RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324444.7

SYNE4-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SYNE4, Length 1,354 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-201ENST00000324444 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 CHAMP1Q96JM3 812 aa20.52■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 TMEM106CQ9BVX2 250 aa20.52■□□□□ 0.88
SYNE4-201ENST00000324444 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 POLR2MP0CAP2 368 aa20.51■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa20.51■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 REPS2Q8NFH8 660 aa20.51■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 RAET1EQ8TD07 263 aa20.51■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 ATG4CQ96DT6 458 aa20.51■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa20.51■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF536O15090 1300 aa20.5■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 A0A1W2PQ27 194 aa20.5■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 A0A1W2PQ64 194 aa20.5■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 A0A1W2PQD8 194 aa20.5■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 SNAP25P60880 206 aa20.5■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 PRKCZQ05513 592 aa20.5■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa20.5■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 POTEEQ6S8J3 1075 aa20.5■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 FERMT2Q96AC1 680 aa20.5■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 MYH15Q9Y2K3 1946 aa20.49■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 CUTAO60888 179 aa20.49■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 ATP2B1P20020 1258 aa20.49■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 COPB2P35606 906 aa20.49■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 USP11P51784 963 aa20.49■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 PTPAQ15257 358 aa20.49■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 RASGRP4Q8TDF6 673 aa20.49■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa20.49■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 MGAMO43451 1857 aa20.49■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 EN2P19622 333 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 FAM110CQ1W6H9 321 aa20.48■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 INF2Q27J81 1249 aa20.48■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 CPXCR1Q8N123 301 aa20.48■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 TBCKQ8TEA7 893 aa20.48■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 TEX13BQ9BXU2 312 aa20.48■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 MEIS2O14770 477 aa20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 GRK4P32298 578 aa20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 HERVK_113P62684 666 aa20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 GHRHRQ02643 423 aa20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 PPP4R3AQ6IN85 833 aa20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 MOXD1Q6UVY6 613 aa20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 PCDHA7Q9UN72 937 aa20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 GABRQQ9UN88 632 aa20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 ALAS1P13196 640 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 AGBL1Q96MI9 1066 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 ANO3Q9BYT9 981 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 FBXO40Q9UH90 709 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 CFBP00751 764 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 PTPREP23469 700 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 CMA1P23946 247 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 MCM7P33993 719 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 PRPHP41219 470 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 FLT3LGP49771 235 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF174Q15697 407 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 UBE2SQ16763 222 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 LETM2Q2VYF4 491 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 USP17L6PQ6QN14 398 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 PGBD1Q96JS3 809 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 TMEM260Q9NX78 707 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-201ENST00000324444 FAM205CA6NFA0 338 aa20.45■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 STAT3P40763 770 aa20.45■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 HSD17B4P51659 736 aa20.45■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 PTGDRQ13258 359 aa20.45■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 TMEM132BQ14DG7 1078 aa20.45■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 MTFR1Q15390 333 aa20.45■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 CHST13Q8NET6 341 aa20.45■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 GPT2Q8TD30 523 aa20.45■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 TRERF1Q96PN7 1200 aa20.45■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 FAM13BQ9NYF5 915 aa20.45■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 OPLAHO14841 1288 aa20.44■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 NEMFO60524 1076 aa20.44■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 CNMDO75829 334 aa20.44■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 SLC25A27O95847 323 aa20.44■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
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