RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 POGZQ7Z3K3 1410 aa20.03■□□□□ 0.8
CTIF-208ENST00000590422 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
CTIF-208ENST00000590422 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.01■□□□□ 0.79
CTIF-208ENST00000590422 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
CTIF-208ENST00000590422 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
CTIF-208ENST00000590422 MAGI2Q86UL8 1455 aa19.99■□□□□ 0.79
CTIF-208ENST00000590422 LMTK3Q96Q04 1460 aa19.97■□□□□ 0.79
CTIF-208ENST00000590422 ARHGAP5Q13017 1502 aa19.94■□□□□ 0.78
CTIF-208ENST00000590422 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa19.93■□□□□ 0.78
CTIF-208ENST00000590422 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
CTIF-208ENST00000590422 CLIP1P30622 1438 aa19.93■□□□□ 0.78
CTIF-208ENST00000590422 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa19.92■□□□□ 0.78
CTIF-208ENST00000590422 KDM5CP41229 1560 aa19.91■□□□□ 0.78
CTIF-208ENST00000590422 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa19.91■□□□□ 0.78
CTIF-208ENST00000590422 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa19.91■□□□□ 0.78
CTIF-208ENST00000590422 PREX2Q70Z35 1606 aa19.9■□□□□ 0.78
CTIF-208ENST00000590422 ATP10AO60312 1499 aa19.89■□□□□ 0.77
CTIF-208ENST00000590422 C9orf84Q5VXU9 1444 aa19.89■□□□□ 0.77
CTIF-208ENST00000590422 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa19.89■□□□□ 0.77
CTIF-208ENST00000590422 CCDC18Q5T9S5 1454 aa19.88■□□□□ 0.77
CTIF-208ENST00000590422 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa19.87■□□□□ 0.77
CTIF-208ENST00000590422 MLECQ14165 292 aa19.87■□□□□ 0.77
CTIF-208ENST00000590422 PLPPR3Q6T4P5 718 aa19.86■□□□□ 0.77
CTIF-208ENST00000590422 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa19.85■□□□□ 0.77
CTIF-208ENST00000590422 ABCC1P33527 1531 aa19.85■□□□□ 0.77
CTIF-208ENST00000590422 FYCO1Q9BQS8 1478 aa19.85■□□□□ 0.77
CTIF-208ENST00000590422 ABCA6Q8N139 1617 aa19.84■□□□□ 0.77
CTIF-208ENST00000590422 AFAP1Q8N556 730 aa19.84■□□□□ 0.77
CTIF-208ENST00000590422 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa19.84■□□□□ 0.77
CTIF-208ENST00000590422 ITSN2Q9NZM3 1697 aa19.83■□□□□ 0.76
CTIF-208ENST00000590422 HSPA2P54652 639 aa19.81■□□□□ 0.76
CTIF-208ENST00000590422 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa19.8■□□□□ 0.76
CTIF-208ENST00000590422 REREQ9P2R6 1566 aa19.78■□□□□ 0.76
CTIF-208ENST00000590422 MLH3Q9UHC1 1453 aa19.78■□□□□ 0.76
CTIF-208ENST00000590422 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa19.75■□□□□ 0.75
CTIF-208ENST00000590422 PREX1Q8TCU6 1659 aa19.75■□□□□ 0.75
CTIF-208ENST00000590422 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa19.75■□□□□ 0.75
CTIF-208ENST00000590422 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
CTIF-208ENST00000590422 MYT1LQ9UL68 1186 aa19.73■□□□□ 0.75
CTIF-208ENST00000590422 SYCP2Q9BX26 1530 aa19.72■□□□□ 0.75
CTIF-208ENST00000590422 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
CTIF-208ENST00000590422 FBXO41Q8TF61 875 aa19.71■□□□□ 0.75
CTIF-208ENST00000590422 AGLP35573 1532 aa19.71■□□□□ 0.75
CTIF-208ENST00000590422 C3P01024 1663 aa19.69■□□□□ 0.74
CTIF-208ENST00000590422 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
CTIF-208ENST00000590422 STRCQ7RTU9 1775 aa19.65■□□□□ 0.74
CTIF-208ENST00000590422 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.73
CTIF-208ENST00000590422 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
CTIF-208ENST00000590422 TIAM1Q13009 1591 aa19.62■□□□□ 0.73
CTIF-208ENST00000590422 ATP7AQ04656 1500 aa19.62■□□□□ 0.73
CTIF-208ENST00000590422 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa19.61■□□□□ 0.73
CTIF-208ENST00000590422 MTUS2Q5JR59 1369 aa19.61■□□□□ 0.73
CTIF-208ENST00000590422 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP19.61■□□□□ 0.73
CTIF-208ENST00000590422 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
CTIF-208ENST00000590422 CCNB3Q8WWL7 1395 aa19.6■□□□□ 0.73
CTIF-208ENST00000590422 PLXNC1O60486 1568 aa19.6■□□□□ 0.73
CTIF-208ENST00000590422 CEP162Q5TB80 1403 aa19.59■□□□□ 0.73
CTIF-208ENST00000590422 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa19.59■□□□□ 0.73
CTIF-208ENST00000590422 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa19.59■□□□□ 0.73
CTIF-208ENST00000590422 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.73
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CTIF-208ENST00000590422 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa19.58■□□□□ 0.72
CTIF-208ENST00000590422 MROH2AA6NES4 1674 aa19.57■□□□□ 0.72
CTIF-208ENST00000590422 CNTLNQ9NXG0 1405 aa19.56■□□□□ 0.72
CTIF-208ENST00000590422 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
CTIF-208ENST00000590422 A2MP01023 1474 aa19.54■□□□□ 0.72
CTIF-208ENST00000590422 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
CTIF-208ENST00000590422 CERKQ8TCT0 537 aa19.53■□□□□ 0.72
CTIF-208ENST00000590422 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
CTIF-208ENST00000590422 MBD5Q9P267 1494 aa19.52■□□□□ 0.72
CTIF-208ENST00000590422 ADGBQ8N7X0 1667 aa19.51■□□□□ 0.71
CTIF-208ENST00000590422 NPATQ14207 1427 aa19.49■□□□□ 0.71
CTIF-208ENST00000590422 ZMYM3Q14202 1370 aa19.47■□□□□ 0.71
CTIF-208ENST00000590422 NCOA1Q15788 1441 aa19.47■□□□□ 0.71
CTIF-208ENST00000590422 NCOA2Q15596 1464 aa19.47■□□□□ 0.71
CTIF-208ENST00000590422 MYO3AQ8NEV4 1616 aa19.47■□□□□ 0.71
CTIF-208ENST00000590422 PTPRTO14522 1441 aa19.45■□□□□ 0.7
CTIF-208ENST00000590422 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa19.44■□□□□ 0.7
CTIF-208ENST00000590422 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
CTIF-208ENST00000590422 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa19.44■□□□□ 0.7
CTIF-208ENST00000590422 DMRT2Q9Y5R5 561 aa19.44■□□□□ 0.7
CTIF-208ENST00000590422 PTPRKQ15262 1439 aa19.42■□□□□ 0.7
CTIF-208ENST00000590422 GGT6Q6P531 493 aa19.42■□□□□ 0.7
CTIF-208ENST00000590422 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa19.42■□□□□ 0.7
CTIF-208ENST00000590422 CCDC141Q6ZP82 1450 aa19.41■□□□□ 0.7
CTIF-208ENST00000590422 LTBP4Q8N2S1 1624 aa19.4■□□□□ 0.7
CTIF-208ENST00000590422 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP19.4■□□□□ 0.7
CTIF-208ENST00000590422 VPS8Q8N3P4 1428 aa19.38■□□□□ 0.69
CTIF-208ENST00000590422 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
CTIF-208ENST00000590422 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa19.37■□□□□ 0.69
CTIF-208ENST00000590422 ARHGEF5Q12774 1597 aa19.36■□□□□ 0.69
CTIF-208ENST00000590422 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa19.35■□□□□ 0.69
CTIF-208ENST00000590422 PLA2R1Q13018 1463 aa19.34■□□□□ 0.69
CTIF-208ENST00000590422 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa19.33■□□□□ 0.69
CTIF-208ENST00000590422 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.68
CTIF-208ENST00000590422 KDM5DQ9BY66 1539 aa19.32■□□□□ 0.68
CTIF-208ENST00000590422 PPP6R1Q9UPN7 881 aa19.32■□□□□ 0.68
CTIF-208ENST00000590422 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
CTIF-208ENST00000590422 KIF3BO15066 747 aa19.3■□□□□ 0.68
CTIF-208ENST00000590422 A2ML1A8K2U0 1454 aa19.29■□□□□ 0.68
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