RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601816.3

PNKP-216, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, humanhuman

TSL 3

Gene PNKP, Length 682 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKP-216ENST00000601816 POGZQ7Z3K3 1410 aa41.96■■■■■ 4.31
PNKP-216ENST00000601816 CEP162Q5TB80 1403 aa41.95■■■■■ 4.31
PNKP-216ENST00000601816 MAGI2Q86UL8 1455 aa41.91■■■■■ 4.3
PNKP-216ENST00000601816 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa41.9■■■■■ 4.3
PNKP-216ENST00000601816 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP41.9■■■■■ 4.3
PNKP-216ENST00000601816 YEATS2Q9ULM3 1422 aa41.86■■■■■ 4.29
PNKP-216ENST00000601816 PREX2Q70Z35 1606 aa41.85■■■■■ 4.29
PNKP-216ENST00000601816 ADAMTSL3P82987 1691 aa41.84■■■■■ 4.29
PNKP-216ENST00000601816 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.83■■■■■ 4.29
PNKP-216ENST00000601816 BCORL1Q5H9F3 1711 aa41.82■■■■■ 4.29
PNKP-216ENST00000601816 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa41.79■■■■■ 4.28
PNKP-216ENST00000601816 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.74■■■■■ 4.27
PNKP-216ENST00000601816 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.73■■■■■ 4.27
PNKP-216ENST00000601816 MTUS2Q5JR59 1369 aa41.72■■■■■ 4.27
PNKP-216ENST00000601816 KDM5CP41229 1560 aa41.71■■■■■ 4.27
PNKP-216ENST00000601816 ABCC1P33527 1531 aa41.7■■■■■ 4.27
PNKP-216ENST00000601816 AFAP1Q8N556 730 aa41.7■■■■■ 4.27
PNKP-216ENST00000601816 PTPRMP28827 1452 aa41.7■■■■■ 4.27
PNKP-216ENST00000601816 MADDQ8WXG6 1647 aa41.69■■■■■ 4.27
PNKP-216ENST00000601816 ATP10AO60312 1499 aa41.66■■■■■ 4.26
PNKP-216ENST00000601816 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa41.65■■■■■ 4.26
PNKP-216ENST00000601816 HECW2Q9P2P5 1572 aa41.65■■■■■ 4.26
PNKP-216ENST00000601816 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP41.64■■■■■ 4.26
PNKP-216ENST00000601816 C9orf84Q5VXU9 1444 aa41.63■■■■■ 4.26
PNKP-216ENST00000601816 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.63■■■■■ 4.25
PNKP-216ENST00000601816 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.61■■■■■ 4.25
PNKP-216ENST00000601816 MYT1LQ9UL68 1186 aa41.61■■■■■ 4.25
PNKP-216ENST00000601816 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa41.61■■■■■ 4.25
PNKP-216ENST00000601816 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa41.59■■■■■ 4.25
PNKP-216ENST00000601816 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.59■■■■■ 4.25
PNKP-216ENST00000601816 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.59■■■■■ 4.25
PNKP-216ENST00000601816 MLH3Q9UHC1 1453 aa41.56■■■■■ 4.24
PNKP-216ENST00000601816 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP41.55■■■■■ 4.24
PNKP-216ENST00000601816 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.55■■■■■ 4.24
PNKP-216ENST00000601816 MLECQ14165 292 aa41.53■■■■■ 4.24
PNKP-216ENST00000601816 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
PNKP-216ENST00000601816 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa41.51■■■■■ 4.24
PNKP-216ENST00000601816 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.49■■■■■ 4.23
PNKP-216ENST00000601816 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.49■■■■■ 4.23
PNKP-216ENST00000601816 ABCA6Q8N139 1617 aa41.47■■■■■ 4.23
PNKP-216ENST00000601816 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.46■■■■■ 4.23
PNKP-216ENST00000601816 TIAM1Q13009 1591 aa41.45■■■■■ 4.23
PNKP-216ENST00000601816 REREQ9P2R6 1566 aa41.44■■■■■ 4.22
PNKP-216ENST00000601816 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.43■■■■■ 4.22
PNKP-216ENST00000601816 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa41.41■■■■■ 4.22
PNKP-216ENST00000601816 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41.41■■■■■ 4.22
PNKP-216ENST00000601816 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.39■■■■■ 4.22
PNKP-216ENST00000601816 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP41.35■■■■■ 4.21
PNKP-216ENST00000601816 PLPPR3Q6T4P5 718 aa41.34■■■■■ 4.21
PNKP-216ENST00000601816 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP41.34■■■■■ 4.21
PNKP-216ENST00000601816 NCOA2Q15596 1464 aa41.33■■■■■ 4.21
PNKP-216ENST00000601816 AGLP35573 1532 aa41.31■■■■■ 4.2
PNKP-216ENST00000601816 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.27■■■■■ 4.2
PNKP-216ENST00000601816 ATP7AQ04656 1500 aa41.25■■■■■ 4.19
PNKP-216ENST00000601816 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa41.24■■■■■ 4.19
PNKP-216ENST00000601816 LMTK3Q96Q04 1460 aa41.23■■■■■ 4.19
PNKP-216ENST00000601816 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP41.23■■■■■ 4.19
PNKP-216ENST00000601816 MAP3K1Q13233 1512 aa41.21■■■■■ 4.19
PNKP-216ENST00000601816 MBD5Q9P267 1494 aa41.19■■■■■ 4.18
PNKP-216ENST00000601816 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.13■■■■■ 4.17
PNKP-216ENST00000601816 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP41.11■■■■■ 4.17
PNKP-216ENST00000601816 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP41.11■■■■■ 4.17
PNKP-216ENST00000601816 A2MP01023 1474 aa41.1■■■■■ 4.17
PNKP-216ENST00000601816 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.09■■■■■ 4.17
PNKP-216ENST00000601816 PLXNC1O60486 1568 aa41.07■■■■■ 4.16
PNKP-216ENST00000601816 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.05■■■■■ 4.16
PNKP-216ENST00000601816 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa41.05■■■■■ 4.16
PNKP-216ENST00000601816 CNTLNQ9NXG0 1405 aa41.03■■■■■ 4.16
PNKP-216ENST00000601816 ADGBQ8N7X0 1667 aa41.02■■■■■ 4.16
PNKP-216ENST00000601816 HSPA2P54652 639 aa41.01■■■■■ 4.16
PNKP-216ENST00000601816 RSPH4AQ5TD94 716 aa41.01■■■■■ 4.16
PNKP-216ENST00000601816 APLP2Q06481 763 aa41■■■■■ 4.15
PNKP-216ENST00000601816 C3P01024 1663 aa40.98■■■■■ 4.15
PNKP-216ENST00000601816 PREX1Q8TCU6 1659 aa40.98■■■■■ 4.15
PNKP-216ENST00000601816 ARHGEF5Q12774 1597 aa40.95■■■■■ 4.15
PNKP-216ENST00000601816 MYOM3Q5VTT5 1437 aa40.93■■■■■ 4.14
PNKP-216ENST00000601816 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa40.9■■■■■ 4.14
PNKP-216ENST00000601816 MIA2Q96PC5 1412 aa40.9■■■■■ 4.14
PNKP-216ENST00000601816 MROH2AA6NES4 1674 aa40.88■■■■■ 4.14
PNKP-216ENST00000601816 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP40.87■■■■■ 4.13
PNKP-216ENST00000601816 GGT6Q6P531 493 aa40.87■■■■■ 4.13
PNKP-216ENST00000601816 TSPY4P0CV99 314 aa40.86■■■■■ 4.13
PNKP-216ENST00000601816 TSPY10P0CW01 314 aa40.86■■■■■ 4.13
PNKP-216ENST00000601816 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP40.85■■■■■ 4.13
PNKP-216ENST00000601816 ZMYM3Q14202 1370 aa40.82■■■■■ 4.12
PNKP-216ENST00000601816 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP40.82■■■■■ 4.12
PNKP-216ENST00000601816 PPP6R1Q9UPN7 881 aa40.79■■■■■ 4.12
PNKP-216ENST00000601816 NPATQ14207 1427 aa40.76■■■■■ 4.12
PNKP-216ENST00000601816 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.74■■■■■ 4.11
PNKP-216ENST00000601816 KIF3BO15066 747 aa40.74■■■■■ 4.11
PNKP-216ENST00000601816 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP40.73■■■■■ 4.11
PNKP-216ENST00000601816 PTPN23Q9H3S7 1636 aa40.66■■■■■ 4.1
PNKP-216ENST00000601816 PTPRKQ15262 1439 aa40.63■■■■■ 4.09
PNKP-216ENST00000601816 FGD6Q6ZV73 1430 aa40.62■■■■■ 4.09
PNKP-216ENST00000601816 FAM135AQ9P2D6 1515 aa40.62■■■■■ 4.09
PNKP-216ENST00000601816 KDM5DQ9BY66 1539 aa40.59■■■■■ 4.09
PNKP-216ENST00000601816 STRCQ7RTU9 1775 aa40.57■■■■■ 4.09
PNKP-216ENST00000601816 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP40.56■■■■■ 4.08
PNKP-216ENST00000601816 DMRT2Q9Y5R5 561 aa40.55■■■■■ 4.08
PNKP-216ENST00000601816 ABCC5O15440 1437 aa40.55■■■■■ 4.08
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