RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514128.1

SIMC1-211, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 697 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-211ENST00000514128 TRPV6Q9H1D0 765 aa28.39■■■□□ 2.14
SIMC1-211ENST00000514128 SEMA6BQ9H3T3 888 aa28.39■■■□□ 2.14
SIMC1-211ENST00000514128 STAG2Q8N3U4 1231 aa28.38■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 NCOA7Q8NI08 942 aa28.38■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 RMDN3Q96TC7 470 aa28.38■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 SGSM2O43147 1006 aa28.37■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 KPNA6O60684 536 aa28.37■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 ACRP10323 421 aa28.37■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 FAM47CQ5HY64 1035 aa28.37■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 TMEM240Q5SV17 173 aa28.37■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 ARHGEF16Q5VV41 709 aa28.37■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 TBC1D5Q92609 795 aa28.37■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 TAAR1Q96RJ0 339 aa28.37■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 IWS1Q96ST2 819 aa28.37■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 IL23AQ9NPF7 189 aa28.37■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 CFBP00751 764 aa28.36■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa28.36■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 DNAJB2P25686 324 aa28.36■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 STXBP2Q15833 593 aa28.36■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 SEPT14Q6ZU15 432 aa28.36■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 ZNF365Q70YC5 407 aa28.36■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 COPS5Q92905 334 aa28.36■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 COL20A1Q9P218 1284 aa28.36■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 MAD2L2Q9UI95 211 aa28.36■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 ZBTB5O15062 677 aa28.35■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 TRAF1Q13077 416 aa28.35■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 WTAPQ15007 396 aa28.35■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 C16orf59Q7L2K0 433 aa28.35■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 UMODL1Q5DID0 1318 aa28.35■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 A6NJR5 290 aa28.34■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 E7EWF7 191 aa28.34■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 CCL23P55773 120 aa28.34■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 GRM4Q14833 912 aa28.34■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 HOMER1Q86YM7 354 aa28.34■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa28.34■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 ARIH2O95376 493 aa28.33■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 GH1P01241 217 aa28.33■■■□□ 2.13
SIMC1-211ENST00000514128 NBPF20Q3BBV1 942 aa28.32■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 TMEM67Q5HYA8 995 aa28.32■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 CATIPQ7Z7H3 387 aa28.32■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 MYLIPQ8WY64 445 aa28.32■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 TIFAQ96CG3 184 aa28.32■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 MTMR8Q96EF0 704 aa28.32■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 PXMP2Q9NR77 195 aa28.32■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 FGBP02675 491 aa28.31■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 FOSL2P15408 326 aa28.31■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 HSD17B4P51659 736 aa28.31■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 CHMP4BP1P59074 171 aa28.31■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 RASIP1Q5U651 963 aa28.31■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 NFRKBQ6P4R8 1299 aa28.31■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 CCDC62Q6P9F0 684 aa28.31■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 WNT8AQ9H1J5 351 aa28.31■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 NOD1Q9Y239 953 aa28.31■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 TANC1Q9C0D5 1861 aa28.3■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 CYP2C9P11712 490 aa28.3■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 LY6KQ17RY6 165 aa28.3■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 STOX1Q6ZVD7 989 aa28.3■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 CHST3Q7LGC8 479 aa28.3■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 AFG1LQ8WV93 481 aa28.3■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 HERVK_113Q902F9 699 aa28.3■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 MAP4K1Q92918 833 aa28.3■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 MRVI1Q9Y6F6 885 aa28.3■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 TAF6LQ9Y6J9 622 aa28.3■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 MYH7BA7E2Y1 1941 aa28.3■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 DLL1O00548 723 aa28.29■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 NR3C2P08235 984 aa28.29■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 SAMD3Q8N6K7 520 aa28.29■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 PIGSQ96S52 555 aa28.29■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 GBF1Q92538 1859 aa28.29■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 OPLAHO14841 1288 aa28.28■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 MMP3P08254 477 aa28.28■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 GHRHRQ02643 423 aa28.28■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 ARHGAP1Q07960 439 aa28.28■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 OTOP2Q7RTS6 562 aa28.28■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 SCLYQ96I15 445 aa28.28■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 RIOX1Q9H6W3 641 aa28.28■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 SENP2Q9HC62 589 aa28.28■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 MYO9BQ13459 2157 aa28.27■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 PFKMP08237 780 aa28.27■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 TROAPQ12815 778 aa28.27■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 RAB30Q15771 203 aa28.27■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 CASC1Q6TDU7 716 aa28.27■■■□□ 2.12
SIMC1-211ENST00000514128 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms