RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602028.5

TIMM50-218, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

TSL 5

Gene TIMM50, Length 770 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-218ENST00000602028 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa34.09■■■■□ 3.05
TIMM50-218ENST00000602028 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa34.09■■■■□ 3.05
TIMM50-218ENST00000602028 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.08■■■■□ 3.05
TIMM50-218ENST00000602028 SCAPERQ9BY12 1400 aa34.08■■■■□ 3.05
TIMM50-218ENST00000602028 MAGI2Q86UL8 1455 aa34.07■■■■□ 3.04
TIMM50-218ENST00000602028 POGZQ7Z3K3 1410 aa34.06■■■■□ 3.04
TIMM50-218ENST00000602028 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa34.06■■■■□ 3.04
TIMM50-218ENST00000602028 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.04■■■■□ 3.04
TIMM50-218ENST00000602028 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa34.03■■■■□ 3.04
TIMM50-218ENST00000602028 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa34.01■■■■□ 3.04
TIMM50-218ENST00000602028 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa34■■■■□ 3.03
TIMM50-218ENST00000602028 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa33.95■■■■□ 3.03
TIMM50-218ENST00000602028 CCNB3Q8WWL7 1395 aa33.94■■■■□ 3.02
TIMM50-218ENST00000602028 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP33.94■■■■□ 3.02
TIMM50-218ENST00000602028 ABCC1P33527 1531 aa33.93■■■■□ 3.02
TIMM50-218ENST00000602028 TIAM1Q13009 1591 aa33.93■■■■□ 3.02
TIMM50-218ENST00000602028 KDM5CP41229 1560 aa33.89■■■■□ 3.02
TIMM50-218ENST00000602028 MAP3K1Q13233 1512 aa33.89■■■■□ 3.02
TIMM50-218ENST00000602028 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa33.87■■■■□ 3.01
TIMM50-218ENST00000602028 ITSN2Q9NZM3 1697 aa33.87■■■■□ 3.01
TIMM50-218ENST00000602028 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP33.86■■■■□ 3.01
TIMM50-218ENST00000602028 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP33.85■■■■□ 3.01
TIMM50-218ENST00000602028 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP33.82■■■■□ 3.01
TIMM50-218ENST00000602028 YEATS2Q9ULM3 1422 aa33.82■■■■□ 3
TIMM50-218ENST00000602028 HECW2Q9P2P5 1572 aa33.81■■■■□ 3
TIMM50-218ENST00000602028 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa33.81■■■■□ 3
TIMM50-218ENST00000602028 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa33.8■■■■□ 3
TIMM50-218ENST00000602028 AFAP1Q8N556 730 aa33.8■■■■□ 3
TIMM50-218ENST00000602028 MLH3Q9UHC1 1453 aa33.8■■■■□ 3
TIMM50-218ENST00000602028 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP33.79■■■■□ 3
TIMM50-218ENST00000602028 ATP10AO60312 1499 aa33.79■■■■□ 3
TIMM50-218ENST00000602028 BCORL1Q5H9F3 1711 aa33.79■■■■□ 3
TIMM50-218ENST00000602028 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa33.78■■■■□ 3
TIMM50-218ENST00000602028 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa33.77■■■■□ 3
TIMM50-218ENST00000602028 C9orf84Q5VXU9 1444 aa33.77■■■■□ 3
TIMM50-218ENST00000602028 NCOA2Q15596 1464 aa33.76■■■■□ 3
TIMM50-218ENST00000602028 ADAMTSL3P82987 1691 aa33.76■■■□□ 2.99
TIMM50-218ENST00000602028 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa33.75■■■□□ 2.99
TIMM50-218ENST00000602028 SYCP2Q9BX26 1530 aa33.74■■■□□ 2.99
TIMM50-218ENST00000602028 APLP2Q06481 763 aa33.73■■■□□ 2.99
TIMM50-218ENST00000602028 MYT1LQ9UL68 1186 aa33.73■■■□□ 2.99
TIMM50-218ENST00000602028 REREQ9P2R6 1566 aa33.69■■■□□ 2.98
TIMM50-218ENST00000602028 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa33.67■■■□□ 2.98
TIMM50-218ENST00000602028 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP33.63■■■□□ 2.97
TIMM50-218ENST00000602028 ABCA6Q8N139 1617 aa33.63■■■□□ 2.97
TIMM50-218ENST00000602028 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa33.62■■■□□ 2.97
TIMM50-218ENST00000602028 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP33.62■■■□□ 2.97
TIMM50-218ENST00000602028 MADDQ8WXG6 1647 aa33.61■■■□□ 2.97
TIMM50-218ENST00000602028 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa33.6■■■□□ 2.97
TIMM50-218ENST00000602028 PTPRMP28827 1452 aa33.6■■■□□ 2.97
TIMM50-218ENST00000602028 RSPH4AQ5TD94 716 aa33.58■■■□□ 2.97
TIMM50-218ENST00000602028 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP33.57■■■□□ 2.96
TIMM50-218ENST00000602028 AGLP35573 1532 aa33.56■■■□□ 2.96
TIMM50-218ENST00000602028 ATP7AQ04656 1500 aa33.56■■■□□ 2.96
TIMM50-218ENST00000602028 MBD5Q9P267 1494 aa33.56■■■□□ 2.96
TIMM50-218ENST00000602028 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP33.55■■■□□ 2.96
TIMM50-218ENST00000602028 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa33.55■■■□□ 2.96
TIMM50-218ENST00000602028 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP33.53■■■□□ 2.96
TIMM50-218ENST00000602028 MIA2Q96PC5 1412 aa33.52■■■□□ 2.96
TIMM50-218ENST00000602028 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP33.52■■■□□ 2.96
TIMM50-218ENST00000602028 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa33.51■■■□□ 2.95
TIMM50-218ENST00000602028 MYOM3Q5VTT5 1437 aa33.51■■■□□ 2.95
TIMM50-218ENST00000602028 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa33.5■■■□□ 2.95
TIMM50-218ENST00000602028 CCDC141Q6ZP82 1450 aa33.5■■■□□ 2.95
TIMM50-218ENST00000602028 MLECQ14165 292 aa33.47■■■□□ 2.95
TIMM50-218ENST00000602028 ARHGEF5Q12774 1597 aa33.47■■■□□ 2.95
TIMM50-218ENST00000602028 ADGBQ8N7X0 1667 aa33.43■■■□□ 2.94
TIMM50-218ENST00000602028 A2MP01023 1474 aa33.41■■■□□ 2.94
TIMM50-218ENST00000602028 PLXNC1O60486 1568 aa33.39■■■□□ 2.94
TIMM50-218ENST00000602028 TSPY4P0CV99 314 aa33.38■■■□□ 2.93
TIMM50-218ENST00000602028 TSPY10P0CW01 314 aa33.38■■■□□ 2.93
TIMM50-218ENST00000602028 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP33.36■■■□□ 2.93
TIMM50-218ENST00000602028 CNTLNQ9NXG0 1405 aa33.33■■■□□ 2.93
TIMM50-218ENST00000602028 MAST1Q9Y2H9 1570 aa33.29■■■□□ 2.92
TIMM50-218ENST00000602028 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP33.28■■■□□ 2.92
TIMM50-218ENST00000602028 PTPN23Q9H3S7 1636 aa33.27■■■□□ 2.92
TIMM50-218ENST00000602028 FGD6Q6ZV73 1430 aa33.27■■■□□ 2.92
TIMM50-218ENST00000602028 PPP6R1Q9UPN7 881 aa33.26■■■□□ 2.91
TIMM50-218ENST00000602028 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP33.22■■■□□ 2.91
TIMM50-218ENST00000602028 MROH2AA6NES4 1674 aa33.21■■■□□ 2.91
TIMM50-218ENST00000602028 SHANK2Q9UPX8 1470 aa33.19■■■□□ 2.9
TIMM50-218ENST00000602028 LMTK3Q96Q04 1460 aa33.18■■■□□ 2.9
TIMM50-218ENST00000602028 PLPPR3Q6T4P5 718 aa33.18■■■□□ 2.9
TIMM50-218ENST00000602028 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP33.18■■■□□ 2.9
TIMM50-218ENST00000602028 C3P01024 1663 aa33.17■■■□□ 2.9
TIMM50-218ENST00000602028 FAM135AQ9P2D6 1515 aa33.16■■■□□ 2.9
TIMM50-218ENST00000602028 CROCC2H7BZ55 1655 aa33.15■■■□□ 2.9
TIMM50-218ENST00000602028 PREX1Q8TCU6 1659 aa33.14■■■□□ 2.9
TIMM50-218ENST00000602028 GGT6Q6P531 493 aa33.14■■■□□ 2.9
TIMM50-218ENST00000602028 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP33.13■■■□□ 2.89
TIMM50-218ENST00000602028 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP33.11■■■□□ 2.89
TIMM50-218ENST00000602028 ABCC5O15440 1437 aa33.1■■■□□ 2.89
TIMM50-218ENST00000602028 DAPK1P53355 1430 aa33.1■■■□□ 2.89
TIMM50-218ENST00000602028 KIF3BO15066 747 aa33.09■■■□□ 2.89
TIMM50-218ENST00000602028 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP33.08■■■□□ 2.89
TIMM50-218ENST00000602028 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP33.08■■■□□ 2.89
TIMM50-218ENST00000602028 NPATQ14207 1427 aa33.08■■■□□ 2.89
TIMM50-218ENST00000602028 ZMYM3Q14202 1370 aa33.08■■■□□ 2.89
TIMM50-218ENST00000602028 DUOX2Q9NRD8 1548 aa33.07■■■□□ 2.88
TIMM50-218ENST00000602028 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa33.05■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.7 ms