RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519815.5

TRPS1-210, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRPS1, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-210ENST00000519815 FERMT2Q96AC1 680 aa11.87□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa11.87□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 PHIPQ8WWQ0 1821 aa11.86□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 UTRNP46939 3433 aa11.86□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 LAD1O00515 517 aa11.86□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 WNT7AO00755 349 aa11.86□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 CFBP00751 764 aa11.86□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 CETPP11597 493 aa11.86□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 GJA5P36382 358 aa11.86□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 USP11P51784 963 aa11.86□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 GTF2A2P52657 109 aa11.86□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 MOGSQ13724 837 aa11.86□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 TKFCQ3LXA3 575 aa11.86□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa11.86□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 MB21D1Q8N884 522 aa11.86□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 REPS2Q8NFH8 660 aa11.86□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 WNK4Q96J92 1243 aa11.86□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 ANO3Q9BYT9 981 aa11.86□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 EHMT1Q9H9B1 1298 aa11.86□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
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TRPS1-210ENST00000519815 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 OSBPP22059 807 aa11.85□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 HSD17B4P51659 736 aa11.85□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 PPP4R3AQ6IN85 833 aa11.85□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 LBX2Q6XYB7 198 aa11.85□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 FCHSD1Q86WN1 690 aa11.85□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 C4orf32Q8N8J7 132 aa11.85□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 FSIP1Q8NA03 581 aa11.85□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 CLEC4DQ8WXI8 215 aa11.85□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 TBC1D5Q92609 795 aa11.85□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 CLIC6Q96NY7 704 aa11.85□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 TRERF1Q96PN7 1200 aa11.85□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 MAF1Q9H063 256 aa11.85□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 TCHHQ07283 1943 aa11.84□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 NFIBO00712 420 aa11.84□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 NEMFO60524 1076 aa11.84□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 LIG1P18858 919 aa11.84□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 SREBF1P36956 1147 aa11.84□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 STAT3P40763 770 aa11.84□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 PRPHP41219 470 aa11.84□□□□□ -0.51
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TRPS1-210ENST00000519815 TMEM132BQ14DG7 1078 aa11.84□□□□□ -0.51
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TRPS1-210ENST00000519815 RESP18Q5W5W9 173 aa11.84□□□□□ -0.51
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TRPS1-210ENST00000519815 TEX13BQ9BXU2 312 aa11.84□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 HOMER2Q9NSB8 354 aa11.84□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 TMEM63CQ9P1W3 806 aa11.84□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa11.84□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 MRVI1Q9Y6F6 885 aa11.84□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 OTOFQ9HC10 1997 aa11.84□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 MYH15Q9Y2K3 1946 aa11.84□□□□□ -0.51
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TRPS1-210ENST00000519815 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa11.83□□□□□ -0.52
TRPS1-210ENST00000519815 KIF3CO14782 793 aa11.83□□□□□ -0.52
TRPS1-210ENST00000519815 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
TRPS1-210ENST00000519815 CYP3A4P08684 503 aa11.83□□□□□ -0.52
TRPS1-210ENST00000519815 CYP3A7P24462 503 aa11.83□□□□□ -0.52
TRPS1-210ENST00000519815 HERVK_113P62684 666 aa11.83□□□□□ -0.52
TRPS1-210ENST00000519815 PLS1Q14651 629 aa11.83□□□□□ -0.52
TRPS1-210ENST00000519815 CCL15Q16663 113 aa11.83□□□□□ -0.52
TRPS1-210ENST00000519815 CCDC183Q5T5S1 534 aa11.83□□□□□ -0.52
TRPS1-210ENST00000519815 SHC4Q6S5L8 630 aa11.83□□□□□ -0.52
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TRPS1-210ENST00000519815 CRYGNQ8WXF5 182 aa11.83□□□□□ -0.52
TRPS1-210ENST00000519815 CSRNP2Q9H175 543 aa11.83□□□□□ -0.52
TRPS1-210ENST00000519815 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa11.83□□□□□ -0.52
TRPS1-210ENST00000519815 RNF146Q9NTX7 359 aa11.83□□□□□ -0.52
TRPS1-210ENST00000519815 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
TRPS1-210ENST00000519815 DACT1Q9NYF0 836 aa11.83□□□□□ -0.52
TRPS1-210ENST00000519815 FAM13BQ9NYF5 915 aa11.83□□□□□ -0.52
TRPS1-210ENST00000519815 PNMA3Q9UL41 463 aa11.83□□□□□ -0.52
TRPS1-210ENST00000519815 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa11.83□□□□□ -0.52
TRPS1-210ENST00000519815 RIPK3Q9Y572 518 aa11.83□□□□□ -0.52
TRPS1-210ENST00000519815 PASKQ96RG2 1323 aa11.83□□□□□ -0.52
TRPS1-210ENST00000519815 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa11.82□□□□□ -0.52
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