RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 NARFQ9UHQ1 456 aa8.28□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa8.28□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 CENPFP49454 3210 aa8.28□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 FZD9O00144 591 aa8.27□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 BIN1O00499 593 aa8.27□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 ZNF853P0CG23 659 aa8.27□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 CANXP27824 592 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 RARSP54136 660 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 ALDH1L2Q3SY69 923 aa8.27□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 DNAJC10Q8IXB1 793 aa8.27□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 FBF1Q8TES7 1133 aa8.27□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 AKAP2Q9Y2D5 859 aa8.27□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa8.27□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 ERVV-2B6SEH9 535 aa8.26□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 ENC1O14682 589 aa8.26□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 CELF2O95319 508 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 BMP6P22004 513 aa8.26□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 FBLN7Q53RD9 439 aa8.26□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 LCE5AQ5TCM9 118 aa8.26□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 PRR5LQ6MZQ0 368 aa8.26□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 TOP6BLQ8N6T0 577 aa8.26□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 SLC17A8Q8NDX2 589 aa8.26□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 EXOC6Q8TAG9 804 aa8.26□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 HRASLS5Q96KN8 279 aa8.26□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa8.26□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 PPM1HQ9ULR3 514 aa8.26□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 COL15A1P39059 1388 aa8.25□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 TMEM265A0A087WTH1 108 aa8.25□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 CD96P40200 585 aa8.25□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 PLCB3Q01970 1234 aa8.25□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 TBC1D9BQ66K14 1250 aa8.25□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 SCARA3Q6AZY7 606 aa8.25□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP8.25□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 GPC2Q8N158 579 aa8.25□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 HHIPL1Q96JK4 782 aa8.25□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 CRBNQ96SW2 442 aa8.25□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 BRIP1Q9BX63 1249 aa8.25□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa8.25□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 SNX11Q9Y5W9 270 aa8.25□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 BCORQ6W2J9 1755 aa8.25□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP8.24□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 PLIN1O60240 522 aa8.24□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 SRGNP10124 158 aa8.24□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 GSTT1P30711 240 aa8.24□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 KCNA1Q09470 495 aa8.24□□□□□ -1.09
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CCL20-202ENST00000409189 DLK2Q6UY11 383 aa8.24□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 SYNE4Q8N205 404 aa8.24□□□□□ -1.09
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CCL20-202ENST00000409189 BABAM1Q9NWV8 329 aa8.24□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 RNF186Q9NXI6 227 aa8.24□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 MRC1P22897 1456 aa8.24□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa8.23□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 KDM3BQ7LBC6 1761 aa8.23□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 PAGE1O75459 146 aa8.23□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 BCAR3O75815 825 aa8.23□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 MAPK1P28482 360 aa8.23□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 PDE6BP35913 854 aa8.23□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 NOGQ13253 232 aa8.23□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 CCDC93Q567U6 631 aa8.23□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa8.23□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 STYK1Q6J9G0 422 aa8.23□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 LRRN4CLQ8ND94 238 aa8.23□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa8.23□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 CEP44Q9C0F1 390 aa8.23□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 AKAP11Q9UKA4 1901 aa8.23□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 SNED1Q8TER0 1413 aa8.22□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 UNC80Q8N2C7 3258 aa8.22□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 AMOTQ4VCS5 1084 aa8.22□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 PPM1JQ5JR12 505 aa8.22□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 C20orf194Q5TEA3 1177 aa8.22□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 UBE3DQ7Z6J8 389 aa8.22□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 SPACA3Q8IXA5 215 aa8.22□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 OSBPL7Q9BZF2 842 aa8.22□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 ZNF408Q9H9D4 720 aa8.22□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 SAGE1Q9NXZ1 904 aa8.22□□□□□ -1.09
CCL20-202ENST00000409189 GNAT3A8MTJ3 354 aa8.21□□□□□ -1.1
CCL20-202ENST00000409189 CHL1O00533 1208 aa8.21□□□□□ -1.1
CCL20-202ENST00000409189 FANCGO15287 622 aa8.21□□□□□ -1.1
CCL20-202ENST00000409189 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CCL20-202ENST00000409189 IARSP41252 1262 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CCL20-202ENST00000409189 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
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