RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474266.1

RPS6KA3-204, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A3, human

TSL 3

Gene RPS6KA3, Length 930 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS6KA3-204	ENST00000474266	MCM3AP	O60318	1980 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RPS6KA3-204	ENST00000474266	ZBBX	A8MT70	800 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RPS6KA3-204	ENST00000474266	ORC4	O43929	436 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RPS6KA3-204	ENST00000474266	B4GALT4	O60513	344 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RPS6KA3-204	ENST00000474266	CD4	P01730	458 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RPS6KA3-204	ENST00000474266	PDE1A	P54750	535 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RPS6KA3-204	ENST00000474266	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RPS6KA3-204	ENST00000474266	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RPS6KA3-204	ENST00000474266	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RPS6KA3-204	ENST00000474266	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RPS6KA3-204	ENST00000474266	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RPS6KA3-204	ENST00000474266	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RPS6KA3-204	ENST00000474266	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RPS6KA3-204	ENST00000474266	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RPS6KA3-204	ENST00000474266	GRIN2D	O15399	1336 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	PDE4D	Q08499	809 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	CAMK2B	Q13554	666 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	SCLY	Q96I15	445 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	LNPK	Q9C0E8	428 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	CYP2C9	P11712	490 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	RABGGTB	P53611	331 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	NKX3-2	P78367	333 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	ALX1	Q15699	326 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	RAB30	Q15771	203 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	USH1G	Q495M9	461 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	RASIP1	Q5U651	963 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	OXER1	Q8TDS5	423 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	HERVK_113	Q902F9	699 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266		Q9Y3F1	56 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	PDHB	P11177	359 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	CPT1A	P50416	773 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	PPP2R5B	Q15173	497 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	CPVL	Q9H3G5	476 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	TNKS	O95271	1327 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	FGR	P09769	529 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	MYOG	P15173	224 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	NOV	P48745	357 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	ZNF543	Q08ER8	600 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	COPS5	Q92905	334 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	13.74	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	RAD50	Q92878	1312 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	ADGRE1	Q14246	886 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	MORC4	Q8TE76	937 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	ESR2	Q92731	530 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	NOD1	Q9Y239	953 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	MYO9B	Q13459	2157 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	NEDD4	P46934	1319 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	ZNF213	O14771	459 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	EMP3	P54852	163 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RPS6KA3-204	ENST00000474266	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21

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