RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609445.5

SGMS1-209, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 594 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-209ENST00000609445 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.15■■□□□ 1.78
SGMS1-209ENST00000609445 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.14■■□□□ 1.77
SGMS1-209ENST00000609445 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.14■■□□□ 1.77
SGMS1-209ENST00000609445 CLIP1P30622 1438 aa26.13■■□□□ 1.77
SGMS1-209ENST00000609445 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.13■■□□□ 1.77
SGMS1-209ENST00000609445 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.12■■□□□ 1.77
SGMS1-209ENST00000609445 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.11■■□□□ 1.77
SGMS1-209ENST00000609445 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.08■■□□□ 1.77
SGMS1-209ENST00000609445 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
SGMS1-209ENST00000609445 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.08■■□□□ 1.77
SGMS1-209ENST00000609445 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.07■■□□□ 1.76
SGMS1-209ENST00000609445 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.05■■□□□ 1.76
SGMS1-209ENST00000609445 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.04■■□□□ 1.76
SGMS1-209ENST00000609445 PREX2Q70Z35 1606 aa26■■□□□ 1.75
SGMS1-209ENST00000609445 MLECQ14165 292 aa25.99■■□□□ 1.75
SGMS1-209ENST00000609445 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.98■■□□□ 1.75
SGMS1-209ENST00000609445 AFAP1Q8N556 730 aa25.98■■□□□ 1.75
SGMS1-209ENST00000609445 ATP10AO60312 1499 aa25.98■■□□□ 1.75
SGMS1-209ENST00000609445 KDM5CP41229 1560 aa25.96■■□□□ 1.75
SGMS1-209ENST00000609445 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.96■■□□□ 1.75
SGMS1-209ENST00000609445 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.95■■□□□ 1.74
SGMS1-209ENST00000609445 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.95■■□□□ 1.74
SGMS1-209ENST00000609445 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.94■■□□□ 1.74
SGMS1-209ENST00000609445 ABCC1P33527 1531 aa25.92■■□□□ 1.74
SGMS1-209ENST00000609445 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.92■■□□□ 1.74
SGMS1-209ENST00000609445 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.91■■□□□ 1.74
SGMS1-209ENST00000609445 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
SGMS1-209ENST00000609445 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.9■■□□□ 1.74
SGMS1-209ENST00000609445 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.9■■□□□ 1.74
SGMS1-209ENST00000609445 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.89■■□□□ 1.74
SGMS1-209ENST00000609445 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.89■■□□□ 1.73
SGMS1-209ENST00000609445 ABCA6Q8N139 1617 aa25.87■■□□□ 1.73
SGMS1-209ENST00000609445 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.85■■□□□ 1.73
SGMS1-209ENST00000609445 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
SGMS1-209ENST00000609445 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.72
SGMS1-209ENST00000609445 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.82■■□□□ 1.72
SGMS1-209ENST00000609445 CEP162Q5TB80 1403 aa25.81■■□□□ 1.72
SGMS1-209ENST00000609445 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.8■■□□□ 1.72
SGMS1-209ENST00000609445 REREQ9P2R6 1566 aa25.79■■□□□ 1.72
SGMS1-209ENST00000609445 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.78■■□□□ 1.72
SGMS1-209ENST00000609445 HSPA2P54652 639 aa25.78■■□□□ 1.72
SGMS1-209ENST00000609445 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.78■■□□□ 1.72
SGMS1-209ENST00000609445 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
SGMS1-209ENST00000609445 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.75■■□□□ 1.71
SGMS1-209ENST00000609445 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.74■■□□□ 1.712e-6■■■■□ 21.2
SGMS1-209ENST00000609445 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
SGMS1-209ENST00000609445 AGLP35573 1532 aa25.72■■□□□ 1.71
SGMS1-209ENST00000609445 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.7■■□□□ 1.7
SGMS1-209ENST00000609445 TIAM1Q13009 1591 aa25.69■■□□□ 1.7
SGMS1-209ENST00000609445 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.68■■□□□ 1.7
SGMS1-209ENST00000609445 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
SGMS1-209ENST00000609445 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.66■■□□□ 1.7
SGMS1-209ENST00000609445 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.66■■□□□ 1.7
SGMS1-209ENST00000609445 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.66■■□□□ 1.7
SGMS1-209ENST00000609445 C3P01024 1663 aa25.65■■□□□ 1.7
SGMS1-209ENST00000609445 ATP7AQ04656 1500 aa25.64■■□□□ 1.7
SGMS1-209ENST00000609445 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
SGMS1-209ENST00000609445 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
SGMS1-209ENST00000609445 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
SGMS1-209ENST00000609445 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
SGMS1-209ENST00000609445 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
SGMS1-209ENST00000609445 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.56■■□□□ 1.68
SGMS1-209ENST00000609445 PLXNC1O60486 1568 aa25.56■■□□□ 1.68
SGMS1-209ENST00000609445 A2MP01023 1474 aa25.55■■□□□ 1.68
SGMS1-209ENST00000609445 NCOA2Q15596 1464 aa25.55■■□□□ 1.68
SGMS1-209ENST00000609445 MBD5Q9P267 1494 aa25.55■■□□□ 1.68
SGMS1-209ENST00000609445 FBXO41Q8TF61 875 aa25.55■■□□□ 1.68
SGMS1-209ENST00000609445 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.54■■□□□ 1.68
SGMS1-209ENST00000609445 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.52■■□□□ 1.68
SGMS1-209ENST00000609445 STRCQ7RTU9 1775 aa25.51■■□□□ 1.67
SGMS1-209ENST00000609445 MROH2AA6NES4 1674 aa25.51■■□□□ 1.67
SGMS1-209ENST00000609445 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.51■■□□□ 1.67
SGMS1-209ENST00000609445 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
SGMS1-209ENST00000609445 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.48■■□□□ 1.67
SGMS1-209ENST00000609445 ZMYM3Q14202 1370 aa25.45■■□□□ 1.67
SGMS1-209ENST00000609445 GGT6Q6P531 493 aa25.45■■□□□ 1.66
SGMS1-209ENST00000609445 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.45■■□□□ 1.66
SGMS1-209ENST00000609445 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.44■■□□□ 1.66
SGMS1-209ENST00000609445 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.43■■□□□ 1.66
SGMS1-209ENST00000609445 NPATQ14207 1427 aa25.4■■□□□ 1.66
SGMS1-209ENST00000609445 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
SGMS1-209ENST00000609445 CERKQ8TCT0 537 aa25.38■■□□□ 1.65
SGMS1-209ENST00000609445 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
SGMS1-209ENST00000609445 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.36■■□□□ 1.65
SGMS1-209ENST00000609445 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.36■■□□□ 1.65
SGMS1-209ENST00000609445 MAP3K1Q13233 1512 aa25.35■■□□□ 1.65
SGMS1-209ENST00000609445 PTPRKQ15262 1439 aa25.34■■□□□ 1.65
SGMS1-209ENST00000609445 NCOA1Q15788 1441 aa25.33■■□□□ 1.65
SGMS1-209ENST00000609445 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.33■■□□□ 1.65
SGMS1-209ENST00000609445 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.33■■□□□ 1.65
SGMS1-209ENST00000609445 KIF3BO15066 747 aa25.32■■□□□ 1.64
SGMS1-209ENST00000609445 PTPRTO14522 1441 aa25.31■■□□□ 1.64
SGMS1-209ENST00000609445 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.31■■□□□ 1.64
SGMS1-209ENST00000609445 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.31■■□□□ 1.64
SGMS1-209ENST00000609445 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
SGMS1-209ENST00000609445 TSPY4P0CV99 314 aa25.28■■□□□ 1.64
SGMS1-209ENST00000609445 TSPY10P0CW01 314 aa25.28■■□□□ 1.64
SGMS1-209ENST00000609445 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.27■■□□□ 1.64
SGMS1-209ENST00000609445 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
SGMS1-209ENST00000609445 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.2 ms