RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474882.2

MYCBP2-205, Transcript of MYC binding protein 2, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene MYCBP2, Length 393 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MYCBP2-205	ENST00000474882	LAPTM5	Q13571	262 aa		5	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		5	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		5	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	SLC51A	Q86UW1	340 aa		5	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		5	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		5	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	NAT16	Q8N8M0	369 aa		5	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		5	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	WNK4	Q96J92	1243 aa		5	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	ALG1	Q9BT22	464 aa		5	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		5	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		5	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		5	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		5	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882		M0R2C6	588 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	MYO1B	O43795	1136 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	TBC1D8	O95759	1140 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	CKM	P06732	381 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	STAT4	Q14765	748 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	KIF18B	Q86Y91	864 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	CEP89	Q96ST8	783 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	4.99	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	C7orf72	A4D263	438 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	CBX4	O00257	560 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	WNT9A	O14904	365 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	GPR39	O43194	453 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	BRINP1	O60477	761 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	SOD2	P04179	222 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	BPI	P17213	487 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	GUCY2F	P51841	1108 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	PRKCQ	Q04759	706 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	AOC3	Q16853	763 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	ODR4	Q5SWX8	454 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	LCE3B	Q5TA77	95 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	ASB11	Q8WXH4	323 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	USP7	Q93009	1102 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	TTC1	Q99614	292 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	IPPK	Q9H8X2	491 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	VAV3	Q9UKW4	847 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	TRAF5	O00463	557 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	NEMP1	O14524	444 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	NPHS1	O60500	1241 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	F2	P00734	622 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	GRK2	P25098	689 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	GRK3	P35626	688 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	BCL6	P41182	706 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	SCNN1B	P51168	640 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	LSAMP	Q13449	338 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	TMEM177	Q53S58	311 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	NXPE1	Q8N323	547 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	DPF3	Q92784	378 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	FBXW5	Q969U6	566 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	CDIP1	Q9H305	208 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	IFT22	Q9H7X7	185 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MYCBP2-205	ENST00000474882	CCDC66	A2RUB6	948 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	ZEB2	O60315	1214 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	KATNA1	O75449	491 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	TGFB1	P01137	390 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	PYGM	P11217	842 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	ID4	P47928	161 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	DNM2	P50570	870 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	GTF2A2	P52657	109 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	DSG1	Q02413	1049 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	IKZF1	Q13422	519 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	MSMP	Q1L6U9	139 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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