RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636060.1

LIN28B-AS1-202, LIN28B antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene LIN28B-AS1, Length 548 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 RICTORQ6R327 1708 aa16.33■□□□□ 0.21
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 MTUS2Q5JR59 1369 aa16.33■□□□□ 0.2
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 MAP3K1Q13233 1512 aa16.32■□□□□ 0.2
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ARHGAP5Q13017 1502 aa16.31■□□□□ 0.2
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ADGRL1O94910 1474 aa16.29■□□□□ 0.2
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa16.28■□□□□ 0.2
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ITSN2Q9NZM3 1697 aa16.27■□□□□ 0.19
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ABCC1P33527 1531 aa16.26■□□□□ 0.19
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 RAPGEF3O95398 923 aa16.26■□□□□ 0.19
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa16.26■□□□□ 0.19
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa16.26■□□□□ 0.19
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa16.25■□□□□ 0.19
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 NCOA2Q15596 1464 aa16.25■□□□□ 0.19
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SCAPERQ9BY12 1400 aa16.25■□□□□ 0.19
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 POGZQ7Z3K3 1410 aa16.24■□□□□ 0.19
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 CCNB3Q8WWL7 1395 aa16.23■□□□□ 0.19
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa16.22■□□□□ 0.19
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa16.22■□□□□ 0.19
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 HECW2Q9P2P5 1572 aa16.21■□□□□ 0.19
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 KDM5CP41229 1560 aa16.21■□□□□ 0.18
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SYCP2Q9BX26 1530 aa16.19■□□□□ 0.18
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa16.18■□□□□ 0.18
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 FBXO41Q8TF61 875 aa16.18■□□□□ 0.18
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa16.17■□□□□ 0.18
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa16.17■□□□□ 0.18
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 MAGI2Q86UL8 1455 aa16.16■□□□□ 0.18
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa16.15■□□□□ 0.18
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 YEATS2Q9ULM3 1422 aa16.15■□□□□ 0.18
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa16.15■□□□□ 0.18
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 APLP2Q06481 763 aa16.14■□□□□ 0.17
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa16.13■□□□□ 0.17
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa16.13■□□□□ 0.17
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ABCA6Q8N139 1617 aa16.12■□□□□ 0.17
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa16.12■□□□□ 0.17
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 AFAP1Q8N556 730 aa16.12■□□□□ 0.17
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa16.12■□□□□ 0.17
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 MYOM3Q5VTT5 1437 aa16.11■□□□□ 0.17
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 LMTK3Q96Q04 1460 aa16.11■□□□□ 0.17
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 MBD5Q9P267 1494 aa16.11■□□□□ 0.17
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 MLH3Q9UHC1 1453 aa16.11■□□□□ 0.17
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP16.09■□□□□ 0.17
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 BCORL1Q5H9F3 1711 aa16.08■□□□□ 0.17
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 MIA2Q96PC5 1412 aa16.07■□□□□ 0.16
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ATP10AO60312 1499 aa16.07■□□□□ 0.16
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ARHGEF5Q12774 1597 aa16.07■□□□□ 0.16
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 REREQ9P2R6 1566 aa16.07■□□□□ 0.16
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ADAMTSL3P82987 1691 aa16.06■□□□□ 0.16
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ATP7AQ04656 1500 aa16.06■□□□□ 0.16
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 C9orf84Q5VXU9 1444 aa16.05■□□□□ 0.16
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 PTPN23Q9H3S7 1636 aa16.05■□□□□ 0.16
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 CCDC141Q6ZP82 1450 aa16.04■□□□□ 0.16
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ILDR2Q71H61 639 aa16.03■□□□□ 0.16
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 FGD6Q6ZV73 1430 aa16.02■□□□□ 0.16
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SOCS7O14512 581 aa16.02■□□□□ 0.16
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ADGBQ8N7X0 1667 aa16.02■□□□□ 0.15
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 CROCC2H7BZ55 1655 aa16.01■□□□□ 0.15
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 MADDQ8WXG6 1647 aa16.01■□□□□ 0.15
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 PLXNC1O60486 1568 aa16■□□□□ 0.15
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 MAST1Q9Y2H9 1570 aa16■□□□□ 0.15
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 AGLP35573 1532 aa15.99■□□□□ 0.15
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 MYT1LQ9UL68 1186 aa15.99■□□□□ 0.15
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa15.99■□□□□ 0.15
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa15.97■□□□□ 0.15
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 RSPH4AQ5TD94 716 aa15.96■□□□□ 0.15
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 A2MP01023 1474 aa15.95■□□□□ 0.14
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ABCC5O15440 1437 aa15.93■□□□□ 0.14
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SHANK2Q9UPX8 1470 aa15.92■□□□□ 0.14
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 DAPK1P53355 1430 aa15.92■□□□□ 0.14
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 PTPRMP28827 1452 aa15.91■□□□□ 0.14
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 MLECQ14165 292 aa15.9■□□□□ 0.14
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TSPY4P0CV99 314 aa15.89■□□□□ 0.13
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TSPY10P0CW01 314 aa15.89■□□□□ 0.13
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 MROH2AA6NES4 1674 aa15.84■□□□□ 0.13
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 C3P01024 1663 aa15.84■□□□□ 0.13
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ADGRL2O95490 1459 aa15.84■□□□□ 0.13
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 DUOX2Q9NRD8 1548 aa15.84■□□□□ 0.13
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.13
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.13
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP15.82■□□□□ 0.12
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 PTPRKQ15262 1439 aa15.82■□□□□ 0.12
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 MROH1Q8NDA8 1641 aa15.81■□□□□ 0.12
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 KIF15Q9NS87 1388 aa15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms