RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614402.4

PMPCA-208, Transcript of peptidase, mitochondrial processing alpha subunit, human

TSL 2

Gene PMPCA, Length 505 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PMPCA-208	ENST00000614402	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		33.5	■■■□□ 2.95
PMPCA-208	ENST00000614402	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	33.5	■■■□□ 2.95
PMPCA-208	ENST00000614402	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		33.49	■■■□□ 2.95
PMPCA-208	ENST00000614402	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		33.48	■■■□□ 2.95
PMPCA-208	ENST00000614402	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	33.45	■■■□□ 2.95
PMPCA-208	ENST00000614402	CLIP1	P30622	1438 aa		33.43	■■■□□ 2.94
PMPCA-208	ENST00000614402	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		33.43	■■■□□ 2.94
PMPCA-208	ENST00000614402	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		33.41	■■■□□ 2.94
PMPCA-208	ENST00000614402	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	33.4	■■■□□ 2.94
PMPCA-208	ENST00000614402	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		33.38	■■■□□ 2.93
PMPCA-208	ENST00000614402	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		33.37	■■■□□ 2.93
PMPCA-208	ENST00000614402	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	33.34	■■■□□ 2.93
PMPCA-208	ENST00000614402	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		33.32	■■■□□ 2.92
PMPCA-208	ENST00000614402	KDM5C	P41229	1560 aa		33.32	■■■□□ 2.92
PMPCA-208	ENST00000614402	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		33.32	■■■□□ 2.92
PMPCA-208	ENST00000614402	ATP10A	O60312	1499 aa		33.31	■■■□□ 2.92
PMPCA-208	ENST00000614402	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		33.31	■■■□□ 2.92
PMPCA-208	ENST00000614402	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		33.3	■■■□□ 2.92
PMPCA-208	ENST00000614402	PREX2	Q70Z35	1606 aa		33.29	■■■□□ 2.92
PMPCA-208	ENST00000614402	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		33.28	■■■□□ 2.92
PMPCA-208	ENST00000614402	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		33.24	■■■□□ 2.91
PMPCA-208	ENST00000614402	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		33.23	■■■□□ 2.91
PMPCA-208	ENST00000614402	ABCC1	P33527	1531 aa		33.22	■■■□□ 2.91
PMPCA-208	ENST00000614402	AFAP1	Q8N556	730 aa		33.21	■■■□□ 2.91
PMPCA-208	ENST00000614402	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PMPCA-208	ENST00000614402	MLEC	Q14165	292 aa		33.18	■■■□□ 2.9
PMPCA-208	ENST00000614402	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		33.17	■■■□□ 2.9
PMPCA-208	ENST00000614402	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PMPCA-208	ENST00000614402	RERE	Q9P2R6	1566 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PMPCA-208	ENST00000614402	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PMPCA-208	ENST00000614402	ABCA6	Q8N139	1617 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PMPCA-208	ENST00000614402	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PMPCA-208	ENST00000614402	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		33.07	■■■□□ 2.88
PMPCA-208	ENST00000614402	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
PMPCA-208	ENST00000614402	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		33.04	■■■□□ 2.88
PMPCA-208	ENST00000614402	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		33.04	■■■□□ 2.88
PMPCA-208	ENST00000614402	AGL	P35573	1532 aa		33.02	■■■□□ 2.88
PMPCA-208	ENST00000614402	HSPA2	P54652	639 aa		33.01	■■■□□ 2.87
PMPCA-208	ENST00000614402	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		33.01	■■■□□ 2.87
PMPCA-208	ENST00000614402	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		32.97	■■■□□ 2.87
PMPCA-208	ENST00000614402	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		32.97	■■■□□ 2.87
PMPCA-208	ENST00000614402	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	32.93	■■■□□ 2.86
PMPCA-208	ENST00000614402	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	32.91	■■■□□ 2.86
PMPCA-208	ENST00000614402	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		32.91	■■■□□ 2.86
PMPCA-208	ENST00000614402	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		32.9	■■■□□ 2.86
PMPCA-208	ENST00000614402	CEP162	Q5TB80	1403 aa		32.9	■■■□□ 2.86
PMPCA-208	ENST00000614402	FBXO41	Q8TF61	875 aa		32.89	■■■□□ 2.86
PMPCA-208	ENST00000614402	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		32.88	■■■□□ 2.85
PMPCA-208	ENST00000614402	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		32.88	■■■□□ 2.85
PMPCA-208	ENST00000614402	C3	P01024	1663 aa		32.87	■■■□□ 2.85
PMPCA-208	ENST00000614402	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		32.87	■■■□□ 2.85
PMPCA-208	ENST00000614402	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	32.86	■■■□□ 2.85
PMPCA-208	ENST00000614402	TIAM1	Q13009	1591 aa		32.85	■■■□□ 2.85
PMPCA-208	ENST00000614402	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	32.85	■■■□□ 2.85
PMPCA-208	ENST00000614402	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	32.85	■■■□□ 2.85
PMPCA-208	ENST00000614402	ATP7A	Q04656	1500 aa		32.83	■■■□□ 2.85
PMPCA-208	ENST00000614402	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	32.82	■■■□□ 2.84
PMPCA-208	ENST00000614402	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	32.81	■■■□□ 2.84
PMPCA-208	ENST00000614402	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		32.8	■■■□□ 2.84
PMPCA-208	ENST00000614402	PLXNC1	O60486	1568 aa		32.79	■■■□□ 2.84
PMPCA-208	ENST00000614402	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		32.78	■■■□□ 2.84
PMPCA-208	ENST00000614402	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	32.74	■■■□□ 2.83
PMPCA-208	ENST00000614402	STRC	Q7RTU9	1775 aa		32.74	■■■□□ 2.83
PMPCA-208	ENST00000614402	MROH2A	A6NES4	1674 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PMPCA-208	ENST00000614402	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	32.73	■■■□□ 2.83
PMPCA-208	ENST00000614402	MBD5	Q9P267	1494 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PMPCA-208	ENST00000614402	A2M	P01023	1474 aa		32.72	■■■□□ 2.83
PMPCA-208	ENST00000614402	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	32.71	■■■□□ 2.83
PMPCA-208	ENST00000614402	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		32.66	■■■□□ 2.82
PMPCA-208	ENST00000614402	NCOA2	Q15596	1464 aa		32.65	■■■□□ 2.82
PMPCA-208	ENST00000614402	NPAT	Q14207	1427 aa		32.64	■■■□□ 2.82
PMPCA-208	ENST00000614402	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PMPCA-208	ENST00000614402	ZMYM3	Q14202	1370 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PMPCA-208	ENST00000614402	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
PMPCA-208	ENST00000614402	CERK	Q8TCT0	537 aa		32.6	■■■□□ 2.81
PMPCA-208	ENST00000614402	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		32.59	■■■□□ 2.81
PMPCA-208	ENST00000614402	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		32.58	■■■□□ 2.81
PMPCA-208	ENST00000614402	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		32.56	■■■□□ 2.8
PMPCA-208	ENST00000614402	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		32.54	■■■□□ 2.8
PMPCA-208	ENST00000614402	PTPRT	O14522	1441 aa		32.54	■■■□□ 2.8
PMPCA-208	ENST00000614402	NCOA1	Q15788	1441 aa		32.53	■■■□□ 2.8
PMPCA-208	ENST00000614402	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		32.53	■■■□□ 2.8
PMPCA-208	ENST00000614402	PTPRK	Q15262	1439 aa		32.51	■■■□□ 2.79
PMPCA-208	ENST00000614402	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		32.5	■■■□□ 2.79
PMPCA-208	ENST00000614402	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
PMPCA-208	ENST00000614402	GGT6	Q6P531	493 aa		32.5	■■■□□ 2.79
PMPCA-208	ENST00000614402	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		32.5	■■■□□ 2.79
PMPCA-208	ENST00000614402	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PMPCA-208	ENST00000614402	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
PMPCA-208	ENST00000614402	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		32.47	■■■□□ 2.79
PMPCA-208	ENST00000614402	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		32.46	■■■□□ 2.79
PMPCA-208	ENST00000614402	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		32.45	■■■□□ 2.79
PMPCA-208	ENST00000614402	MAP3K1	Q13233	1512 aa		32.45	■■■□□ 2.78
PMPCA-208	ENST00000614402	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	32.41	■■■□□ 2.78
PMPCA-208	ENST00000614402	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PMPCA-208	ENST00000614402	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		32.37	■■■□□ 2.77
PMPCA-208	ENST00000614402	PLA2R1	Q13018	1463 aa		32.36	■■■□□ 2.77
PMPCA-208	ENST00000614402	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PMPCA-208	ENST00000614402	KIF3B	O15066	747 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PMPCA-208	ENST00000614402	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	32.34	■■■□□ 2.77

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