RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 ZNF263O14978 683 aa18.62■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 MOCS3O95396 460 aa18.62■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 KLK7P49862 253 aa18.62■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 FMNL3Q8IVF7 1028 aa18.62■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa18.62■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa18.62■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 TNKSO95271 1327 aa18.62■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 A0A1B0GUA9 196 aa18.61■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 ERCC3P19447 782 aa18.61■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 HPDP32754 393 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 CAVIN4Q5BKX8 364 aa18.61■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 FERMT2Q96AC1 680 aa18.61■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 OSBPL7Q9BZF2 842 aa18.61■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 BCORQ6W2J9 1755 aa18.61■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 B4DLN1 442 aa18.61■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 H7C1D1 291 aa18.61■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 DNM1LO00429 736 aa18.61■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 GUCY2FP51841 1108 aa18.61■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 EGFL6Q8IUX8 553 aa18.61■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 IFT81Q8WYA0 676 aa18.61■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 PIK3R5Q8WYR1 880 aa18.61■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 TSGA10Q9BZW7 698 aa18.61■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 HYOU1Q9Y4L1 999 aa18.61■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 ZNF804BA4D1E1 1349 aa18.61■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 GLI1P08151 1106 aa18.6■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 PMS1P54277 932 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa18.6■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 CEP120Q8N960 986 aa18.6■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 FANCBQ8NB91 859 aa18.6■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 ZNF384Q8TF68 577 aa18.6■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 SHISA4Q96DD7 197 aa18.6■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 TTYH3Q9C0H2 523 aa18.6■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 RTN2O75298 545 aa18.6■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 TCP1P17987 556 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 SPA17Q15506 151 aa18.6■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 ZNF174Q15697 407 aa18.6■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 CCDC50Q8IVM0 306 aa18.6■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 NCK2O43639 380 aa18.6■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 PDXDC2PQ6P474 469 aa18.6■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 TLDC1Q6P9B6 456 aa18.6■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 CLEC4GQ6UXB4 293 aa18.6■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 SH2D4AQ9H788 454 aa18.6■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 OPLAHO14841 1288 aa18.59■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 RPN1P04843 607 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 RPSAP08865 295 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 PRLRP16471 622 aa18.59■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 UBE4AQ14139 1066 aa18.59■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 NAA25Q14CX7 972 aa18.59■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa18.59■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 SLC51AQ86UW1 340 aa18.59■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 IFT20Q8IY31 132 aa18.59■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 C8orf37Q96NL8 207 aa18.59■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa18.59■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 TIAM2Q8IVF5 1701 aa18.59■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 RASSF10A6NK89 507 aa18.59■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 PAFAH1B1P43034 410 aa18.59■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 BARGINQ6ZT62 677 aa18.59■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 MAGEC3Q8TD91 643 aa18.59■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 ESR2Q92731 530 aa18.59■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 CCDC42Q96M95 316 aa18.59■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 USO1O60763 962 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 GUCY2DQ02846 1103 aa18.58■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 PAK2Q13177 524 aa18.58■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 EEF2KMTQ96G04 330 aa18.58■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 EPB41L5Q9HCM4 733 aa18.58■□□□□ 0.57
GDE1-201ENST00000353258 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
GDE1-201ENST00000353258 ATP2C2O75185 946 aa18.58■□□□□ 0.56
GDE1-201ENST00000353258 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
GDE1-201ENST00000353258 SRGNP10124 158 aa18.58■□□□□ 0.56
GDE1-201ENST00000353258 DNM2P50570 870 aa18.58■□□□□ 0.56
GDE1-201ENST00000353258 LAMB2P55268 1798 aa18.58■□□□□ 0.56
GDE1-201ENST00000353258 ZBED6P86452 979 aa18.58■□□□□ 0.56
GDE1-201ENST00000353258 MAATS1Q7Z4T9 603 aa18.58■□□□□ 0.56
GDE1-201ENST00000353258 CD302Q8IX05 232 aa18.58■□□□□ 0.56
GDE1-201ENST00000353258 RREB1Q92766 1687 aa18.58■□□□□ 0.56
GDE1-201ENST00000353258 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
GDE1-201ENST00000353258 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
GDE1-201ENST00000353258 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
GDE1-201ENST00000353258 QPCTQ16769 361 aa18.57■□□□□ 0.56
GDE1-201ENST00000353258 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
GDE1-201ENST00000353258 MS4A14Q96JA4 679 aa18.57■□□□□ 0.56
GDE1-201ENST00000353258 TRIM47Q96LD4 638 aa18.57■□□□□ 0.56
GDE1-201ENST00000353258 GDF3Q9NR23 364 aa18.57■□□□□ 0.56
GDE1-201ENST00000353258 RMND1Q9NWS8 449 aa18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms