RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610767.4

KCTD17-209, Transcript of potassium channel tetramerization domain containing 17, human

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene KCTD17, Length 1,502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KCTD17-209	ENST00000610767	MIA2	Q96PC5	1412 aa		43.06	■■■■■ 4.48
KCTD17-209	ENST00000610767	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	43.01	■■■■■ 4.48
KCTD17-209	ENST00000610767	TSPOAP1	O95153	1857 aa		43.01	■■■■■ 4.48
KCTD17-209	ENST00000610767	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	43.01	■■■■■ 4.48
KCTD17-209	ENST00000610767	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		43.01	■■■■■ 4.48
KCTD17-209	ENST00000610767	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	43.01	■■■■■ 4.48
KCTD17-209	ENST00000610767	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		42.94	■■■■■ 4.47
KCTD17-209	ENST00000610767	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		42.94	■■■■■ 4.47
KCTD17-209	ENST00000610767	FANCA	O15360	1455 aa		42.94	■■■■■ 4.46
KCTD17-209	ENST00000610767	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	42.94	■■■■■ 4.46
KCTD17-209	ENST00000610767	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	42.92	■■■■■ 4.46
KCTD17-209	ENST00000610767	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		42.91	■■■■■ 4.46
KCTD17-209	ENST00000610767	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		42.9	■■■■■ 4.46
KCTD17-209	ENST00000610767	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		42.86	■■■■■ 4.45
KCTD17-209	ENST00000610767	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	42.85	■■■■■ 4.45
KCTD17-209	ENST00000610767	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	42.85	■■■■■ 4.45
KCTD17-209	ENST00000610767	NEO1	Q92859	1461 aa		42.84	■■■■■ 4.45
KCTD17-209	ENST00000610767	ABCC1	P33527	1531 aa		42.82	■■■■■ 4.45
KCTD17-209	ENST00000610767	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	42.81	■■■■■ 4.44
KCTD17-209	ENST00000610767	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		42.79	■■■■■ 4.44
KCTD17-209	ENST00000610767	AKNA	Q7Z591	1439 aa		42.78	■■■■■ 4.44
KCTD17-209	ENST00000610767	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		42.77	■■■■■ 4.44
KCTD17-209	ENST00000610767	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	42.76	■■■■■ 4.44
KCTD17-209	ENST00000610767	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		42.74	■■■■■ 4.43
KCTD17-209	ENST00000610767	ADGRL1	O94910	1474 aa		42.74	■■■■■ 4.43
KCTD17-209	ENST00000610767	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		42.72	■■■■■ 4.43
KCTD17-209	ENST00000610767	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		42.7	■■■■■ 4.43
KCTD17-209	ENST00000610767	MBD5	Q9P267	1494 aa		42.7	■■■■■ 4.43
KCTD17-209	ENST00000610767	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	42.69	■■■■■ 4.42
KCTD17-209	ENST00000610767	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	42.67	■■■■■ 4.42
KCTD17-209	ENST00000610767	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		42.64	■■■■■ 4.42
KCTD17-209	ENST00000610767	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		42.63	■■■■■ 4.42
KCTD17-209	ENST00000610767	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	42.62	■■■■■ 4.41
KCTD17-209	ENST00000610767	DAPK1	P53355	1430 aa		42.59	■■■■■ 4.41
KCTD17-209	ENST00000610767	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		42.59	■■■■■ 4.41
KCTD17-209	ENST00000610767	ABCC5	O15440	1437 aa		42.58	■■■■■ 4.41
KCTD17-209	ENST00000610767	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		42.57	■■■■■ 4.41
KCTD17-209	ENST00000610767	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		42.55	■■■■■ 4.4
KCTD17-209	ENST00000610767	RICTOR	Q6R327	1708 aa		42.55	■■■■■ 4.4
KCTD17-209	ENST00000610767	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	42.54	■■■■■ 4.4
KCTD17-209	ENST00000610767	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		42.51	■■■■■ 4.4
KCTD17-209	ENST00000610767	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		42.51	■■■■■ 4.4
KCTD17-209	ENST00000610767	PTPRK	Q15262	1439 aa		42.5	■■■■■ 4.39
KCTD17-209	ENST00000610767	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		42.5	■■■■■ 4.39
KCTD17-209	ENST00000610767	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		42.49	■■■■■ 4.39
KCTD17-209	ENST00000610767	KDM5C	P41229	1560 aa		42.48	■■■■■ 4.39
KCTD17-209	ENST00000610767	ITGAE	P38570	1179 aa		42.47	■■■■■ 4.39
KCTD17-209	ENST00000610767	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	42.46	■■■■■ 4.39
KCTD17-209	ENST00000610767	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		42.45	■■■■■ 4.39
KCTD17-209	ENST00000610767	AFAP1	Q8N556	730 aa		42.43	■■■■■ 4.38
KCTD17-209	ENST00000610767	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		42.43	■■■■■ 4.38
KCTD17-209	ENST00000610767	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		42.41	■■■■■ 4.38
KCTD17-209	ENST00000610767	RAPGEF3	O95398	923 aa		42.4	■■■■■ 4.38
KCTD17-209	ENST00000610767	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	42.4	■■■■■ 4.38
KCTD17-209	ENST00000610767	KDM6B	O15054	1643 aa		42.38	■■■■■ 4.38
KCTD17-209	ENST00000610767	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		42.37	■■■■■ 4.37
KCTD17-209	ENST00000610767	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		42.37	■■■■■ 4.37
KCTD17-209	ENST00000610767	TSPY4	P0CV99	314 aa		42.36	■■■■■ 4.37
KCTD17-209	ENST00000610767	TSPY10	P0CW01	314 aa		42.36	■■■■■ 4.37
KCTD17-209	ENST00000610767	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		42.36	■■■■■ 4.37
KCTD17-209	ENST00000610767	ADGRL2	O95490	1459 aa		42.34	■■■■■ 4.37
KCTD17-209	ENST00000610767	ATP7A	Q04656	1500 aa		42.32	■■■■■ 4.37
KCTD17-209	ENST00000610767	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	42.32	■■■■■ 4.36
KCTD17-209	ENST00000610767	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		42.32	■■■■■ 4.36
KCTD17-209	ENST00000610767	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		42.31	■■■■■ 4.36
KCTD17-209	ENST00000610767	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		42.31	■■■■■ 4.36
KCTD17-209	ENST00000610767	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		42.31	■■■■■ 4.36
KCTD17-209	ENST00000610767	PLXNC1	O60486	1568 aa		42.29	■■■■■ 4.36
KCTD17-209	ENST00000610767	ROCK1	Q13464	1354 aa		42.29	■■■■■ 4.36
KCTD17-209	ENST00000610767	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		42.28	■■■■■ 4.36
KCTD17-209	ENST00000610767	NCOA1	Q15788	1441 aa		42.24	■■■■■ 4.35
KCTD17-209	ENST00000610767	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		42.23	■■■■■ 4.35
KCTD17-209	ENST00000610767	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		42.21	■■■■■ 4.35
KCTD17-209	ENST00000610767	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		42.2	■■■■■ 4.35
KCTD17-209	ENST00000610767	ABCA6	Q8N139	1617 aa		42.19	■■■■■ 4.34
KCTD17-209	ENST00000610767	HFM1	A2PYH4	1435 aa		42.16	■■■■■ 4.34
KCTD17-209	ENST00000610767	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		42.15	■■■■■ 4.34
KCTD17-209	ENST00000610767	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		42.14	■■■■■ 4.34
KCTD17-209	ENST00000610767	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		42.13	■■■■■ 4.33
KCTD17-209	ENST00000610767	KIF15	Q9NS87	1388 aa		42.13	■■■■■ 4.33
KCTD17-209	ENST00000610767	NAIP	Q13075	1403 aa		42.12	■■■■■ 4.33
KCTD17-209	ENST00000610767	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		42.12	■■■■■ 4.33
KCTD17-209	ENST00000610767	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		42.12	■■■■■ 4.33
KCTD17-209	ENST00000610767	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		42.07	■■■■■ 4.33
KCTD17-209	ENST00000610767	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		42.01	■■■■■ 4.32
KCTD17-209	ENST00000610767	A2M	P01023	1474 aa		41.99	■■■■■ 4.31
KCTD17-209	ENST00000610767	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		41.97	■■■■■ 4.31
KCTD17-209	ENST00000610767	RERE	Q9P2R6	1566 aa		41.97	■■■■■ 4.31
KCTD17-209	ENST00000610767	ATP10A	O60312	1499 aa		41.97	■■■■■ 4.31
KCTD17-209	ENST00000610767	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		41.96	■■■■■ 4.31
KCTD17-209	ENST00000610767	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	41.95	■■■■■ 4.31
KCTD17-209	ENST00000610767	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	41.92	■■■■■ 4.3
KCTD17-209	ENST00000610767	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		41.9	■■■■■ 4.3
KCTD17-209	ENST00000610767	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		41.87	■■■■■ 4.29
KCTD17-209	ENST00000610767	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		41.87	■■■■■ 4.29
KCTD17-209	ENST00000610767	AGL	P35573	1532 aa		41.79	■■■■■ 4.28
KCTD17-209	ENST00000610767	DEPDC5	O75140	1603 aa		41.78	■■■■■ 4.28
KCTD17-209	ENST00000610767	UNC13B	O14795	1591 aa		41.77	■■■■■ 4.28
KCTD17-209	ENST00000610767	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	41.77	■■■■■ 4.28
KCTD17-209	ENST00000610767	HRC	P23327	699 aa		41.75	■■■■■ 4.27

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