RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292211.4

UBE2Q1-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2Q1, Length 3,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-201ENST00000292211 CDKAL1Q5VV42 579 aa23.43■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 TC2NQ8N9U0 490 aa23.43■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 IDI2Q9BXS1 227 aa23.43■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 RAB34Q9BZG1 259 aa23.43■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 RIC8AQ9NPQ8 531 aa23.43■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 CEP83Q9Y592 693 aa23.43■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 RBL2Q08999 1139 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 DYMQ7RTS9 669 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 DEF6Q9H4E7 631 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 VEZTQ9HBM0 779 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 KBTBD4Q9NVX7 518 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 YDJCA8MPS7 323 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 F5H6K3 240 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 ARHGAP6O43182 974 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 TPM1P09493 284 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 IDEP14735 1019 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 KLRC3Q07444 240 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 LRRN4CLQ8ND94 238 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 SNX29Q8TEQ0 813 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 DNAI1Q9UI46 699 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 SCN9AQ15858 1988 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 SUPT20HQ8NEM7 779 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 HPS3Q969F9 1004 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 DESI2Q9BSY9 194 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 CCP110O43303 1012 aa23.41■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 BAG6P46379 1132 aa23.41■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 AMPD3Q01432 767 aa23.41■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 KRT79Q5XKE5 535 aa23.41■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 TMEM179Q6ZVK1 233 aa23.41■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 CCDC172P0C7W6 258 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 GUCY2CP25092 1073 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 OGFOD1Q8N543 542 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 TTLL6Q8N841 843 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 TRIM9Q9C026 710 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 MCM6Q14566 821 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 SV2BQ7L1I2 683 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZSCAN12O43309 604 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 CASP14P31944 242 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 PMS1P54277 932 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 UBXN1Q04323 297 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 SPAG1Q07617 926 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 PACS2Q86VP3 889 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 ADSSL1Q8N142 457 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 NRXN2Q9P2S2 1712 aa23.39■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 COPB1P53618 953 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 TCP11X2Q5H9J9 407 aa23.39■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 C7orf43Q8WVR3 580 aa23.39■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 MRIQ9BWK5 157 aa23.39■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 NYAP2Q9P242 653 aa23.39■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 FOCADQ5VW36 1801 aa23.39■■□□□ 1.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 FCER1AP12319 257 aa23.39■■□□□ 1.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 TXLNBQ8N3L3 684 aa23.39■■□□□ 1.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa23.39■■□□□ 1.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 KLRC4O43908 158 aa23.38■■□□□ 1.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 CLCN6P51797 869 aa23.38■■□□□ 1.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 CUEDC2Q9H467 287 aa23.38■■□□□ 1.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 SLC39A2Q9NP94 309 aa23.38■■□□□ 1.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 PLA2G4AP47712 749 aa23.38■■□□□ 1.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 DLGAP5Q15398 846 aa23.38■■□□□ 1.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa23.38■■□□□ 1.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 STX10O60499 249 aa23.38■■□□□ 1.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 STK4Q13043 487 aa23.38■■□□□ 1.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 MTF1Q14872 753 aa23.38■■□□□ 1.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 MTMR9Q96QG7 549 aa23.38■■□□□ 1.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 NUDT12Q9BQG2 462 aa23.38■■□□□ 1.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 EPC1Q9H2F5 836 aa23.38■■□□□ 1.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 MYH4Q9Y623 1939 aa23.38■■□□□ 1.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 H7C1D1 291 aa23.37■■□□□ 1.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 NDUFB10O96000 172 aa23.37■■□□□ 1.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 KCNB1Q14721 858 aa23.37■■□□□ 1.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa23.37■■□□□ 1.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 PPP1R18Q6NYC8 613 aa23.37■■□□□ 1.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa23.37■■□□□ 1.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 DCAF4Q8WV16 495 aa23.37■■□□□ 1.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 PCDHA12Q9UN75 941 aa23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms