RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604499.6

PGPEP1-209, Transcript of pyroglutamyl-peptidase I, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PGPEP1, Length 769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1-209ENST00000604499 MIA2Q96PC5 1412 aa26.12■■□□□ 1.77
PGPEP1-209ENST00000604499 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
PGPEP1-209ENST00000604499 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.1■■□□□ 1.77
PGPEP1-209ENST00000604499 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.1■■□□□ 1.77
PGPEP1-209ENST00000604499 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.1■■□□□ 1.77
PGPEP1-209ENST00000604499 FANCAO15360 1455 aa26.08■■□□□ 1.77
PGPEP1-209ENST00000604499 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.05■■□□□ 1.76
PGPEP1-209ENST00000604499 NEO1Q92859 1461 aa26.05■■□□□ 1.76
PGPEP1-209ENST00000604499 TSPOAP1O95153 1857 aa26.04■■□□□ 1.76
PGPEP1-209ENST00000604499 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
PGPEP1-209ENST00000604499 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
PGPEP1-209ENST00000604499 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
PGPEP1-209ENST00000604499 AKNAQ7Z591 1439 aa26.03■■□□□ 1.76
PGPEP1-209ENST00000604499 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
PGPEP1-209ENST00000604499 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.03■■□□□ 1.76
PGPEP1-209ENST00000604499 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.01■■□□□ 1.75
PGPEP1-209ENST00000604499 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.01■■□□□ 1.75
PGPEP1-209ENST00000604499 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.99■■□□□ 1.75
PGPEP1-209ENST00000604499 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.97■■□□□ 1.75
PGPEP1-209ENST00000604499 ABCC1P33527 1531 aa25.97■■□□□ 1.75
PGPEP1-209ENST00000604499 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.97■■□□□ 1.75
PGPEP1-209ENST00000604499 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.96■■□□□ 1.75
PGPEP1-209ENST00000604499 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.95■■□□□ 1.75
PGPEP1-209ENST00000604499 ADGRL1O94910 1474 aa25.95■■□□□ 1.74
PGPEP1-209ENST00000604499 MBD5Q9P267 1494 aa25.94■■□□□ 1.74
PGPEP1-209ENST00000604499 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.94■■□□□ 1.74
PGPEP1-209ENST00000604499 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.92■■□□□ 1.74
PGPEP1-209ENST00000604499 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
PGPEP1-209ENST00000604499 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.92■■□□□ 1.74
PGPEP1-209ENST00000604499 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.73
PGPEP1-209ENST00000604499 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.88■■□□□ 1.73
PGPEP1-209ENST00000604499 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
PGPEP1-209ENST00000604499 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.86■■□□□ 1.73
PGPEP1-209ENST00000604499 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.85■■□□□ 1.73
PGPEP1-209ENST00000604499 ABCC5O15440 1437 aa25.84■■□□□ 1.73
PGPEP1-209ENST00000604499 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.84■■□□□ 1.73
PGPEP1-209ENST00000604499 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.84■■□□□ 1.73
PGPEP1-209ENST00000604499 RAPGEF3O95398 923 aa25.83■■□□□ 1.73
PGPEP1-209ENST00000604499 DAPK1P53355 1430 aa25.82■■□□□ 1.72
PGPEP1-209ENST00000604499 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
PGPEP1-209ENST00000604499 AFAP1Q8N556 730 aa25.82■■□□□ 1.72
PGPEP1-209ENST00000604499 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.81■■□□□ 1.72
PGPEP1-209ENST00000604499 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.8■■□□□ 1.72
PGPEP1-209ENST00000604499 RICTORQ6R327 1708 aa25.79■■□□□ 1.72
PGPEP1-209ENST00000604499 PTPRKQ15262 1439 aa25.79■■□□□ 1.72
PGPEP1-209ENST00000604499 KDM5CP41229 1560 aa25.78■■□□□ 1.72
PGPEP1-209ENST00000604499 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
PGPEP1-209ENST00000604499 KDM6BO15054 1643 aa25.76■■□□□ 1.71
PGPEP1-209ENST00000604499 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.75■■□□□ 1.71
PGPEP1-209ENST00000604499 TSPY4P0CV99 314 aa25.73■■□□□ 1.71
PGPEP1-209ENST00000604499 TSPY10P0CW01 314 aa25.73■■□□□ 1.71
PGPEP1-209ENST00000604499 ITGAEP38570 1179 aa25.73■■□□□ 1.71
PGPEP1-209ENST00000604499 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.73■■□□□ 1.71
PGPEP1-209ENST00000604499 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.73■■□□□ 1.71
PGPEP1-209ENST00000604499 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.73■■□□□ 1.71
PGPEP1-209ENST00000604499 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
PGPEP1-209ENST00000604499 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.72■■□□□ 1.71
PGPEP1-209ENST00000604499 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.71■■□□□ 1.71
PGPEP1-209ENST00000604499 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.71■■□□□ 1.71
PGPEP1-209ENST00000604499 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
PGPEP1-209ENST00000604499 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.68■■□□□ 1.7
PGPEP1-209ENST00000604499 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.68■■□□□ 1.7
PGPEP1-209ENST00000604499 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.67■■□□□ 1.7
PGPEP1-209ENST00000604499 ADGRL2O95490 1459 aa25.66■■□□□ 1.7
PGPEP1-209ENST00000604499 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.66■■□□□ 1.7
PGPEP1-209ENST00000604499 ATP7AQ04656 1500 aa25.66■■□□□ 1.7
PGPEP1-209ENST00000604499 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.65■■□□□ 1.7
PGPEP1-209ENST00000604499 ROCK1Q13464 1354 aa25.65■■□□□ 1.7
PGPEP1-209ENST00000604499 NCOA1Q15788 1441 aa25.64■■□□□ 1.7
PGPEP1-209ENST00000604499 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.63■■□□□ 1.69
PGPEP1-209ENST00000604499 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.61■■□□□ 1.69
PGPEP1-209ENST00000604499 PLXNC1O60486 1568 aa25.6■■□□□ 1.69
PGPEP1-209ENST00000604499 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.59■■□□□ 1.69
PGPEP1-209ENST00000604499 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.59■■□□□ 1.69
PGPEP1-209ENST00000604499 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.58■■□□□ 1.69
PGPEP1-209ENST00000604499 ABCA6Q8N139 1617 aa25.58■■□□□ 1.69
PGPEP1-209ENST00000604499 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.57■■□□□ 1.68
PGPEP1-209ENST00000604499 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.56■■□□□ 1.68
PGPEP1-209ENST00000604499 KIF15Q9NS87 1388 aa25.56■■□□□ 1.68
PGPEP1-209ENST00000604499 HFM1A2PYH4 1435 aa25.53■■□□□ 1.68
PGPEP1-209ENST00000604499 NAIPQ13075 1403 aa25.53■■□□□ 1.68
PGPEP1-209ENST00000604499 ATP10AO60312 1499 aa25.53■■□□□ 1.68
PGPEP1-209ENST00000604499 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
PGPEP1-209ENST00000604499 A2MP01023 1474 aa25.51■■□□□ 1.67
PGPEP1-209ENST00000604499 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.51■■□□□ 1.67
PGPEP1-209ENST00000604499 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.5■■□□□ 1.67
PGPEP1-209ENST00000604499 REREQ9P2R6 1566 aa25.48■■□□□ 1.67
PGPEP1-209ENST00000604499 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.46■■□□□ 1.67
PGPEP1-209ENST00000604499 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.45■■□□□ 1.66
PGPEP1-209ENST00000604499 ERBINQ96RT1 1412 aa25.45■■□□□ 1.66
PGPEP1-209ENST00000604499 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.44■■□□□ 1.66
PGPEP1-209ENST00000604499 AGLP35573 1532 aa25.41■■□□□ 1.66
PGPEP1-209ENST00000604499 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.4■■□□□ 1.66
PGPEP1-209ENST00000604499 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
PGPEP1-209ENST00000604499 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.37■■□□□ 1.65
PGPEP1-209ENST00000604499 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.35■■□□□ 1.65
PGPEP1-209ENST00000604499 KIF3BO15066 747 aa25.35■■□□□ 1.65
PGPEP1-209ENST00000604499 HRCP23327 699 aa25.33■■□□□ 1.65
PGPEP1-209ENST00000604499 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
PGPEP1-209ENST00000604499 DEPDC5O75140 1603 aa25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.9 ms