RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592107.5

AP000547.3-202, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AP000547.3, Length 1,019 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP000547.3-202ENST00000592107 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.59■■■■■ 4.25
AP000547.3-202ENST00000592107 AKNAQ7Z591 1439 aa41.54■■■■■ 4.24
AP000547.3-202ENST00000592107 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.51■■■■■ 4.24
AP000547.3-202ENST00000592107 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.49■■■■■ 4.23
AP000547.3-202ENST00000592107 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.49■■■■■ 4.23
AP000547.3-202ENST00000592107 NCOA2Q15596 1464 aa41.48■■■■■ 4.23
AP000547.3-202ENST00000592107 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP41.48■■■■■ 4.23
AP000547.3-202ENST00000592107 ADGRL1O94910 1474 aa41.46■■■■■ 4.23
AP000547.3-202ENST00000592107 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.45■■■■■ 4.23
AP000547.3-202ENST00000592107 RICTORQ6R327 1708 aa41.4■■■■■ 4.22
AP000547.3-202ENST00000592107 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.4■■■■■ 4.22
AP000547.3-202ENST00000592107 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa41.39■■■■■ 4.22
AP000547.3-202ENST00000592107 SCAPERQ9BY12 1400 aa41.35■■■■■ 4.21
AP000547.3-202ENST00000592107 ABCC1P33527 1531 aa41.34■■■■■ 4.21
AP000547.3-202ENST00000592107 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.33■■■■■ 4.21
AP000547.3-202ENST00000592107 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.31■■■■■ 4.2
AP000547.3-202ENST00000592107 RAPGEF3O95398 923 aa41.3■■■■■ 4.2
AP000547.3-202ENST00000592107 POGZQ7Z3K3 1410 aa41.28■■■■■ 4.2
AP000547.3-202ENST00000592107 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.25■■■■■ 4.19
AP000547.3-202ENST00000592107 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa41.24■■■■■ 4.19
AP000547.3-202ENST00000592107 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.23■■■■■ 4.19
AP000547.3-202ENST00000592107 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa41.21■■■■■ 4.19
AP000547.3-202ENST00000592107 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.2■■■■■ 4.19
AP000547.3-202ENST00000592107 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.18■■■■■ 4.18
AP000547.3-202ENST00000592107 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.18■■■■■ 4.18
AP000547.3-202ENST00000592107 KDM5CP41229 1560 aa41.16■■■■■ 4.18
AP000547.3-202ENST00000592107 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.15■■■■■ 4.18
AP000547.3-202ENST00000592107 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.12■■■■■ 4.17
AP000547.3-202ENST00000592107 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa41.12■■■■■ 4.17
AP000547.3-202ENST00000592107 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa41.1■■■■■ 4.17
AP000547.3-202ENST00000592107 MIA2Q96PC5 1412 aa41.1■■■■■ 4.17
AP000547.3-202ENST00000592107 MAGI2Q86UL8 1455 aa41.09■■■■■ 4.17
AP000547.3-202ENST00000592107 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa41.08■■■■■ 4.17
AP000547.3-202ENST00000592107 HECW2Q9P2P5 1572 aa41.08■■■■■ 4.17
AP000547.3-202ENST00000592107 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.07■■■■■ 4.17
AP000547.3-202ENST00000592107 AFAP1Q8N556 730 aa41.05■■■■■ 4.16
AP000547.3-202ENST00000592107 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41.03■■■■■ 4.165e-8■■■□□ 15.6
AP000547.3-202ENST00000592107 MBD5Q9P267 1494 aa40.99■■■■■ 4.15
AP000547.3-202ENST00000592107 PTPN23Q9H3S7 1636 aa40.99■■■■■ 4.15
AP000547.3-202ENST00000592107 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.99■■■■■ 4.15
AP000547.3-202ENST00000592107 MLH3Q9UHC1 1453 aa40.97■■■■■ 4.15
AP000547.3-202ENST00000592107 FGD6Q6ZV73 1430 aa40.97■■■■■ 4.15
AP000547.3-202ENST00000592107 ARHGEF5Q12774 1597 aa40.95■■■■■ 4.15
AP000547.3-202ENST00000592107 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa40.94■■■■■ 4.14
AP000547.3-202ENST00000592107 CCDC141Q6ZP82 1450 aa40.93■■■■■ 4.14
AP000547.3-202ENST00000592107 MYT1LQ9UL68 1186 aa40.92■■■■■ 4.14
AP000547.3-202ENST00000592107 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP40.91■■■■■ 4.14
AP000547.3-202ENST00000592107 ABCA6Q8N139 1617 aa40.9■■■■■ 4.14
AP000547.3-202ENST00000592107 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
AP000547.3-202ENST00000592107 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa40.9■■■■■ 4.14
AP000547.3-202ENST00000592107 ATP7AQ04656 1500 aa40.88■■■■■ 4.14
AP000547.3-202ENST00000592107 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.13
AP000547.3-202ENST00000592107 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.13
AP000547.3-202ENST00000592107 RSPH4AQ5TD94 716 aa40.85■■■■■ 4.13
AP000547.3-202ENST00000592107 ATP10AO60312 1499 aa40.84■■■■■ 4.13
AP000547.3-202ENST00000592107 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.84■■■■■ 4.13
AP000547.3-202ENST00000592107 REREQ9P2R6 1566 aa40.78■■■■■ 4.12
AP000547.3-202ENST00000592107 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa40.78■■■■■ 4.12
AP000547.3-202ENST00000592107 CROCC2H7BZ55 1655 aa40.78■■■■■ 4.12
AP000547.3-202ENST00000592107 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa40.76■■■■■ 4.11
AP000547.3-202ENST00000592107 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP40.75■■■■■ 4.11
AP000547.3-202ENST00000592107 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.74■■■■■ 4.11
AP000547.3-202ENST00000592107 ADGBQ8N7X0 1667 aa40.73■■■■■ 4.11
AP000547.3-202ENST00000592107 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.71■■■■■ 4.11
AP000547.3-202ENST00000592107 BCORL1Q5H9F3 1711 aa40.7■■■■■ 4.11
AP000547.3-202ENST00000592107 TSPY4P0CV99 314 aa40.69■■■■■ 4.1
AP000547.3-202ENST00000592107 TSPY10P0CW01 314 aa40.69■■■■■ 4.1
AP000547.3-202ENST00000592107 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.66■■■■■ 4.1
AP000547.3-202ENST00000592107 DAPK1P53355 1430 aa40.66■■■■■ 4.1
AP000547.3-202ENST00000592107 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP40.65■■■■■ 4.1
AP000547.3-202ENST00000592107 ABCC5O15440 1437 aa40.65■■■■■ 4.1
AP000547.3-202ENST00000592107 AGLP35573 1532 aa40.62■■■■■ 4.09
AP000547.3-202ENST00000592107 PLXNC1O60486 1568 aa40.61■■■■■ 4.09
AP000547.3-202ENST00000592107 A2MP01023 1474 aa40.61■■■■■ 4.09
AP000547.3-202ENST00000592107 ADAMTSL3P82987 1691 aa40.6■■■■■ 4.09
AP000547.3-202ENST00000592107 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.6■■■■■ 4.09
AP000547.3-202ENST00000592107 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP40.53■■■■■ 4.08
AP000547.3-202ENST00000592107 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.52■■■■■ 4.081e-8■□□□□ 10.8
AP000547.3-202ENST00000592107 MADDQ8WXG6 1647 aa40.51■■■■■ 4.08
AP000547.3-202ENST00000592107 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa40.48■■■■■ 4.07
AP000547.3-202ENST00000592107 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP40.47■■■■■ 4.07
AP000547.3-202ENST00000592107 MLECQ14165 292 aa40.46■■■■■ 4.07
AP000547.3-202ENST00000592107 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP40.43■■■■■ 4.06
AP000547.3-202ENST00000592107 ADGRL2O95490 1459 aa40.41■■■■■ 4.06
AP000547.3-202ENST00000592107 DUOX2Q9NRD8 1548 aa40.41■■■■■ 4.06
AP000547.3-202ENST00000592107 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.4■■■■■ 4.06
AP000547.3-202ENST00000592107 KIF15Q9NS87 1388 aa40.38■■■■■ 4.06
AP000547.3-202ENST00000592107 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.38■■■■■ 4.05
AP000547.3-202ENST00000592107 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP40.38■■■■■ 4.05
AP000547.3-202ENST00000592107 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.34■■■■■ 4.05
AP000547.3-202ENST00000592107 PTPRKQ15262 1439 aa40.33■■■■■ 4.05
AP000547.3-202ENST00000592107 NCOA1Q15788 1441 aa40.33■■■■■ 4.05
AP000547.3-202ENST00000592107 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.31■■■■■ 4.04
AP000547.3-202ENST00000592107 PTPRMP28827 1452 aa40.29■■■■■ 4.04
AP000547.3-202ENST00000592107 ERBINQ96RT1 1412 aa40.28■■■■■ 4.04
AP000547.3-202ENST00000592107 ITGAEP38570 1179 aa40.28■■■■■ 4.04
AP000547.3-202ENST00000592107 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP40.27■■■■■ 4.04
AP000547.3-202ENST00000592107 KIF3BO15066 747 aa40.26■■■■■ 4.04
AP000547.3-202ENST00000592107 ROCK1Q13464 1354 aa40.23■■■■■ 4.03
AP000547.3-202ENST00000592107 GGT6Q6P531 493 aa40.23■■■■■ 4.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.8 ms