RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 KLHL25Q9H0H3 589 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 BTG4Q9NY30 223 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 C8BP07358 591 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 EIF6P56537 245 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 PPP2R5EQ16537 467 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 BORAQ6PGQ7 559 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 ETV3LQ6ZN32 361 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 GORASP1Q9BQQ3 440 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 BACH2Q9BYV9 841 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 AP5M1Q9H0R1 490 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP5.01□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 MARCH2Q9P0N8 246 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 C7orf72A4D263 438 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 PLATP00750 562 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 TNFRSF1AP19438 455 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 RBM10P98175 930 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 FANCCQ00597 558 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 KIAA2012Q0VF49 1180 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 GRB10Q13322 594 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 LDLRAD1Q5T700 205 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 CPZQ66K79 652 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 MCTP2Q6DN12 878 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 CD300LDQ6UXZ3 194 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 STK32CQ86UX6 486 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 LGI4Q8N135 537 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 SAMD11Q96NU1 681 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP5□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 PCDH18Q9HCL0 1135 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 GINM1Q9NU53 330 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 CLEC1BQ9P126 229 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 SRRDQ9UH36 339 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 MATN3O15232 486 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 FSHBP01225 129 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF20P17024 532 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 THBS2P35442 1172 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 GLB1LQ6UWU2 654 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 LINC00482Q8N8I6 264 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 PPP1R14AQ96A00 147 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 SYT3Q9BQG1 590 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 AKT3Q9Y243 479 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 INVSQ9Y283 1065 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 EFR3BQ9Y2G0 817 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 A0A1W2PQH9 124 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 MROH6A6NGR9 719 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCNH1O95259 989 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 PLS3P13797 630 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 RPL13P26373 211 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 PAK2Q13177 524 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 TEX2Q8IWB9 1127 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM26EQ8N5C1 309 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 TTLL6Q8N841 843 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 KYQ8NBH2 561 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 YIPF4Q9BSR8 244 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 GPRC5CQ9NQ84 441 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 C22orf46C9J442 243 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP4.97□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 RACK1P63244 317 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 SCRN1Q12765 414 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM26FQ5R3K3 315 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 KIAA1211LQ6NV74 962 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 MILR1Q7Z6M3 343 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF654Q8IZM8 581 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 TTC9BQ8N6N2 239 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR6P1Q8NGX9 317 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 ANKRD34BA5PLL1 514 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-277P-201ENST00000516272 NOP56O00567 594 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-277P-201ENST00000516272 THBDP07204 575 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-277P-201ENST00000516272 C9orf131Q5VYM1 1079 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-277P-201ENST00000516272 MBLAC2Q68D91 279 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-277P-201ENST00000516272 POMZP3Q6PJE2 187 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-277P-201ENST00000516272 VHLLQ6RSH7 139 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-277P-201ENST00000516272 LIMS2Q7Z4I7 341 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-277P-201ENST00000516272 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-277P-201ENST00000516272 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC16A11Q8NCK7 471 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-277P-201ENST00000516272 PLEKHO2Q8TD55 490 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-277P-201ENST00000516272 CPLX3Q8WVH0 158 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-277P-201ENST00000516272 KLHL6Q8WZ60 621 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-277P-201ENST00000516272 SEC14L1Q92503 715 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-277P-201ENST00000516272 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-277P-201ENST00000516272 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-277P-201ENST00000516272 SPATA32Q96LK8 384 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-277P-201ENST00000516272 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-277P-201ENST00000516272 APEX2Q9UBZ4 518 aa4.96□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms