RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623129.1

C2orf27B-201, Transcript of chromosome 2 open reading frame 27B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C2orf27B, Length 1,325 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf27B-201ENST00000623129 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.19■■□□□ 1.94
C2orf27B-201ENST00000623129 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.18■■□□□ 1.94
C2orf27B-201ENST00000623129 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.17■■□□□ 1.94
C2orf27B-201ENST00000623129 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.17■■□□□ 1.94
C2orf27B-201ENST00000623129 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.17■■□□□ 1.94
C2orf27B-201ENST00000623129 FANCAO15360 1455 aa27.16■■□□□ 1.94
C2orf27B-201ENST00000623129 NEO1Q92859 1461 aa27.12■■□□□ 1.93
C2orf27B-201ENST00000623129 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.12■■□□□ 1.93
C2orf27B-201ENST00000623129 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
C2orf27B-201ENST00000623129 TSPOAP1O95153 1857 aa27.1■■□□□ 1.93
C2orf27B-201ENST00000623129 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
C2orf27B-201ENST00000623129 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
C2orf27B-201ENST00000623129 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.08■■□□□ 1.93
C2orf27B-201ENST00000623129 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
C2orf27B-201ENST00000623129 AKNAQ7Z591 1439 aa27.07■■□□□ 1.92
C2orf27B-201ENST00000623129 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.07■■□□□ 1.92
C2orf27B-201ENST00000623129 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.06■■□□□ 1.92
C2orf27B-201ENST00000623129 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.05■■□□□ 1.92
C2orf27B-201ENST00000623129 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
C2orf27B-201ENST00000623129 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.04■■□□□ 1.92
C2orf27B-201ENST00000623129 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.04■■□□□ 1.92
C2orf27B-201ENST00000623129 ADGRL1O94910 1474 aa27.02■■□□□ 1.92
C2orf27B-201ENST00000623129 ABCC1P33527 1531 aa27.02■■□□□ 1.92
C2orf27B-201ENST00000623129 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
C2orf27B-201ENST00000623129 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.98■■□□□ 1.91
C2orf27B-201ENST00000623129 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.97■■□□□ 1.91
C2orf27B-201ENST00000623129 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.95■■□□□ 1.91
C2orf27B-201ENST00000623129 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.95■■□□□ 1.91
C2orf27B-201ENST00000623129 MBD5Q9P267 1494 aa26.95■■□□□ 1.9
C2orf27B-201ENST00000623129 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.94■■□□□ 1.9
C2orf27B-201ENST00000623129 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
C2orf27B-201ENST00000623129 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.93■■□□□ 1.9
C2orf27B-201ENST00000623129 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.91■■□□□ 1.9
C2orf27B-201ENST00000623129 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.9■■□□□ 1.9
C2orf27B-201ENST00000623129 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.9■■□□□ 1.9
C2orf27B-201ENST00000623129 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.89■■□□□ 1.9
C2orf27B-201ENST00000623129 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.89
C2orf27B-201ENST00000623129 DAPK1P53355 1430 aa26.87■■□□□ 1.89
C2orf27B-201ENST00000623129 ABCC5O15440 1437 aa26.86■■□□□ 1.89
C2orf27B-201ENST00000623129 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
C2orf27B-201ENST00000623129 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
C2orf27B-201ENST00000623129 RAPGEF3O95398 923 aa26.84■■□□□ 1.89
C2orf27B-201ENST00000623129 AFAP1Q8N556 730 aa26.84■■□□□ 1.89
C2orf27B-201ENST00000623129 TSPY4P0CV99 314 aa26.83■■□□□ 1.89
C2orf27B-201ENST00000623129 TSPY10P0CW01 314 aa26.83■■□□□ 1.89
C2orf27B-201ENST00000623129 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.83■■□□□ 1.88
C2orf27B-201ENST00000623129 RICTORQ6R327 1708 aa26.82■■□□□ 1.88
C2orf27B-201ENST00000623129 KDM5CP41229 1560 aa26.82■■□□□ 1.88
C2orf27B-201ENST00000623129 KDM6BO15054 1643 aa26.82■■□□□ 1.88
C2orf27B-201ENST00000623129 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.8■■□□□ 1.88
C2orf27B-201ENST00000623129 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
C2orf27B-201ENST00000623129 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.79■■□□□ 1.88
C2orf27B-201ENST00000623129 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.78■■□□□ 1.88
C2orf27B-201ENST00000623129 ITGAEP38570 1179 aa26.78■■□□□ 1.88
C2orf27B-201ENST00000623129 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.78■■□□□ 1.88
C2orf27B-201ENST00000623129 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.77■■□□□ 1.88
C2orf27B-201ENST00000623129 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.77■■□□□ 1.88
C2orf27B-201ENST00000623129 PTPRKQ15262 1439 aa26.76■■□□□ 1.87
C2orf27B-201ENST00000623129 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.76■■□□□ 1.87
C2orf27B-201ENST00000623129 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.74■■□□□ 1.87
C2orf27B-201ENST00000623129 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.73■■□□□ 1.87
C2orf27B-201ENST00000623129 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
C2orf27B-201ENST00000623129 ATP7AQ04656 1500 aa26.72■■□□□ 1.87
C2orf27B-201ENST00000623129 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.72■■□□□ 1.87
C2orf27B-201ENST00000623129 ADGRL2O95490 1459 aa26.71■■□□□ 1.87
C2orf27B-201ENST00000623129 ROCK1Q13464 1354 aa26.71■■□□□ 1.87
C2orf27B-201ENST00000623129 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.7■■□□□ 1.87
C2orf27B-201ENST00000623129 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.7■■□□□ 1.86
C2orf27B-201ENST00000623129 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.69■■□□□ 1.86
C2orf27B-201ENST00000623129 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.67■■□□□ 1.86
C2orf27B-201ENST00000623129 PLXNC1O60486 1568 aa26.66■■□□□ 1.86
C2orf27B-201ENST00000623129 NCOA1Q15788 1441 aa26.66■■□□□ 1.86
C2orf27B-201ENST00000623129 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.66■■□□□ 1.86
C2orf27B-201ENST00000623129 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.62■■□□□ 1.85
C2orf27B-201ENST00000623129 KIF15Q9NS87 1388 aa26.62■■□□□ 1.85
C2orf27B-201ENST00000623129 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.61■■□□□ 1.85
C2orf27B-201ENST00000623129 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.61■■□□□ 1.85
C2orf27B-201ENST00000623129 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.59■■□□□ 1.85
C2orf27B-201ENST00000623129 ABCA6Q8N139 1617 aa26.59■■□□□ 1.85
C2orf27B-201ENST00000623129 HFM1A2PYH4 1435 aa26.59■■□□□ 1.85
C2orf27B-201ENST00000623129 ATP10AO60312 1499 aa26.58■■□□□ 1.84
C2orf27B-201ENST00000623129 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.57■■□□□ 1.84
C2orf27B-201ENST00000623129 A2MP01023 1474 aa26.55■■□□□ 1.84
C2orf27B-201ENST00000623129 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
C2orf27B-201ENST00000623129 NAIPQ13075 1403 aa26.54■■□□□ 1.84
C2orf27B-201ENST00000623129 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.54■■□□□ 1.84
C2orf27B-201ENST00000623129 REREQ9P2R6 1566 aa26.52■■□□□ 1.84
C2orf27B-201ENST00000623129 ERBINQ96RT1 1412 aa26.51■■□□□ 1.83
C2orf27B-201ENST00000623129 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.51■■□□□ 1.83
C2orf27B-201ENST00000623129 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.51■■□□□ 1.83
C2orf27B-201ENST00000623129 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.48■■□□□ 1.83
C2orf27B-201ENST00000623129 AGLP35573 1532 aa26.44■■□□□ 1.82
C2orf27B-201ENST00000623129 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
C2orf27B-201ENST00000623129 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
C2orf27B-201ENST00000623129 KIF3BO15066 747 aa26.39■■□□□ 1.82
C2orf27B-201ENST00000623129 HRCP23327 699 aa26.39■■□□□ 1.82
C2orf27B-201ENST00000623129 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.39■■□□□ 1.82
C2orf27B-201ENST00000623129 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.39■■□□□ 1.82
C2orf27B-201ENST00000623129 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
C2orf27B-201ENST00000623129 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms