RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487269.1

FAM204A-208, Transcript of family with sequence similarity 204 member A, human

TSL 2

Gene FAM204A, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM204A-208	ENST00000487269	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	SCLY	Q96I15	445 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	PBX4	Q9BYU1	374 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	KAT14	Q9H8E8	782 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	IL23A	Q9NPF7	189 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	HIP1	O00291	1037 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	FOSL2	P15408	326 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	PTH1R	Q03431	593 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	TTC22	Q5TAA0	569 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	USP38	Q8NB14	1042 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	TIFA	Q96CG3	184 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	OPLAH	O14841	1288 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	PPP2R5B	Q15173	497 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	SEC23A	Q15436	765 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	RGS22	Q8NE09	1264 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	DNER	Q8NFT8	737 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	SCFD2	Q8WU76	684 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	HERVK_113	Q902F9	699 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	ZNF576	Q9H609	170 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	SENP2	Q9HC62	589 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	PNMA2	Q9UL42	364 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	FGB	P02675	491 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	CPT1A	P50416	773 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	KRT23	Q9C075	422 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	TTC28	Q96AY4	2481 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	ABCB11	O95342	1321 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269		A6NJR5	290 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	CHML	P26374	656 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	RABGGTB	P53611	331 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	CHMP4BP1	P59074	171 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	LY6K	Q17RY6	165 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	FBXO11	Q86XK2	927 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	AFG1L	Q8WV93	481 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	RMDN3	Q96TC7	470 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	MYO9B	Q13459	2157 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAM204A-208	ENST00000487269	KLRF2	D3W0D1	207 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM204A-208	ENST00000487269	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	13.89	□□□□□ -0.19
FAM204A-208	ENST00000487269	CYP21A2	P08686	494 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM204A-208	ENST00000487269	PRR29	P0C7W0	189 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM204A-208	ENST00000487269	MYOG	P15173	224 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM204A-208	ENST00000487269	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
FAM204A-208	ENST00000487269	ARHGAP1	Q07960	439 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM204A-208	ENST00000487269	TTLL4	Q14679	1199 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM204A-208	ENST00000487269	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM204A-208	ENST00000487269	CHST3	Q7LGC8	479 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM204A-208	ENST00000487269	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM204A-208	ENST00000487269	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM204A-208	ENST00000487269	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM204A-208	ENST00000487269	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM204A-208	ENST00000487269	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM204A-208	ENST00000487269	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
FAM204A-208	ENST00000487269	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
FAM204A-208	ENST00000487269	CFB	P00751	764 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM204A-208	ENST00000487269	NT5C2	P49902	561 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM204A-208	ENST00000487269	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
FAM204A-208	ENST00000487269	ADGRE1	Q14246	886 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM204A-208	ENST00000487269	IL31RA	Q8NI17	732 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM204A-208	ENST00000487269	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
FAM204A-208	ENST00000487269	MTMR8	Q96EF0	704 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM204A-208	ENST00000487269	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
FAM204A-208	ENST00000487269	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM204A-208	ENST00000487269	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM204A-208	ENST00000487269	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
FAM204A-208	ENST00000487269	SCN5A	Q14524	2016 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAM204A-208	ENST00000487269	SORBS3	O60504	671 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAM204A-208	ENST00000487269	MMP3	P08254	477 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAM204A-208	ENST00000487269	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
FAM204A-208	ENST00000487269	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		13.87	□□□□□ -0.19

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms