RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614794.4

SPPL2B-211, Transcript of signal peptide peptidase like 2B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPPL2B, Length 1,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPPL2B-211ENST00000614794 MYOM3Q5VTT5 1437 aa34.48■■■■□ 3.11
SPPL2B-211ENST00000614794 ARHGAP5Q13017 1502 aa34.47■■■■□ 3.11
SPPL2B-211ENST00000614794 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP34.46■■■■□ 3.11
SPPL2B-211ENST00000614794 ITSN2Q9NZM3 1697 aa34.46■■■■□ 3.11
SPPL2B-211ENST00000614794 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa34.45■■■■□ 3.11
SPPL2B-211ENST00000614794 FANCAO15360 1455 aa34.45■■■■□ 3.11
SPPL2B-211ENST00000614794 NEO1Q92859 1461 aa34.4■■■■□ 3.1
SPPL2B-211ENST00000614794 MIA2Q96PC5 1412 aa34.39■■■■□ 3.1
SPPL2B-211ENST00000614794 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP34.38■■■■□ 3.09
SPPL2B-211ENST00000614794 CFAP74Q9C0B2 1584 aa34.38■■■■□ 3.09
SPPL2B-211ENST00000614794 AKNAQ7Z591 1439 aa34.35■■■■□ 3.09
SPPL2B-211ENST00000614794 FGD6Q6ZV73 1430 aa34.34■■■■□ 3.09
SPPL2B-211ENST00000614794 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
SPPL2B-211ENST00000614794 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa34.28■■■■□ 3.08
SPPL2B-211ENST00000614794 ADGRL1O94910 1474 aa34.27■■■■□ 3.08
SPPL2B-211ENST00000614794 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa34.27■■■■□ 3.08
SPPL2B-211ENST00000614794 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa34.25■■■■□ 3.07
SPPL2B-211ENST00000614794 SCAPERQ9BY12 1400 aa34.24■■■■□ 3.07
SPPL2B-211ENST00000614794 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa34.24■■■■□ 3.07
SPPL2B-211ENST00000614794 PTPN23Q9H3S7 1636 aa34.24■■■■□ 3.07
SPPL2B-211ENST00000614794 ABCC1P33527 1531 aa34.23■■■■□ 3.07
SPPL2B-211ENST00000614794 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP34.21■■■■□ 3.07
SPPL2B-211ENST00000614794 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
SPPL2B-211ENST00000614794 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP34.19■■■■□ 3.062e-7■■■■□ 19.5
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SPPL2B-211ENST00000614794 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
SPPL2B-211ENST00000614794 SYCP2Q9BX26 1530 aa34.17■■■■□ 3.06
SPPL2B-211ENST00000614794 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa34.17■■■■□ 3.06
SPPL2B-211ENST00000614794 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
SPPL2B-211ENST00000614794 MBD5Q9P267 1494 aa34.13■■■■□ 3.05
SPPL2B-211ENST00000614794 RSPH4AQ5TD94 716 aa34.13■■■■□ 3.05
SPPL2B-211ENST00000614794 RAPGEF3O95398 923 aa34.12■■■■□ 3.05
SPPL2B-211ENST00000614794 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP34.12■■■■□ 3.056e-7■■■□□ 16.7
SPPL2B-211ENST00000614794 POGZQ7Z3K3 1410 aa34.12■■■■□ 3.05
SPPL2B-211ENST00000614794 KDM6BO15054 1643 aa34.11■■■■□ 3.05
SPPL2B-211ENST00000614794 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa34.1■■■■□ 3.05
SPPL2B-211ENST00000614794 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa34.09■■■■□ 3.05
SPPL2B-211ENST00000614794 AFAP1Q8N556 730 aa34.09■■■■□ 3.05
SPPL2B-211ENST00000614794 ARHGEF5Q12774 1597 aa34.07■■■■□ 3.04
SPPL2B-211ENST00000614794 CCDC141Q6ZP82 1450 aa34.05■■■■□ 3.04
SPPL2B-211ENST00000614794 RICTORQ6R327 1708 aa34.04■■■■□ 3.04
SPPL2B-211ENST00000614794 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa34.02■■■■□ 3.04
SPPL2B-211ENST00000614794 ABCC5O15440 1437 aa33.99■■■■□ 3.03
SPPL2B-211ENST00000614794 TSPY4P0CV99 314 aa33.99■■■■□ 3.03
SPPL2B-211ENST00000614794 TSPY10P0CW01 314 aa33.99■■■■□ 3.03
SPPL2B-211ENST00000614794 KDM5CP41229 1560 aa33.99■■■■□ 3.03
SPPL2B-211ENST00000614794 DAPK1P53355 1430 aa33.99■■■■□ 3.03
SPPL2B-211ENST00000614794 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP33.99■■■■□ 3.03
SPPL2B-211ENST00000614794 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
SPPL2B-211ENST00000614794 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa33.95■■■■□ 3.03
SPPL2B-211ENST00000614794 MYT1LQ9UL68 1186 aa33.93■■■■□ 3.02
SPPL2B-211ENST00000614794 MLH3Q9UHC1 1453 aa33.92■■■■□ 3.02
SPPL2B-211ENST00000614794 ITGAEP38570 1179 aa33.92■■■■□ 3.02
SPPL2B-211ENST00000614794 MAGI2Q86UL8 1455 aa33.91■■■■□ 3.02
SPPL2B-211ENST00000614794 SHANK2Q9UPX8 1470 aa33.91■■■■□ 3.02
SPPL2B-211ENST00000614794 C9orf84Q5VXU9 1444 aa33.9■■■■□ 3.02
SPPL2B-211ENST00000614794 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa33.89■■■■□ 3.02
SPPL2B-211ENST00000614794 HECW2Q9P2P5 1572 aa33.89■■■■□ 3.02
SPPL2B-211ENST00000614794 CROCC2H7BZ55 1655 aa33.89■■■■□ 3.01
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SPPL2B-211ENST00000614794 MAST1Q9Y2H9 1570 aa33.86■■■■□ 3.01
SPPL2B-211ENST00000614794 PTPRKQ15262 1439 aa33.85■■■■□ 3.01
SPPL2B-211ENST00000614794 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP33.85■■■■□ 3.01
SPPL2B-211ENST00000614794 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa33.85■■■■□ 3.01
SPPL2B-211ENST00000614794 CHIC2Q9UKJ5 165 aa33.85■■■■□ 3.01
SPPL2B-211ENST00000614794 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa33.83■■■■□ 3.01
SPPL2B-211ENST00000614794 YEATS2Q9ULM3 1422 aa33.8■■■■□ 3
SPPL2B-211ENST00000614794 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP33.8■■■■□ 3
SPPL2B-211ENST00000614794 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa33.78■■■■□ 3
SPPL2B-211ENST00000614794 ADGRL2O95490 1459 aa33.76■■■□□ 2.99
SPPL2B-211ENST00000614794 NCOA1Q15788 1441 aa33.75■■■□□ 2.99
SPPL2B-211ENST00000614794 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa33.75■■■□□ 2.99
SPPL2B-211ENST00000614794 ROCK1Q13464 1354 aa33.75■■■□□ 2.99
SPPL2B-211ENST00000614794 PLXNC1O60486 1568 aa33.73■■■□□ 2.99
SPPL2B-211ENST00000614794 ABCA6Q8N139 1617 aa33.73■■■□□ 2.99
SPPL2B-211ENST00000614794 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa33.72■■■□□ 2.99
SPPL2B-211ENST00000614794 ATP10AO60312 1499 aa33.72■■■□□ 2.99
SPPL2B-211ENST00000614794 ADGBQ8N7X0 1667 aa33.72■■■□□ 2.99
SPPL2B-211ENST00000614794 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa33.72■■■□□ 2.99
SPPL2B-211ENST00000614794 KIF15Q9NS87 1388 aa33.7■■■□□ 2.98
SPPL2B-211ENST00000614794 A2MP01023 1474 aa33.65■■■□□ 2.98
SPPL2B-211ENST00000614794 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP33.64■■■□□ 2.98
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SPPL2B-211ENST00000614794 ERBINQ96RT1 1412 aa33.55■■■□□ 2.96
SPPL2B-211ENST00000614794 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa33.55■■■□□ 2.96
SPPL2B-211ENST00000614794 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP33.53■■■□□ 2.96
SPPL2B-211ENST00000614794 AGLP35573 1532 aa33.52■■■□□ 2.96
SPPL2B-211ENST00000614794 KIF3BO15066 747 aa33.49■■■□□ 2.95
SPPL2B-211ENST00000614794 GCC2Q8IWJ2 1684 aa33.48■■■□□ 2.95
SPPL2B-211ENST00000614794 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa33.47■■■□□ 2.95
SPPL2B-211ENST00000614794 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP33.46■■■□□ 2.95
SPPL2B-211ENST00000614794 SETD5Q9C0A6 1442 aa33.44■■■□□ 2.94
SPPL2B-211ENST00000614794 PCGF6Q9BYE7 350 aa33.43■■■□□ 2.94
SPPL2B-211ENST00000614794 BCORL1Q5H9F3 1711 aa33.42■■■□□ 2.94
SPPL2B-211ENST00000614794 GGT6Q6P531 493 aa33.38■■■□□ 2.93
SPPL2B-211ENST00000614794 MLECQ14165 292 aa33.38■■■□□ 2.93
SPPL2B-211ENST00000614794 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP33.34■■■□□ 2.93
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