RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP23.46■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 L3MBTL1Q9Y468 752 aa23.46■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa23.46■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 KLHL33A6NCF5 533 aa23.46■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 RAD51CO43502 376 aa23.46■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa23.46■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 MCM7P33993 719 aa23.46■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 RASSF7Q02833 373 aa23.46■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 ZNF844Q08AG5 666 aa23.46■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
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ODC1-201ENST00000234111 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
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ODC1-201ENST00000234111 ZBTB3Q9H5J0 574 aa23.46■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 A0A1W2PQJ5 194 aa23.46■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 H0YGN5 161 aa23.46■■□□□ 1.35
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ODC1-201ENST00000234111 TCP11Q8WWU5 503 aa23.46■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 KDM4CQ9H3R0 1056 aa23.46■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 SLC39A2Q9NP94 309 aa23.46■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 NFS1Q9Y697 457 aa23.46■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa23.45■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 PPIP5K2O43314 1243 aa23.45■■□□□ 1.34
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ODC1-201ENST00000234111 ESCO1Q5FWF5 840 aa23.45■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 LRIG3Q6UXM1 1119 aa23.45■■□□□ 1.34
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ODC1-201ENST00000234111 NOX5Q96PH1 765 aa23.45■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 DCDC2CA8MYV0 355 aa23.45■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 NBPF26B4DH59 902 aa23.45■■□□□ 1.34
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ODC1-201ENST00000234111 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
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ODC1-201ENST00000234111 CCDC155Q8N6L0 562 aa23.45■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 BATF3Q9NR55 127 aa23.45■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 C15orf41Q9Y2V0 281 aa23.45■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa23.45■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 GHRP10912 638 aa23.44■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 TAX1BP1Q86VP1 789 aa23.44■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 KLHL7Q8IXQ5 586 aa23.44■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 TNFRSF25Q93038 417 aa23.44■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 TRPC6Q9Y210 931 aa23.44■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 AXIN2Q9Y2T1 843 aa23.44■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa23.44■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 LCA5LO95447 670 aa23.44■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 ANP32DO95626 131 aa23.44■■□□□ 1.34
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ODC1-201ENST00000234111 ALX1Q15699 326 aa23.44■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
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ODC1-201ENST00000234111 FIGNQ5HY92 759 aa23.44■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 P3H4Q92791 437 aa23.44■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 V9GY48 417 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 MBD4O95243 580 aa23.43■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 FTCDO95954 541 aa23.43■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 NPY5RQ15761 445 aa23.43■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 ARMC9Q7Z3E5 817 aa23.43■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 ERGIC2Q96RQ1 377 aa23.43■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 ORAI2Q96SN7 254 aa23.43■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 KLRC4O43908 158 aa23.43■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 DRD4P21917 467 aa23.43■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 ECHS1P30084 290 aa23.43■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 SLC1A4P43007 532 aa23.43■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 AP1ARQ63HQ0 302 aa23.43■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 PARD3BQ8TEW8 1205 aa23.43■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 ARMT1Q9H993 441 aa23.43■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 RNF14Q9UBS8 474 aa23.43■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 TJP1Q07157 1748 aa23.42■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 ENO4A6NNW6 628 aa23.42■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 F8W031 263 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 TRIM37O94972 964 aa23.42■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 PAEPP09466 180 aa23.42■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 ERVK-9P63128 1117 aa23.42■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa23.42■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 SPAG5Q96R06 1193 aa23.42■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 MYH6P13533 1939 aa23.42■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 PRKAB2O43741 272 aa23.42■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 TATP17735 454 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 BIRC3Q13489 604 aa23.42■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 CCDC63Q8NA47 563 aa23.42■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 PLIN2Q99541 437 aa23.42■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 SH3GL3Q99963 347 aa23.42■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 TSKSQ9UJT2 592 aa23.42■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 PJA2O43164 708 aa23.41■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 PLEKHA8P1O95397 391 aa23.41■■□□□ 1.34
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