RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621444.4

NOP16-211, Transcript of NOP16 nucleolar protein, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NOP16, Length 954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP16-211ENST00000621444 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.24■■□□□ 1.15
NOP16-211ENST00000621444 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.24■■□□□ 1.15
NOP16-211ENST00000621444 MADDQ8WXG6 1647 aa22.24■■□□□ 1.15
NOP16-211ENST00000621444 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.23■■□□□ 1.15
NOP16-211ENST00000621444 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.21■■□□□ 1.15
NOP16-211ENST00000621444 PREX2Q70Z35 1606 aa22.21■■□□□ 1.15
NOP16-211ENST00000621444 PTPRMP28827 1452 aa22.21■■□□□ 1.15
NOP16-211ENST00000621444 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
NOP16-211ENST00000621444 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.2■■□□□ 1.14
NOP16-211ENST00000621444 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
NOP16-211ENST00000621444 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.19■■□□□ 1.14
NOP16-211ENST00000621444 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.17■■□□□ 1.14
NOP16-211ENST00000621444 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.16■■□□□ 1.14
NOP16-211ENST00000621444 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.15■■□□□ 1.14
NOP16-211ENST00000621444 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.14■■□□□ 1.14
NOP16-211ENST00000621444 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.14■■□□□ 1.14
NOP16-211ENST00000621444 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.14■■□□□ 1.14
NOP16-211ENST00000621444 KDM5CP41229 1560 aa22.14■■□□□ 1.13
NOP16-211ENST00000621444 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.11■■□□□ 1.13
NOP16-211ENST00000621444 ABCC1P33527 1531 aa22.1■■□□□ 1.13
NOP16-211ENST00000621444 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.09■■□□□ 1.13
NOP16-211ENST00000621444 ATP10AO60312 1499 aa22.08■■□□□ 1.12
NOP16-211ENST00000621444 REREQ9P2R6 1566 aa22.04■■□□□ 1.12
NOP16-211ENST00000621444 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.04■■□□□ 1.12
NOP16-211ENST00000621444 ABCA6Q8N139 1617 aa22.02■■□□□ 1.12
NOP16-211ENST00000621444 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.02■■□□□ 1.12
NOP16-211ENST00000621444 MLH3Q9UHC1 1453 aa22■■□□□ 1.11
NOP16-211ENST00000621444 LMTK3Q96Q04 1460 aa21.98■■□□□ 1.11
NOP16-211ENST00000621444 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.98■■□□□ 1.11
NOP16-211ENST00000621444 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.97■■□□□ 1.11
NOP16-211ENST00000621444 CEP162Q5TB80 1403 aa21.97■■□□□ 1.11
NOP16-211ENST00000621444 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.96■■□□□ 1.11
NOP16-211ENST00000621444 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.95■■□□□ 1.1
NOP16-211ENST00000621444 AFAP1Q8N556 730 aa21.94■■□□□ 1.1
NOP16-211ENST00000621444 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.94■■□□□ 1.1
NOP16-211ENST00000621444 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.94■■□□□ 1.1
NOP16-211ENST00000621444 PREX1Q8TCU6 1659 aa21.94■■□□□ 1.1
NOP16-211ENST00000621444 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.93■■□□□ 1.1
NOP16-211ENST00000621444 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
NOP16-211ENST00000621444 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.93■■□□□ 1.1
NOP16-211ENST00000621444 AGLP35573 1532 aa21.92■■□□□ 1.1
NOP16-211ENST00000621444 MLECQ14165 292 aa21.92■■□□□ 1.1
NOP16-211ENST00000621444 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
NOP16-211ENST00000621444 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.89■■□□□ 1.1
NOP16-211ENST00000621444 TIAM1Q13009 1591 aa21.89■■□□□ 1.09
NOP16-211ENST00000621444 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
NOP16-211ENST00000621444 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
NOP16-211ENST00000621444 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.86■■□□□ 1.09
NOP16-211ENST00000621444 ATP7AQ04656 1500 aa21.85■■□□□ 1.09
NOP16-211ENST00000621444 C3P01024 1663 aa21.85■■□□□ 1.09
NOP16-211ENST00000621444 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
NOP16-211ENST00000621444 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.83■■□□□ 1.09
NOP16-211ENST00000621444 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
NOP16-211ENST00000621444 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.82■■□□□ 1.08
NOP16-211ENST00000621444 MROH2AA6NES4 1674 aa21.82■■□□□ 1.08
NOP16-211ENST00000621444 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
NOP16-211ENST00000621444 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
NOP16-211ENST00000621444 PLXNC1O60486 1568 aa21.79■■□□□ 1.08
NOP16-211ENST00000621444 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.79■■□□□ 1.08
NOP16-211ENST00000621444 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
NOP16-211ENST00000621444 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.75■■□□□ 1.07
NOP16-211ENST00000621444 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.75■■□□□ 1.07
NOP16-211ENST00000621444 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.74■■□□□ 1.07
NOP16-211ENST00000621444 A2MP01023 1474 aa21.73■■□□□ 1.07
NOP16-211ENST00000621444 NCOA2Q15596 1464 aa21.73■■□□□ 1.07
NOP16-211ENST00000621444 HSPA2P54652 639 aa21.73■■□□□ 1.07
NOP16-211ENST00000621444 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
NOP16-211ENST00000621444 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
NOP16-211ENST00000621444 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.7■■□□□ 1.06
NOP16-211ENST00000621444 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.69■■□□□ 1.06
NOP16-211ENST00000621444 MBD5Q9P267 1494 aa21.69■■□□□ 1.06
NOP16-211ENST00000621444 STRCQ7RTU9 1775 aa21.68■■□□□ 1.06
NOP16-211ENST00000621444 MAP3K1Q13233 1512 aa21.67■■□□□ 1.06
NOP16-211ENST00000621444 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.67■■□□□ 1.06
NOP16-211ENST00000621444 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.65■■□□□ 1.06
NOP16-211ENST00000621444 NPATQ14207 1427 aa21.65■■□□□ 1.06
NOP16-211ENST00000621444 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.65■■□□□ 1.06
NOP16-211ENST00000621444 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
NOP16-211ENST00000621444 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
NOP16-211ENST00000621444 FBXO41Q8TF61 875 aa21.63■■□□□ 1.05
NOP16-211ENST00000621444 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.61■■□□□ 1.05
NOP16-211ENST00000621444 MYO3AQ8NEV4 1616 aa21.61■■□□□ 1.05
NOP16-211ENST00000621444 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.59■■□□□ 1.05
NOP16-211ENST00000621444 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.59■■□□□ 1.05
NOP16-211ENST00000621444 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.58■■□□□ 1.05
NOP16-211ENST00000621444 ZMYM3Q14202 1370 aa21.57■■□□□ 1.04
NOP16-211ENST00000621444 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.56■■□□□ 1.04
NOP16-211ENST00000621444 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.56■■□□□ 1.04
NOP16-211ENST00000621444 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
NOP16-211ENST00000621444 KDM5DQ9BY66 1539 aa21.54■■□□□ 1.04
NOP16-211ENST00000621444 GGT6Q6P531 493 aa21.53■■□□□ 1.04
NOP16-211ENST00000621444 NCOA1Q15788 1441 aa21.53■■□□□ 1.04
NOP16-211ENST00000621444 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
NOP16-211ENST00000621444 PTPRTO14522 1441 aa21.52■■□□□ 1.04
NOP16-211ENST00000621444 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.52■■□□□ 1.04
NOP16-211ENST00000621444 MIA2Q96PC5 1412 aa21.52■■□□□ 1.04
NOP16-211ENST00000621444 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa21.51■■□□□ 1.03
NOP16-211ENST00000621444 PTPRKQ15262 1439 aa21.51■■□□□ 1.03
NOP16-211ENST00000621444 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
NOP16-211ENST00000621444 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms