RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592265.5

GTF3C2-AS1-210, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTF3C2-AS1, Length 665 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 FANCAO15360 1455 aa22.79■■□□□ 1.24
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.78■■□□□ 1.24
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.77■■□□□ 1.24
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.76■■□□□ 1.23
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 NEO1Q92859 1461 aa22.75■■□□□ 1.23
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.75■■□□□ 1.23
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 MIA2Q96PC5 1412 aa22.71■■□□□ 1.23
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 AKNAQ7Z591 1439 aa22.7■■□□□ 1.22
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 ADGRL1O94910 1474 aa22.68■■□□□ 1.22
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.67■■□□□ 1.22
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.67■■□□□ 1.22
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.67■■□□□ 1.22
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.65■■□□□ 1.22
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 ABCC1P33527 1531 aa22.64■■□□□ 1.21
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.64■■□□□ 1.21
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 KDM6BO15054 1643 aa22.63■■□□□ 1.21
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.62■■□□□ 1.21
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.61■■□□□ 1.21
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.6■■□□□ 1.21
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.56■■□□□ 1.2
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.55■■□□□ 1.2
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.2
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.54■■□□□ 1.2
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 RICTORQ6R327 1708 aa22.54■■□□□ 1.2
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.53■■□□□ 1.2
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.53■■□□□ 1.2
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.52■■□□□ 1.2
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 RAPGEF3O95398 923 aa22.52■■□□□ 1.2
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.52■■□□□ 1.2
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 MBD5Q9P267 1494 aa22.51■■□□□ 1.19
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.5■■□□□ 1.19
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.19
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 KDM5CP41229 1560 aa22.48■■□□□ 1.19
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 AFAP1Q8N556 730 aa22.48■■□□□ 1.19
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.48■■□□□ 1.19
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.47■■□□□ 1.19
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 TSPY4P0CV99 314 aa22.46■■□□□ 1.19
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 TSPY10P0CW01 314 aa22.46■■□□□ 1.19
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.46■■□□□ 1.19
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 DAPK1P53355 1430 aa22.45■■□□□ 1.18
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.44■■□□□ 1.18
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.42■■□□□ 1.18
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 ABCC5O15440 1437 aa22.42■■□□□ 1.18
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.41■■□□□ 1.18
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.41■■□□□ 1.18
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.4■■□□□ 1.18
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 ITGAEP38570 1179 aa22.4■■□□□ 1.18
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 ATP7AQ04656 1500 aa22.4■■□□□ 1.18
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.4■■□□□ 1.18
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.39■■□□□ 1.18
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.39■■□□□ 1.17
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.37■■□□□ 1.17
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.36■■□□□ 1.17
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.35■■□□□ 1.17
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.34■■□□□ 1.17
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.34■■□□□ 1.17
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 ABCA6Q8N139 1617 aa22.32■■□□□ 1.16
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.32■■□□□ 1.16
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 PLXNC1O60486 1568 aa22.31■■□□□ 1.16
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.31■■□□□ 1.16
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 ADGRL2O95490 1459 aa22.3■■□□□ 1.16
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 PTPRKQ15262 1439 aa22.3■■□□□ 1.16
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 ATP10AO60312 1499 aa22.29■■□□□ 1.16
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 ROCK1Q13464 1354 aa22.26■■□□□ 1.15
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 KIF15Q9NS87 1388 aa22.26■■□□□ 1.15
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 NCOA1Q15788 1441 aa22.25■■□□□ 1.15
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.25■■□□□ 1.15
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 A2MP01023 1474 aa22.25■■□□□ 1.15
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 REREQ9P2R6 1566 aa22.24■■□□□ 1.15
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.23■■□□□ 1.15
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 ERBINQ96RT1 1412 aa22.18■■□□□ 1.14
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 AGLP35573 1532 aa22.16■■□□□ 1.14
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.16■■□□□ 1.14
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 HFM1A2PYH4 1435 aa22.15■■□□□ 1.14
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.15■■□□□ 1.14
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 NAIPQ13075 1403 aa22.13■■□□□ 1.13
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.12■■□□□ 1.13
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 KIF3BO15066 747 aa22.12■■□□□ 1.13
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 MLECQ14165 292 aa22.08■■□□□ 1.13
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.06■■□□□ 1.12
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 GGT6Q6P531 493 aa22.06■■□□□ 1.12
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 DEPDC5O75140 1603 aa22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms