RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arhgef25Q9CWR0 618 aa13.21□□□□□ -0.29
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cspp1B2RX88 1205 aa13.21□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rfpl4bJ3QPR6 266 aa13.21□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ago4Q8CJF8 861 aa13.21□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam83aQ8K2P2 436 aa13.21□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Stard7Q8R1R3 373 aa13.21□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dnajc19Q9CQV7 116 aa13.21□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmx2Q9D710 295 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 SerhlQ9EPB5 311 aa13.21□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 MyocO70624 490 aa13.2□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cep135Q6P5D4 1140 aa13.2□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 P2ry10Q8BFU7 328 aa13.2□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Senp7Q8BUH8 1037 aa13.2□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tesk2Q8VCT9 570 aa13.2□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Anapc4Q91W96 807 aa13.2□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 DaglbQ91WC9 669 aa13.2□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tab2Q99K90 693 aa13.2□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vnn1Q9Z0K8 512 aa13.2□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc2a13Q3UHK1 637 aa13.2□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kcnj11Q61743 390 aa13.2□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Znf618Q80YY7 953 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q91WD4 421 aa13.2□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Krt18P05784 423 aa13.2□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 2310002L09RikQ9D7L5 217 aa13.2□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ngly1Q9JI78 651 aa13.2□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Serpina16D3Z660 418 aa13.19□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc4a9E9PUP3 929 aa13.19□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm10392Q3V3I3 114 aa13.19□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pnma5Q5DTT8 618 aa13.19□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 IrgqQ8VIM9 583 aa13.19□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pabpc6Q9D4E6 643 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mmel1Q9JLI3 765 aa13.19□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cabp5Q9JLK3 173 aa13.19□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ankrd13cQ3UX43 541 aa13.19□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 PdgfdQ925I7 370 aa13.19□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Disp2Q8CIP5 1345 aa13.19□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cxcl9P18340 126 aa13.19□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccnd3P30282 292 aa13.19□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gabpb2P81069 414 aa13.19□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ssrp1Q08943 708 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Meis1Q60954 390 aa13.19□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lrrc24Q8BHA1 521 aa13.19□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ddx19bQ8BZY3 494 aa13.19□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tfr2Q9JKX3 798 aa13.19□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fxr2Q9WVR4 673 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Eif2ak1Q9Z2R9 619 aa13.19□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Atp8b5A3FIN4 1183 aa13.18□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm5624F6ZZG8 207 aa13.18□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mcm6P97311 821 aa13.18□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Krt9Q6RHW0 743 aa13.18□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Atg4cQ811C2 458 aa13.18□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mx2Q9WVP9 655 aa13.18□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 NynrinQ5DTZ0 1840 aa13.18□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 OsbpQ3B7Z2 805 aa13.18□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mrvi1Q9WUX5 899 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 SisF8VQM5 1818 aa13.18□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 AW822073A0A0N4SUK1 652 aa13.17□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mpp3O88910 568 aa13.17□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 PpardP35396 440 aa13.17□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Stim1P70302 685 aa13.17□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam83hQ148V8 1209 aa13.17□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Wdr70Q3TWF6 657 aa13.17□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 March6Q6ZQ89 909 aa13.17□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 RubcnQ80U62 956 aa13.17□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 F11Q91Y47 624 aa13.17□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cnpy2Q9QXT0 182 aa13.17□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Megf6Q80V70 1572 aa13.17□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 HunkO88866 714 aa13.17□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pik3r1P26450 724 aa13.17□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cfap157Q0VFX2 523 aa13.17□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Aggf1Q7TN31 711 aa13.17□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ano10Q8BH79 659 aa13.17□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rhobtb2Q91V93 728 aa13.17□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Polr2aP08775 1970 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Myh7bA2AQP0 1941 aa13.17□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Serpinb2P12388 415 aa13.17□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Setd4P58467 439 aa13.17□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccdc105Q9D4K7 499 aa13.17□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Extl2Q9ES89 330 aa13.17□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 BcamQ9R069 622 aa13.17□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zscan25B2RX31 543 aa13.16□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rexo5D3YW29 759 aa13.16□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 ArP19091 899 aa13.16□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc7a1Q09143 622 aa13.16□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Psg29Q3URN6 468 aa13.16□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc4a7Q8BTY2 1034 aa13.16□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Syt10Q9R0N4 523 aa13.16□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn2r71L7N2D8 855 aa13.16□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mettl14Q3UIK4 456 aa13.16□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trak2Q6P9N8 913 aa13.16□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Camsap3Q80VC9 1252 aa13.16□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 GlmnQ8BZM1 596 aa13.16□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 TicrrQ8BQ33 1889 aa13.16□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm5737A0A140LI11 423 aa13.16□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Spocd1B1ASB6 936 aa13.16□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Znf652Q5DU09 608 aa13.16□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cnnm4Q69ZF7 771 aa13.16□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccdc113Q8C5T8 377 aa13.16□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 E2f4Q8R0K9 410 aa13.16□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kcnh7Q9ER47 1195 aa13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.2 ms