RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000603448.1

AP002365.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AP002365.1, Length 772 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP002365.1-201ENST00000603448 SCAPERQ9BY12 1400 aa47.24■■■■■ 5.15
AP002365.1-201ENST00000603448 MAGI2Q86UL8 1455 aa47.24■■■■■ 5.15
AP002365.1-201ENST00000603448 POGZQ7Z3K3 1410 aa47.23■■■■■ 5.15
AP002365.1-201ENST00000603448 MADDQ8WXG6 1647 aa47.21■■■■■ 5.15
AP002365.1-201ENST00000603448 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP47.21■■■■■ 5.15
AP002365.1-201ENST00000603448 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa47.2■■■■■ 5.15
AP002365.1-201ENST00000603448 PTPRMP28827 1452 aa47.2■■■■■ 5.15
AP002365.1-201ENST00000603448 FYCO1Q9BQS8 1478 aa47.19■■■■■ 5.14
AP002365.1-201ENST00000603448 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa47.16■■■■■ 5.14
AP002365.1-201ENST00000603448 ARHGAP5Q13017 1502 aa47.16■■■■■ 5.14
AP002365.1-201ENST00000603448 YEATS2Q9ULM3 1422 aa47.15■■■■■ 5.14
AP002365.1-201ENST00000603448 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa47.14■■■■■ 5.14
AP002365.1-201ENST00000603448 PREX2Q70Z35 1606 aa47.09■■■■■ 5.13
AP002365.1-201ENST00000603448 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP47.08■■■■■ 5.13
AP002365.1-201ENST00000603448 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa47.02■■■■■ 5.12
AP002365.1-201ENST00000603448 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa47■■■■■ 5.11
AP002365.1-201ENST00000603448 KDM5CP41229 1560 aa47■■■■■ 5.11
AP002365.1-201ENST00000603448 ATP10AO60312 1499 aa46.95■■■■■ 5.11
AP002365.1-201ENST00000603448 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa46.92■■■■■ 5.1
AP002365.1-201ENST00000603448 C9orf84Q5VXU9 1444 aa46.92■■■■■ 5.1
AP002365.1-201ENST00000603448 ITSN2Q9NZM3 1697 aa46.9■■■■■ 5.1
AP002365.1-201ENST00000603448 ABCC1P33527 1531 aa46.9■■■■■ 5.1
AP002365.1-201ENST00000603448 AFAP1Q8N556 730 aa46.84■■■■■ 5.09
AP002365.1-201ENST00000603448 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa46.8■■■■■ 5.08
AP002365.1-201ENST00000603448 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa46.79■■■■■ 5.08
AP002365.1-201ENST00000603448 MLH3Q9UHC1 1453 aa46.76■■■■■ 5.08
AP002365.1-201ENST00000603448 MLECQ14165 292 aa46.76■■■■■ 5.08
AP002365.1-201ENST00000603448 ABCA6Q8N139 1617 aa46.76■■■■■ 5.08
AP002365.1-201ENST00000603448 REREQ9P2R6 1566 aa46.75■■■■■ 5.07
AP002365.1-201ENST00000603448 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa46.74■■■■■ 5.07
AP002365.1-201ENST00000603448 CEP162Q5TB80 1403 aa46.73■■■■■ 5.07
AP002365.1-201ENST00000603448 LMTK3Q96Q04 1460 aa46.72■■■■■ 5.07
AP002365.1-201ENST00000603448 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP46.71■■■■■ 5.07
AP002365.1-201ENST00000603448 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa46.71■■■■■ 5.07
AP002365.1-201ENST00000603448 MYT1LQ9UL68 1186 aa46.7■■■■■ 5.07
AP002365.1-201ENST00000603448 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa46.67■■■■■ 5.06
AP002365.1-201ENST00000603448 MTUS2Q5JR59 1369 aa46.63■■■■■ 5.06
AP002365.1-201ENST00000603448 SYCP2Q9BX26 1530 aa46.61■■■■■ 5.05
AP002365.1-201ENST00000603448 PLPPR3Q6T4P5 718 aa46.6■■■■■ 5.05
AP002365.1-201ENST00000603448 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa46.59■■■■■ 5.05
AP002365.1-201ENST00000603448 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP46.57■■■■■ 5.05
AP002365.1-201ENST00000603448 AGLP35573 1532 aa46.56■■■■■ 5.04
AP002365.1-201ENST00000603448 CCNB3Q8WWL7 1395 aa46.56■■■■■ 5.04
AP002365.1-201ENST00000603448 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa46.51■■■■■ 5.04
AP002365.1-201ENST00000603448 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP46.5■■■■■ 5.03
AP002365.1-201ENST00000603448 TIAM1Q13009 1591 aa46.5■■■■■ 5.03
AP002365.1-201ENST00000603448 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP46.49■■■■■ 5.03
AP002365.1-201ENST00000603448 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa46.48■■■■■ 5.03
AP002365.1-201ENST00000603448 PREX1Q8TCU6 1659 aa46.46■■■■■ 5.03
AP002365.1-201ENST00000603448 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP46.42■■■■■ 5.02
AP002365.1-201ENST00000603448 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP46.41■■■■■ 5.02
AP002365.1-201ENST00000603448 ATP7AQ04656 1500 aa46.39■■■■■ 5.02
AP002365.1-201ENST00000603448 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP46.38■■■■■ 5.02
AP002365.1-201ENST00000603448 C3P01024 1663 aa46.37■■■■■ 5.01
AP002365.1-201ENST00000603448 HSPA2P54652 639 aa46.36■■■■■ 5.01
AP002365.1-201ENST00000603448 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP46.36■■■■■ 5.01
AP002365.1-201ENST00000603448 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP46.36■■■■■ 5.01
AP002365.1-201ENST00000603448 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP46.34■■■■■ 5.01
AP002365.1-201ENST00000603448 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa46.29■■■■■ 5
AP002365.1-201ENST00000603448 PLXNC1O60486 1568 aa46.26■■■■■ 5
AP002365.1-201ENST00000603448 VPS8Q8N3P4 1428 aa46.25■■■■■ 4.99
AP002365.1-201ENST00000603448 ADGBQ8N7X0 1667 aa46.24■■■■■ 4.99
AP002365.1-201ENST00000603448 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP46.24■■■■■ 4.99
AP002365.1-201ENST00000603448 NCOA2Q15596 1464 aa46.23■■■■■ 4.99
AP002365.1-201ENST00000603448 CNTLNQ9NXG0 1405 aa46.22■■■■■ 4.99
AP002365.1-201ENST00000603448 MROH2AA6NES4 1674 aa46.22■■■■■ 4.99
AP002365.1-201ENST00000603448 MBD5Q9P267 1494 aa46.21■■■■■ 4.99
AP002365.1-201ENST00000603448 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP46.21■■■■■ 4.99
AP002365.1-201ENST00000603448 A2MP01023 1474 aa46.2■■■■■ 4.99
AP002365.1-201ENST00000603448 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa46.18■■■■■ 4.98
AP002365.1-201ENST00000603448 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa46.1■■■■■ 4.97
AP002365.1-201ENST00000603448 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa46.09■■■■■ 4.97
AP002365.1-201ENST00000603448 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP46.08■■■■■ 4.97
AP002365.1-201ENST00000603448 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa46.08■■■■■ 4.97
AP002365.1-201ENST00000603448 STRCQ7RTU9 1775 aa46.07■■■■■ 4.96
AP002365.1-201ENST00000603448 MAP3K1Q13233 1512 aa46.04■■■■■ 4.96
AP002365.1-201ENST00000603448 CCDC141Q6ZP82 1450 aa46.04■■■■■ 4.96
AP002365.1-201ENST00000603448 FBXO41Q8TF61 875 aa46.01■■■■■ 4.96
AP002365.1-201ENST00000603448 ZMYM3Q14202 1370 aa45.96■■■■■ 4.95
AP002365.1-201ENST00000603448 ARHGEF5Q12774 1597 aa45.96■■■■■ 4.95
AP002365.1-201ENST00000603448 NPATQ14207 1427 aa45.96■■■■■ 4.95
AP002365.1-201ENST00000603448 RSPH4AQ5TD94 716 aa45.94■■■■■ 4.94
AP002365.1-201ENST00000603448 GGT6Q6P531 493 aa45.9■■■■■ 4.94
AP002365.1-201ENST00000603448 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP45.9■■■■■ 4.94
AP002365.1-201ENST00000603448 PPP6R1Q9UPN7 881 aa45.86■■■■■ 4.93
AP002365.1-201ENST00000603448 DMRT2Q9Y5R5 561 aa45.84■■■■■ 4.93
AP002365.1-201ENST00000603448 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP45.83■■■■■ 4.93
AP002365.1-201ENST00000603448 MYO3AQ8NEV4 1616 aa45.81■■■■■ 4.92
AP002365.1-201ENST00000603448 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP45.8■■■■■ 4.92
AP002365.1-201ENST00000603448 PTPRKQ15262 1439 aa45.77■■■■■ 4.92
AP002365.1-201ENST00000603448 MYOM3Q5VTT5 1437 aa45.76■■■■■ 4.92
AP002365.1-201ENST00000603448 MAST1Q9Y2H9 1570 aa45.75■■■■■ 4.92
AP002365.1-201ENST00000603448 MIA2Q96PC5 1412 aa45.75■■■■■ 4.91
AP002365.1-201ENST00000603448 FAM135AQ9P2D6 1515 aa45.73■■■■■ 4.91
AP002365.1-201ENST00000603448 PTPRTO14522 1441 aa45.73■■■■■ 4.91
AP002365.1-201ENST00000603448 TSPY4P0CV99 314 aa45.73■■■■■ 4.91
AP002365.1-201ENST00000603448 TSPY10P0CW01 314 aa45.73■■■■■ 4.91
AP002365.1-201ENST00000603448 NCOA1Q15788 1441 aa45.73■■■■■ 4.91
AP002365.1-201ENST00000603448 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa45.71■■■■■ 4.91
AP002365.1-201ENST00000603448 CERKQ8TCT0 537 aa45.71■■■■■ 4.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms