RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607561.1

RNU6-87P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 87, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-87P, Length 108 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-87P-201ENST00000607561 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa8.9□□□□□ -0.98
RNU6-87P-201ENST00000607561 TMEM92Q6UXU6 159 aa8.89□□□□□ -0.99
RNU6-87P-201ENST00000607561 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
RNU6-87P-201ENST00000607561 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
RNU6-87P-201ENST00000607561 MFSD10Q14728 455 aa8.86□□□□□ -0.99
RNU6-87P-201ENST00000607561 KIF3CO14782 793 aa8.85□□□□□ -0.99
RNU6-87P-201ENST00000607561 WDR70Q9NW82 654 aa8.85□□□□□ -0.99
RNU6-87P-201ENST00000607561 C2orf72A6NCS6 295 aa8.84□□□□□ -0.99
RNU6-87P-201ENST00000607561 C3orf67Q6ZVT6 689 aa8.84□□□□□ -0.99
RNU6-87P-201ENST00000607561 TMC2Q8TDI7 906 aa8.83□□□□□ -1
RNU6-87P-201ENST00000607561 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
RNU6-87P-201ENST00000607561 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
RNU6-87P-201ENST00000607561 DSG2Q14126 1118 aa8.81□□□□□ -1
RNU6-87P-201ENST00000607561 FOXK1P85037 733 aa8.8□□□□□ -1
RNU6-87P-201ENST00000607561 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa8.79□□□□□ -1
RNU6-87P-201ENST00000607561 E2F4Q16254 413 aa8.78□□□□□ -1
RNU6-87P-201ENST00000607561 PLPP6Q8IY26 295 aa8.78□□□□□ -1
RNU6-87P-201ENST00000607561 LHX8Q68G74 356 aa8.77□□□□□ -1.01
RNU6-87P-201ENST00000607561 MAMSTRQ6ZN01 415 aa8.77□□□□□ -1.01
RNU6-87P-201ENST00000607561 CAMK2BQ13554 666 aa8.76□□□□□ -1.01
RNU6-87P-201ENST00000607561 SCUBE2Q9NQ36 999 aa8.76□□□□□ -1.01
RNU6-87P-201ENST00000607561 KCNV2Q8TDN2 545 aa8.75□□□□□ -1.01
RNU6-87P-201ENST00000607561 OTUD5Q96G74 571 aa8.75□□□□□ -1.01
RNU6-87P-201ENST00000607561 SLAIN1Q8ND83 568 aa8.74□□□□□ -1.01
RNU6-87P-201ENST00000607561 EMILIN3Q9NT22 766 aa8.72□□□□□ -1.01
RNU6-87P-201ENST00000607561 P3H3Q8IVL6 736 aa8.71□□□□□ -1.02
RNU6-87P-201ENST00000607561 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RNU6-87P-201ENST00000607561 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
RNU6-87P-201ENST00000607561 SLC34A2O95436 690 aa8.66□□□□□ -1.02
RNU6-87P-201ENST00000607561 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RNU6-87P-201ENST00000607561 OXER1Q8TDS5 423 aa8.66□□□□□ -1.02
RNU6-87P-201ENST00000607561 DPYSL4O14531 572 aa8.65□□□□□ -1.02
RNU6-87P-201ENST00000607561 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
RNU6-87P-201ENST00000607561 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP8.65□□□□□ -1.02
RNU6-87P-201ENST00000607561 BCANQ96GW7 911 aa8.65□□□□□ -1.02
RNU6-87P-201ENST00000607561 MAP3K9P80192 1104 aa8.62□□□□□ -1.03
RNU6-87P-201ENST00000607561 NBR1Q14596 966 aa8.62□□□□□ -1.03
RNU6-87P-201ENST00000607561 DOK7Q18PE1 504 aa8.6□□□□□ -1.03
RNU6-87P-201ENST00000607561 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa8.6□□□□□ -1.03
RNU6-87P-201ENST00000607561 SEMA3EO15041 775 aa8.59□□□□□ -1.03
RNU6-87P-201ENST00000607561 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
RNU6-87P-201ENST00000607561 SNPHO15079 494 aa8.58□□□□□ -1.04
RNU6-87P-201ENST00000607561 TBC1D12O60347 775 aa8.58□□□□□ -1.04
RNU6-87P-201ENST00000607561 PDIA6Q15084 440 aa8.58□□□□□ -1.04
RNU6-87P-201ENST00000607561 GPR153Q6NV75 609 aa8.58□□□□□ -1.04
RNU6-87P-201ENST00000607561 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP8.58□□□□□ -1.04
RNU6-87P-201ENST00000607561 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa8.57□□□□□ -1.04
RNU6-87P-201ENST00000607561 ARSIQ5FYB1 569 aa8.57□□□□□ -1.04
RNU6-87P-201ENST00000607561 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
RNU6-87P-201ENST00000607561 EVI5O60447 810 aa8.56□□□□□ -1.04
RNU6-87P-201ENST00000607561 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa8.55□□□□□ -1.04
RNU6-87P-201ENST00000607561 RIMBP2O15034 1052 aa8.54□□□□□ -1.04
RNU6-87P-201ENST00000607561 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZNF710Q8N1W2 664 aa8.54□□□□□ -1.04
RNU6-87P-201ENST00000607561 NUDT7P0C024 238 aa8.52□□□□□ -1.05
RNU6-87P-201ENST00000607561 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
RNU6-87P-201ENST00000607561 PTGER2P43116 358 aa8.51□□□□□ -1.05
RNU6-87P-201ENST00000607561 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
RNU6-87P-201ENST00000607561 GRXCR2A6NFK2 248 aa8.49□□□□□ -1.05
RNU6-87P-201ENST00000607561 ST18O60284 1047 aa8.49□□□□□ -1.05
RNU6-87P-201ENST00000607561 DDX12PQ92771 950 aa8.49□□□□□ -1.05
RNU6-87P-201ENST00000607561 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
RNU6-87P-201ENST00000607561 OSBPP22059 807 aa8.46□□□□□ -1.06
RNU6-87P-201ENST00000607561 SMYD5Q6GMV2 418 aa8.46□□□□□ -1.06
RNU6-87P-201ENST00000607561 LHX6Q9UPM6 363 aa8.46□□□□□ -1.06
RNU6-87P-201ENST00000607561 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
RNU6-87P-201ENST00000607561 PHF14O94880 888 aa8.44□□□□□ -1.06
RNU6-87P-201ENST00000607561 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
RNU6-87P-201ENST00000607561 LMOD2Q6P5Q4 547 aa8.44□□□□□ -1.06
RNU6-87P-201ENST00000607561 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa8.44□□□□□ -1.06
RNU6-87P-201ENST00000607561 FOSBP53539 338 aa8.43□□□□□ -1.06
RNU6-87P-201ENST00000607561 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RNU6-87P-201ENST00000607561 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
RNU6-87P-201ENST00000607561 MARVELD3Q96A59 401 aa8.42□□□□□ -1.06
RNU6-87P-201ENST00000607561 JPH4Q96JJ6 628 aa8.42□□□□□ -1.06
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZNF454Q8N9F8 522 aa8.41□□□□□ -1.06
RNU6-87P-201ENST00000607561 EPAS1Q99814 870 aa8.41□□□□□ -1.06
RNU6-87P-201ENST00000607561 TYW1BQ6NUM6 668 aa8.4□□□□□ -1.06
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZDHHC16Q969W1 377 aa8.38□□□□□ -1.07
RNU6-87P-201ENST00000607561 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RNU6-87P-201ENST00000607561 ERBB3P21860 1342 aa8.37□□□□□ -1.07
RNU6-87P-201ENST00000607561 POTEB3A0JP26 581 aa8.37□□□□□ -1.07
RNU6-87P-201ENST00000607561 EMP3P54852 163 aa8.37□□□□□ -1.07
RNU6-87P-201ENST00000607561 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
RNU6-87P-201ENST00000607561 POTEBQ6S5H4 581 aa8.37□□□□□ -1.07
RNU6-87P-201ENST00000607561 FBXW7Q969H0 707 aa8.37□□□□□ -1.07
RNU6-87P-201ENST00000607561 ADAM33Q9BZ11 813 aa8.37□□□□□ -1.07
RNU6-87P-201ENST00000607561 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
RNU6-87P-201ENST00000607561 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
RNU6-87P-201ENST00000607561 TPRNQ4KMQ1 711 aa8.36□□□□□ -1.07
RNU6-87P-201ENST00000607561 FAM205CA6NFA0 338 aa8.35□□□□□ -1.07
RNU6-87P-201ENST00000607561 MAP3K7O43318 606 aa8.35□□□□□ -1.07
RNU6-87P-201ENST00000607561 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RNU6-87P-201ENST00000607561 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa8.35□□□□□ -1.07
RNU6-87P-201ENST00000607561 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RNU6-87P-201ENST00000607561 NUTM2FA1L443 756 aa8.34□□□□□ -1.07
RNU6-87P-201ENST00000607561 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms