RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 CUEDC2Q9H467 287 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 MAGEF1Q9HAY2 307 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 KCNMB3Q9NPA1 279 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 HCSTQ9UBK5 93 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 TMX2Q9Y320 296 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 WDR90Q96KV7 1748 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 PHF20L1A8MW92 1017 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM232C9JQI7 657 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 PIK3CDO00329 1044 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 ARHGAP33O14559 1287 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 SLC26A4O43511 780 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 PPP1R37O75864 691 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 GDF11O95390 407 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 GH2P01242 217 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 PLCG1P19174 1290 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 CIITAP33076 1130 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 SLC16A2P36021 539 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 AFMP43652 599 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 GSDMDP57764 484 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 PDIA5Q14554 519 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 NR1I3Q14994 352 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 UBE2SQ16763 222 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 FOXR2Q6PJQ5 311 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 NYAP1Q6ZVC0 841 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 ADSSL1Q8N142 457 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 ACER1Q8TDN7 264 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 CSRNP1Q96S65 589 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 C7orf25Q9BPX7 421 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 MTFR1LQ9H019 292 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 GLT8D2Q9H1C3 349 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 VAT1LQ9HCJ6 419 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 PIM2Q9P1W9 311 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 DACH1Q9UI36 760 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 MTMR7Q9Y216 660 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 PTPRFP10586 1907 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 LCTP09848 1927 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 WDR81Q562E7 1941 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 A0A0G2JMZ2 1700 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 SSC5DA1L4H1 1573 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 SHTN1A0MZ66 631 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 FZD9O00144 591 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 WNT10BO00744 389 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 EGFRP00533 1210 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 RPN1P04843 607 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 CYP3A4P08684 503 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 BMP3P12645 472 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 RPS12P25398 132 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 SREBF1P36956 1147 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 STAT6P42226 847 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 SLC1A4P43007 532 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 USP11P51784 963 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 PLCB2Q00722 1185 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 AP3B2Q13367 1082 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 DLGAP5Q15398 846 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC96Q2M329 555 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 LETM2Q2VYF4 491 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 SYDE2Q5VT97 1194 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 MCTP2Q6DN12 878 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 TTI2Q6NXR4 508 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 KCNK18Q7Z418 384 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 CABP7Q86V35 215 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC150Q8NCX0 1101 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 ETNPPLQ8TBG4 499 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 STAMQ92783 540 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 CUL5Q93034 780 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 NUDT12Q9BQG2 462 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM9Q9C026 710 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 BLZF1Q9H2G9 400 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 STK17AQ9UEE5 414 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 RWDD2AQ9UIY3 292 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 PRR12Q9ULL5 1215 aa6.37□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms