RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489639.1

MFSD1-217, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene MFSD1, Length 447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1-217ENST00000489639 HTRA3P83110 453 aa7.2□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 CAMK2BQ13554 666 aa7.2□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 QRICH1Q2TAL8 776 aa7.2□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 FAM83BQ5T0W9 1011 aa7.2□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa7.2□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 FBXO11Q86XK2 927 aa7.2□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 IRF7Q92985 503 aa7.2□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 CUL5Q93034 780 aa7.2□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 FERMT2Q96AC1 680 aa7.2□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 WRNIP1Q96S55 665 aa7.2□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 AMNQ9BXJ7 453 aa7.2□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 NUP62CLQ9H1M0 184 aa7.2□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 CLSTN2Q9H4D0 955 aa7.2□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 DACT1Q9NYF0 836 aa7.2□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 PCDHA6Q9UN73 950 aa7.2□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa7.2□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 MYH6P13533 1939 aa7.19□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 MYH4Q9Y623 1939 aa7.19□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa7.19□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 FSD2A1L4K1 749 aa7.19□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 C19orf81C9J6K1 198 aa7.19□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 LAD1O00515 517 aa7.19□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 KINO60870 393 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 FDX1P10109 184 aa7.19□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 PTPRAP18433 802 aa7.19□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 ATP2B1P20020 1258 aa7.19□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 INPP5BP32019 993 aa7.19□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 IREB2P48200 963 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 MAP3K11Q16584 847 aa7.19□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 RESP18Q5W5W9 173 aa7.19□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 LRSAM1Q6UWE0 723 aa7.19□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 KRT26Q7Z3Y9 468 aa7.19□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 SPICE1Q8N0Z3 855 aa7.19□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 KLRG1Q96E93 195 aa7.19□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 TNMDQ9H2S6 317 aa7.19□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 PSTPIP2Q9H939 334 aa7.19□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 FAM13BQ9NYF5 915 aa7.19□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 PRR12Q9ULL5 1215 aa7.19□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa7.19□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa7.19□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 SSC5DA1L4H1 1573 aa7.19□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 DOCK1Q14185 1865 aa7.18□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 SYCE3A1L190 88 aa7.18□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 H3BM21 787 aa7.18□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 NR1I2O75469 434 aa7.18□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 FOSP01100 380 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 PFKFB1P16118 471 aa7.18□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 PRPHP41219 470 aa7.18□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 BACE1P56817 501 aa7.18□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 AP3B2Q13367 1082 aa7.18□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 ZNF174Q15697 407 aa7.18□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 INF2Q27J81 1249 aa7.18□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 TPRNQ4KMQ1 711 aa7.18□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa7.18□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 NEK8Q86SG6 692 aa7.18□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 ZNF280CQ8ND82 737 aa7.18□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 ENGASEQ8NFI3 743 aa7.18□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP7.18□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 COA7Q96BR5 231 aa7.18□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 C12orf42Q96LP6 360 aa7.18□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 TIGD1Q96MW7 591 aa7.18□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 SLF1Q9BQI6 1058 aa7.18□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 TSPY26PQ9H489 355 aa7.18□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa7.18□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 CSADQ9Y600 493 aa7.18□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 ABCB11O95342 1321 aa7.18□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 ADM5C9JUS6 153 aa7.17□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 J3QL48 77 aa7.17□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 USP2O75604 605 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 CCDC192P0DO97 292 aa7.17□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 VCAM1P19320 739 aa7.17□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 MCM7P33993 719 aa7.17□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 SYKP43405 635 aa7.17□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 CLK2P49760 499 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
MFSD1-217ENST00000489639 MRE11P49959 708 aa7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms