RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636753.1

RYR3-222, Transcript of ryanodine receptor 3, human

TSL 5

Gene RYR3, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RYR3-222	ENST00000636753	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
RYR3-222	ENST00000636753	TK2	O00142	265 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RYR3-222	ENST00000636753	HR	O43593	1189 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RYR3-222	ENST00000636753	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
RYR3-222	ENST00000636753	PSEN1	P49768	467 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RYR3-222	ENST00000636753	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RYR3-222	ENST00000636753	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	5.09	□□□□□ -1.59
RYR3-222	ENST00000636753	ARHGAP33	O14559	1287 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RYR3-222	ENST00000636753	ZNF787	Q6DD87	383 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RYR3-222	ENST00000636753	PTPN5	P54829	565 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RYR3-222	ENST00000636753	STAC3	Q96MF2	364 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RYR3-222	ENST00000636753	GFRA3	O60609	400 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RYR3-222	ENST00000636753	CABP2	Q9NPB3	220 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RYR3-222	ENST00000636753	LHX6	Q9UPM6	363 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RYR3-222	ENST00000636753	MICALL2	Q8IY33	904 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RYR3-222	ENST00000636753	NUDT7	P0C024	238 aa		5	□□□□□ -1.61
RYR3-222	ENST00000636753	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
RYR3-222	ENST00000636753	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RYR3-222	ENST00000636753	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RYR3-222	ENST00000636753	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RYR3-222	ENST00000636753	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RYR3-222	ENST00000636753	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RYR3-222	ENST00000636753	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RYR3-222	ENST00000636753	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RYR3-222	ENST00000636753	PSEN2	P49810	448 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RYR3-222	ENST00000636753	GSE1	Q14687	1217 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RYR3-222	ENST00000636753	STK17A	Q9UEE5	414 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RYR3-222	ENST00000636753	SLC34A2	O95436	690 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RYR3-222	ENST00000636753	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RYR3-222	ENST00000636753	TREML4	Q6UXN2	200 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RYR3-222	ENST00000636753	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RYR3-222	ENST00000636753	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RYR3-222	ENST00000636753	WNT2B	Q93097	391 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RYR3-222	ENST00000636753	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RYR3-222	ENST00000636753	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RYR3-222	ENST00000636753	KCNH8	Q96L42	1107 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RYR3-222	ENST00000636753	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RYR3-222	ENST00000636753	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RYR3-222	ENST00000636753	KCNC4	Q03721	635 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RYR3-222	ENST00000636753	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RYR3-222	ENST00000636753	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RYR3-222	ENST00000636753	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RYR3-222	ENST00000636753	KIF3C	O14782	793 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RYR3-222	ENST00000636753	SOX12	O15370	315 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RYR3-222	ENST00000636753	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RYR3-222	ENST00000636753	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RYR3-222	ENST00000636753	KCNK17	Q96T54	332 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RYR3-222	ENST00000636753	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RYR3-222	ENST00000636753	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RYR3-222	ENST00000636753	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RYR3-222	ENST00000636753		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RYR3-222	ENST00000636753	C2orf72	A6NCS6	295 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RYR3-222	ENST00000636753	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RYR3-222	ENST00000636753	POTEC	B2RU33	542 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RYR3-222	ENST00000636753	WIPF1	O43516	503 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RYR3-222	ENST00000636753	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RYR3-222	ENST00000636753	WFS1	O76024	890 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RYR3-222	ENST00000636753	NBPF3	Q9H094	633 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RYR3-222	ENST00000636753	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RYR3-222	ENST00000636753	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RYR3-222	ENST00000636753	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RYR3-222	ENST00000636753	MYT1	Q01538	1121 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RYR3-222	ENST00000636753	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RYR3-222	ENST00000636753	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RYR3-222	ENST00000636753	DGAT1	O75907	488 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RYR3-222	ENST00000636753	KLHL34	Q8N239	644 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RYR3-222	ENST00000636753	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RYR3-222	ENST00000636753	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RYR3-222	ENST00000636753	PKDCC	Q504Y2	493 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RYR3-222	ENST00000636753	BCAM	P50895	628 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RYR3-222	ENST00000636753	TMC2	Q8TDI7	906 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RYR3-222	ENST00000636753	WBP1L	Q9NX94	342 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RYR3-222	ENST00000636753	PTPRE	P23469	700 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RYR3-222	ENST00000636753	NLRP6	P59044	892 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RYR3-222	ENST00000636753	TBC1D12	O60347	775 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RYR3-222	ENST00000636753	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RYR3-222	ENST00000636753	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RYR3-222	ENST00000636753	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RYR3-222	ENST00000636753	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RYR3-222	ENST00000636753	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RYR3-222	ENST00000636753	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RYR3-222	ENST00000636753	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RYR3-222	ENST00000636753	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RYR3-222	ENST00000636753	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RYR3-222	ENST00000636753	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RYR3-222	ENST00000636753	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RYR3-222	ENST00000636753	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RYR3-222	ENST00000636753	AAAS	Q9NRG9	546 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RYR3-222	ENST00000636753	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RYR3-222	ENST00000636753	FBXO3	Q9UK99	471 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RYR3-222	ENST00000636753	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RYR3-222	ENST00000636753	FOSB	P53539	338 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RYR3-222	ENST00000636753	PRR20E	P86478	221 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RYR3-222	ENST00000636753	PRR20C	P86479	221 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RYR3-222	ENST00000636753	PRR20D	P86480	221 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RYR3-222	ENST00000636753	PRR20B	P86481	221 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RYR3-222	ENST00000636753	PRR20A	P86496	221 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RYR3-222	ENST00000636753	XP32	Q5T750	250 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RYR3-222	ENST00000636753	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RYR3-222	ENST00000636753	TRIM41	Q8WV44	630 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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