RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626343.2

PCBP1-AS1-289, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 910 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 PLEKHG3A1L390 1219 aa9.23□□□□□ -0.93
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 CLUAP1Q96AJ1 413 aa9.22□□□□□ -0.93
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 SOX12O15370 315 aa9.21□□□□□ -0.94
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 EFCAB3Q8N7B9 438 aa9.21□□□□□ -0.94
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 PHF8Q9UPP1 1060 aa9.21□□□□□ -0.94
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 RAD21O60216 631 aa9.2□□□□□ -0.94
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 CAMK2BQ13554 666 aa9.2□□□□□ -0.94
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 TRAIPQ9BWF2 469 aa9.2□□□□□ -0.94
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 AEBP1Q8IUX7 1158 aa9.18□□□□□ -0.94
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa9.18□□□□□ -0.94
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 CABP2Q9NPB3 220 aa9.17□□□□□ -0.94
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 GOPCQ9HD26 462 aa9.14□□□□□ -0.95
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 PARP9Q8IXQ6 854 aa9.12□□□□□ -0.95
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 CCDC102AQ96A19 550 aa9.12□□□□□ -0.95
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 SERPINA10Q9UK55 444 aa9.12□□□□□ -0.95
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 AMHR2Q16671 573 aa9.11□□□□□ -0.95
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 TMCO4Q5TGY1 634 aa9.11□□□□□ -0.95
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 NISCHQ9Y2I1 1504 aa9.1□□□□□ -0.95
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 MAP2K5Q13163 448 aa9.1□□□□□ -0.95
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 AKT1S1Q96B36 256 aa9.1□□□□□ -0.95
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 GPR37O15354 613 aa9.09□□□□□ -0.95
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 RGS22Q8NE09 1264 aa9.09□□□□□ -0.95
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 IRF6O14896 467 aa9.08□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 MCM6Q14566 821 aa9.08□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 MTMR7Q9Y216 660 aa9.08□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 DPYSL4O14531 572 aa9.07□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa9.06□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 NUTM2FA1L443 756 aa9.05□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa9.05□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 PDIA6Q15084 440 aa9.04□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa9.03□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 RBM25P49756 843 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 IFNL1Q8IU54 200 aa9.03□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 MS4A4AQ96JQ5 239 aa9.03□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 CCDC61Q9Y6R9 512 aa9.03□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 RETREG2Q8NC44 543 aa9.02□□□□□ -0.97
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 GNPATO15228 680 aa9□□□□□ -0.97
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 POM121Q96HA1 1249 aa8.99□□□□□ -0.97
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 EMILIN3Q9NT22 766 aa8.99□□□□□ -0.97
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 IGSF3O75054 1194 aa8.98□□□□□ -0.97
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 SH3D19Q5HYK7 790 aa8.98□□□□□ -0.97
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 FBXW7Q969H0 707 aa8.98□□□□□ -0.97
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 GRXCR2A6NFK2 248 aa8.97□□□□□ -0.97
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 MS4A1P11836 297 aa8.97□□□□□ -0.97
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 HIC1Q14526 733 aa8.96□□□□□ -0.98
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 FCHSD2O94868 740 aa8.95□□□□□ -0.98
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 GOLGA2Q08379 1002 aa8.95□□□□□ -0.98
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 IRF5Q13568 498 aa8.95□□□□□ -0.98
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 ZNF428Q96B54 188 aa8.95□□□□□ -0.98
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 PLSCR2Q9NRY7 297 aa8.95□□□□□ -0.98
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 CHADLQ6NUI6 762 aa8.94□□□□□ -0.98
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 MAP3K13O43283 966 aa8.93□□□□□ -0.98
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 FECHP22830 423 aa8.93□□□□□ -0.98
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 PDE4CQ08493 712 aa8.93□□□□□ -0.98
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 E9PSI1 815 aa8.92□□□□□ -0.98
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 PITPNM1O00562 1244 aa8.9□□□□□ -0.98
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 COG6Q9Y2V7 657 aa8.9□□□□□ -0.98
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 DSG2Q14126 1118 aa8.89□□□□□ -0.99
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 SPDYE5A6NIY4 337 aa8.88□□□□□ -0.99
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 OXER1Q8TDS5 423 aa8.88□□□□□ -0.99
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 KIF12Q96FN5 646 aa8.88□□□□□ -0.99
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 OSBPP22059 807 aa8.86□□□□□ -0.99
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 MAP3K9P80192 1104 aa8.85□□□□□ -0.99
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 CLCN1P35523 988 aa8.84□□□□□ -0.99
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 POLR3EQ9NVU0 708 aa8.84□□□□□ -0.99
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 WWC1Q8IX03 1113 aa8.83□□□□□ -1
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 TMC2Q8TDI7 906 aa8.83□□□□□ -1
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 KCNA1Q09470 495 aa8.82□□□□□ -1
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms