.58□□□□□ -1.36
CPEB4-210ENST00000522344 PMLP29590 882 aa6.58□□□□□ -1.36
CPEB4-210ENST00000522344 MC3RP41968 323 aa6.58□□□□□ -1.36
CPEB4-210ENST00000522344 RBM10P98175 930 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CPEB4-210ENST00000522344 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CPEB4-210ENST00000522344 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CPEB4-210ENST00000522344 TCERG1LQ5VWI1 586 aa6.58□□□□□ -1.36
CPEB4-210ENST00000522344 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.58□□□□□ -1.36
CPEB4-210ENST00000522344 NSMFQ6X4W1 530 aa6.58□□□□□ -1.36
CPEB4-210ENST00000522344 NLRP10Q86W26 655 aa6.58□□□□□ -1.36
CPEB4-210ENST00000522344 TSPAN17Q96FV3 270 aa6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms