RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589998.5

ILF3-217, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ILF3, Length 2,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3-217ENST00000589998 PBRM1Q86U86 1689 aa27.39■■□□□ 1.98
ILF3-217ENST00000589998 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
ILF3-217ENST00000589998 BCL11AQ9H165 835 aa27.38■■□□□ 1.97
ILF3-217ENST00000589998 WDR62O43379 1518 aa27.37■■□□□ 1.97
ILF3-217ENST00000589998 PPP4R2Q9NY27 417 aa27.36■■□□□ 1.97
ILF3-217ENST00000589998 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
ILF3-217ENST00000589998 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.35■■□□□ 1.97
ILF3-217ENST00000589998 FAM9BQ8IZU0 186 aa27.35■■□□□ 1.97
ILF3-217ENST00000589998 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.34■■□□□ 1.97
ILF3-217ENST00000589998 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.33■■□□□ 1.97
ILF3-217ENST00000589998 MRS2Q9HD23 443 aa27.33■■□□□ 1.97
ILF3-217ENST00000589998 NBPF8Q3BBV2 869 aa27.32■■□□□ 1.96
ILF3-217ENST00000589998 ZBED9Q6R2W3 1325 aa27.31■■□□□ 1.96
ILF3-217ENST00000589998 DAPK1P53355 1430 aa27.3■■□□□ 1.96
ILF3-217ENST00000589998 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
ILF3-217ENST00000589998 ARID3CA6NKF2 412 aa27.29■■□□□ 1.96
ILF3-217ENST00000589998 ROCK1Q13464 1354 aa27.28■■□□□ 1.96
ILF3-217ENST00000589998 ADAMTS12P58397 1594 aa27.28■■□□□ 1.96
ILF3-217ENST00000589998 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.27■■□□□ 1.96
ILF3-217ENST00000589998 KIF7Q2M1P5 1343 aa27.26■■□□□ 1.95
ILF3-217ENST00000589998 ABCC5O15440 1437 aa27.23■■□□□ 1.95
ILF3-217ENST00000589998 ERICH6Q7L0X2 663 aa27.2■■□□□ 1.95
ILF3-217ENST00000589998 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa27.2■■□□□ 1.94
ILF3-217ENST00000589998 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
ILF3-217ENST00000589998 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
ILF3-217ENST00000589998 PZPP20742 1482 aa27.11■■□□□ 1.93
ILF3-217ENST00000589998 KIAA0556O60303 1618 aa27.1■■□□□ 1.93
ILF3-217ENST00000589998 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.09■■□□□ 1.93
ILF3-217ENST00000589998 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
ILF3-217ENST00000589998 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
ILF3-217ENST00000589998 MBD5Q9P267 1494 aa27.08■■□□□ 1.93
ILF3-217ENST00000589998 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.08■■□□□ 1.93
ILF3-217ENST00000589998 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
ILF3-217ENST00000589998 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.07■■□□□ 1.92
ILF3-217ENST00000589998 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.07■■□□□ 1.92
ILF3-217ENST00000589998 DISP1Q96F81 1524 aa27.06■■□□□ 1.92
ILF3-217ENST00000589998 KIF14Q15058 1648 aa27.03■■□□□ 1.92
ILF3-217ENST00000589998 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.02■■□□□ 1.92
ILF3-217ENST00000589998 USP47Q96K76 1375 aa27.01■■□□□ 1.92
ILF3-217ENST00000589998 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27■■□□□ 1.91
ILF3-217ENST00000589998 KDM5CP41229 1560 aa27■■□□□ 1.91
ILF3-217ENST00000589998 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.99■■□□□ 1.91
ILF3-217ENST00000589998 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
ILF3-217ENST00000589998 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.98■■□□□ 1.91
ILF3-217ENST00000589998 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.98■■□□□ 1.91
ILF3-217ENST00000589998 NUDCQ9Y266 331 aa26.98■■□□□ 1.91
ILF3-217ENST00000589998 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.96■■□□□ 1.91
ILF3-217ENST00000589998 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
ILF3-217ENST00000589998 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.94■■□□□ 1.9
ILF3-217ENST00000589998 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
ILF3-217ENST00000589998 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.94■■□□□ 1.9
ILF3-217ENST00000589998 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
ILF3-217ENST00000589998 ADGRL2O95490 1459 aa26.93■■□□□ 1.9
ILF3-217ENST00000589998 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
ILF3-217ENST00000589998 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
ILF3-217ENST00000589998 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
ILF3-217ENST00000589998 PKD2Q13563 968 aa26.89■■□□□ 1.9
ILF3-217ENST00000589998 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
ILF3-217ENST00000589998 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.88■■□□□ 1.89
ILF3-217ENST00000589998 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.87■■□□□ 1.89
ILF3-217ENST00000589998 CCDC136Q96JN2 1154 aa26.86■■□□□ 1.89
ILF3-217ENST00000589998 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
ILF3-217ENST00000589998 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.85■■□□□ 1.89
ILF3-217ENST00000589998 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
ILF3-217ENST00000589998 IFT140Q96RY7 1462 aa26.84■■□□□ 1.89
ILF3-217ENST00000589998 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
ILF3-217ENST00000589998 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.84■■□□□ 1.89
ILF3-217ENST00000589998 GRIN2AQ12879 1464 aa26.84■■□□□ 1.89
ILF3-217ENST00000589998 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
ILF3-217ENST00000589998 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.83■■□□□ 1.89
ILF3-217ENST00000589998 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.83■■□□□ 1.88
ILF3-217ENST00000589998 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.81■■□□□ 1.88
ILF3-217ENST00000589998 TMC1Q8TDI8 760 aa26.8■■□□□ 1.88
ILF3-217ENST00000589998 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.8■■□□□ 1.88
ILF3-217ENST00000589998 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
ILF3-217ENST00000589998 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.78■■□□□ 1.88
ILF3-217ENST00000589998 KIF15Q9NS87 1388 aa26.77■■□□□ 1.88
ILF3-217ENST00000589998 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.77■■□□□ 1.88
ILF3-217ENST00000589998 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.76■■□□□ 1.87
ILF3-217ENST00000589998 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
ILF3-217ENST00000589998 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
ILF3-217ENST00000589998 E9PCH4 1651 aa26.75■■□□□ 1.87
ILF3-217ENST00000589998 DEKP35659 375 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
ILF3-217ENST00000589998 NUP155O75694 1391 aa26.72■■□□□ 1.87
ILF3-217ENST00000589998 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.87
ILF3-217ENST00000589998 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
ILF3-217ENST00000589998 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.69■■□□□ 1.86
ILF3-217ENST00000589998 CEP170Q5SW79 1584 aa26.69■■□□□ 1.86
ILF3-217ENST00000589998 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
ILF3-217ENST00000589998 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.69■■□□□ 1.86
ILF3-217ENST00000589998 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.69■■□□□ 1.86
ILF3-217ENST00000589998 NBR1Q14596 966 aa26.69■■□□□ 1.86
ILF3-217ENST00000589998 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.68■■□□□ 1.86
ILF3-217ENST00000589998 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
ILF3-217ENST00000589998 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
ILF3-217ENST00000589998 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.66■■□□□ 1.86
ILF3-217ENST00000589998 RALBP1Q15311 655 aa26.65■■□□□ 1.86
ILF3-217ENST00000589998 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.62■■□□□ 1.85
ILF3-217ENST00000589998 RRP1P56182 461 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
ILF3-217ENST00000589998 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.7 ms