RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393389.7

ANKRD42-202, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 4,066 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-202ENST00000393389 KRT71Q3SY84 523 aa9.57□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 CCDC174Q6PII3 467 aa9.57□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 MICALCLQ6ZW33 695 aa9.57□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 CPXCR1Q8N123 301 aa9.57□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 CCDC155Q8N6L0 562 aa9.57□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 WDR19Q8NEZ3 1342 aa9.57□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 PHF20Q9BVI0 1012 aa9.57□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 AP1M1Q9BXS5 423 aa9.57□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 CDHR2Q9BYE9 1310 aa9.57□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 NFU1Q9UMS0 254 aa9.57□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa9.57□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 VPS41P49754 854 aa9.57□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 ERVK-24P63145 666 aa9.57□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 CETN1Q12798 172 aa9.57□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 PDCLQ13371 301 aa9.57□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 GIMAP7Q8NHV1 300 aa9.57□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 IL17RAQ96F46 866 aa9.57□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa9.57□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa9.57□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 LRRC53A6NM62 1247 aa9.57□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 USP17L15C9J2P7 530 aa9.57□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 USP17L13C9JLJ4 530 aa9.57□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 USP17L11C9JVI0 530 aa9.57□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 USP17L18D6R9N7 530 aa9.57□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 USP17L22D6RA61 530 aa9.57□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 USP17L17D6RBQ6 530 aa9.57□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 USP17L19D6RCP7 530 aa9.57□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 USP17L20D6RJB6 530 aa9.57□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 SORBS3O60504 671 aa9.57□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 SASH3O75995 380 aa9.57□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 CDK8P49336 464 aa9.57□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 USP17L24Q0WX57 530 aa9.57□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 USP17L6PQ6QN14 398 aa9.57□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 CCDC121Q6ZUS5 278 aa9.57□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 EXOC4Q96A65 974 aa9.57□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 DNM3Q9UQ16 869 aa9.57□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 AGLP35573 1532 aa9.57□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 WNT7AO00755 349 aa9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 NR2F2P24468 414 aa9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 CYP2C19P33261 490 aa9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 PPFIA1Q13136 1202 aa9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 MSL1Q68DK7 614 aa9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 MGARPQ8TDB4 240 aa9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 XDHP47989 1333 aa9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 BACH1O14867 736 aa9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 VIMP08670 466 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 EPB41P11171 864 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 TROAPQ12815 778 aa9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 PAK2Q13177 524 aa9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 FAM196AQ6ZSG2 479 aa9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 DDX12PQ92771 950 aa9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 BICD1Q96G01 975 aa9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 CEP95Q96GE4 821 aa9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 MS4A14Q96JA4 679 aa9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 BRIP1Q9BX63 1249 aa9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 GOLPH3Q9H4A6 298 aa9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 KCNK9Q9NPC2 374 aa9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 CAPN7Q9Y6W3 813 aa9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 H3BQF6 201 aa9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 KRIT1O00522 736 aa9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 LRRN2O75325 713 aa9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 TNFAIP3P21580 790 aa9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 E9PMD0 336 aa9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 GDF11O95390 407 aa9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 HARSP12081 509 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 EEF2P13639 858 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 TCP1P17987 556 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 ADCY1Q08828 1119 aa9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 TXNRD3Q86VQ6 643 aa9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 DNAAF5Q86Y56 855 aa9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 MED4Q9NPJ6 270 aa9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 FOXP2O15409 715 aa9.55□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 EXOC3O60645 756 aa9.55□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 ITPK1Q13572 414 aa9.55□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 C3orf67Q6ZVT6 689 aa9.55□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 SH2D3CQ8N5H7 860 aa9.55□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 LACRTQ9GZZ8 138 aa9.55□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 PEAK1Q9H792 1746 aa9.55□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 ATP8B1O43520 1251 aa9.55□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 SPOPO43791 374 aa9.55□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 MAN2A1Q16706 1144 aa9.55□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 GRIPAP1Q4V328 841 aa9.55□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 CCDC50Q8IVM0 306 aa9.55□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF34Q8IZ26 560 aa9.55□□□□□ -0.88
ANKRD42-202ENST00000393389 LRRC1Q9BTT6 524 aa9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.2 ms