RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589867.2

MBD1-221, Transcript of methyl-CpG binding domain protein 1, human

TSL 3

Gene MBD1, Length 673 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MBD1-221	ENST00000589867	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		27.65	■■■□□ 2.02
MBD1-221	ENST00000589867	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		27.64	■■■□□ 2.02
MBD1-221	ENST00000589867	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		27.63	■■■□□ 2.01
MBD1-221	ENST00000589867	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
MBD1-221	ENST00000589867	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		27.61	■■■□□ 2.01
MBD1-221	ENST00000589867	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		27.6	■■■□□ 2.01
MBD1-221	ENST00000589867	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		27.6	■■■□□ 2.01
MBD1-221	ENST00000589867	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		27.6	■■■□□ 2.01
MBD1-221	ENST00000589867	TIAM1	Q13009	1591 aa		27.6	■■■□□ 2.01
MBD1-221	ENST00000589867	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		27.57	■■■□□ 2
MBD1-221	ENST00000589867	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		27.54	■■■□□ 2
MBD1-221	ENST00000589867	ABCC1	P33527	1531 aa		27.53	■■■□□ 2
MBD1-221	ENST00000589867	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		27.53	■■■□□ 2
MBD1-221	ENST00000589867	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		27.52	■■■□□ 2
MBD1-221	ENST00000589867	MAP3K1	Q13233	1512 aa		27.51	■■□□□ 1.99
MBD1-221	ENST00000589867	KDM5C	P41229	1560 aa		27.5	■■□□□ 1.99
MBD1-221	ENST00000589867	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	27.49	■■□□□ 1.99
MBD1-221	ENST00000589867	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		27.49	■■□□□ 1.99
MBD1-221	ENST00000589867	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		27.49	■■□□□ 1.99
MBD1-221	ENST00000589867	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		27.49	■■□□□ 1.99
MBD1-221	ENST00000589867	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		27.48	■■□□□ 1.99
MBD1-221	ENST00000589867	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		27.48	■■□□□ 1.99
MBD1-221	ENST00000589867	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	27.48	■■□□□ 1.99
MBD1-221	ENST00000589867	AFAP1	Q8N556	730 aa		27.48	■■□□□ 1.99
MBD1-221	ENST00000589867	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		27.48	■■□□□ 1.99
MBD1-221	ENST00000589867	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		27.46	■■□□□ 1.99
MBD1-221	ENST00000589867	NCOA2	Q15596	1464 aa		27.46	■■□□□ 1.99
MBD1-221	ENST00000589867	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		27.46	■■□□□ 1.99
MBD1-221	ENST00000589867	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	27.44	■■□□□ 1.98
MBD1-221	ENST00000589867	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	27.42	■■□□□ 1.98
MBD1-221	ENST00000589867	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	27.41	■■□□□ 1.98
MBD1-221	ENST00000589867	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		27.41	■■□□□ 1.98
MBD1-221	ENST00000589867	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	27.4	■■□□□ 1.98
MBD1-221	ENST00000589867	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		27.38	■■□□□ 1.97
MBD1-221	ENST00000589867	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		27.38	■■□□□ 1.97
MBD1-221	ENST00000589867	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		27.38	■■□□□ 1.97
MBD1-221	ENST00000589867	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		27.38	■■□□□ 1.97
MBD1-221	ENST00000589867	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		27.36	■■□□□ 1.97
MBD1-221	ENST00000589867	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	27.36	■■□□□ 1.97
MBD1-221	ENST00000589867	ATP10A	O60312	1499 aa		27.35	■■□□□ 1.97
MBD1-221	ENST00000589867	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		27.34	■■□□□ 1.97
MBD1-221	ENST00000589867	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		27.34	■■□□□ 1.97
MBD1-221	ENST00000589867	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		27.33	■■□□□ 1.97
MBD1-221	ENST00000589867	MBD5	Q9P267	1494 aa		27.33	■■□□□ 1.97
MBD1-221	ENST00000589867	ABCA6	Q8N139	1617 aa		27.33	■■□□□ 1.97
MBD1-221	ENST00000589867	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		27.3	■■□□□ 1.96
MBD1-221	ENST00000589867	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	27.28	■■□□□ 1.96
MBD1-221	ENST00000589867	MADD	Q8WXG6	1647 aa		27.26	■■□□□ 1.95
MBD1-221	ENST00000589867	RERE	Q9P2R6	1566 aa		27.26	■■□□□ 1.95
MBD1-221	ENST00000589867	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		27.25	■■□□□ 1.95
MBD1-221	ENST00000589867	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	27.24	■■□□□ 1.95
MBD1-221	ENST00000589867	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	27.21	■■□□□ 1.95
MBD1-221	ENST00000589867	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		27.21	■■□□□ 1.95
MBD1-221	ENST00000589867	ATP7A	Q04656	1500 aa		27.21	■■□□□ 1.95
MBD1-221	ENST00000589867	PTPRM	P28827	1452 aa		27.19	■■□□□ 1.94
MBD1-221	ENST00000589867	APLP2	Q06481	763 aa		27.19	■■□□□ 1.94
MBD1-221	ENST00000589867	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		27.19	■■□□□ 1.94
MBD1-221	ENST00000589867	MIA2	Q96PC5	1412 aa		27.16	■■□□□ 1.94
MBD1-221	ENST00000589867	AGL	P35573	1532 aa		27.16	■■□□□ 1.94
MBD1-221	ENST00000589867	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	27.15	■■□□□ 1.94
MBD1-221	ENST00000589867	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		27.15	■■□□□ 1.94
MBD1-221	ENST00000589867	MLEC	Q14165	292 aa		27.15	■■□□□ 1.94
MBD1-221	ENST00000589867	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		27.14	■■□□□ 1.94
MBD1-221	ENST00000589867	PLXNC1	O60486	1568 aa		27.12	■■□□□ 1.93
MBD1-221	ENST00000589867	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		27.11	■■□□□ 1.93
MBD1-221	ENST00000589867	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		27.1	■■□□□ 1.93
MBD1-221	ENST00000589867	A2M	P01023	1474 aa		27.07	■■□□□ 1.92
MBD1-221	ENST00000589867	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		27.07	■■□□□ 1.92
MBD1-221	ENST00000589867	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		27.06	■■□□□ 1.92
MBD1-221	ENST00000589867	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		27.06	■■□□□ 1.92
MBD1-221	ENST00000589867	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		27.05	■■□□□ 1.92
MBD1-221	ENST00000589867	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	27.03	■■□□□ 1.92
MBD1-221	ENST00000589867	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		27.01	■■□□□ 1.92
MBD1-221	ENST00000589867	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	26.98	■■□□□ 1.91
MBD1-221	ENST00000589867	ABCC5	O15440	1437 aa		26.98	■■□□□ 1.91
MBD1-221	ENST00000589867	TSPY4	P0CV99	314 aa		26.94	■■□□□ 1.9
MBD1-221	ENST00000589867	TSPY10	P0CW01	314 aa		26.94	■■□□□ 1.9
MBD1-221	ENST00000589867	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		26.94	■■□□□ 1.9
MBD1-221	ENST00000589867	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	26.93	■■□□□ 1.9
MBD1-221	ENST00000589867	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	26.93	■■□□□ 1.9
MBD1-221	ENST00000589867	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		26.91	■■□□□ 1.9
MBD1-221	ENST00000589867	DAPK1	P53355	1430 aa		26.9	■■□□□ 1.9
MBD1-221	ENST00000589867	C3	P01024	1663 aa		26.9	■■□□□ 1.9
MBD1-221	ENST00000589867	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	26.9	■■□□□ 1.9
MBD1-221	ENST00000589867	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		26.89	■■□□□ 1.9
MBD1-221	ENST00000589867	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		26.88	■■□□□ 1.89
MBD1-221	ENST00000589867	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		26.85	■■□□□ 1.89
MBD1-221	ENST00000589867	GGT6	Q6P531	493 aa		26.85	■■□□□ 1.89
MBD1-221	ENST00000589867	MROH2A	A6NES4	1674 aa		26.85	■■□□□ 1.89
MBD1-221	ENST00000589867	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	26.84	■■□□□ 1.89
MBD1-221	ENST00000589867	KIF3B	O15066	747 aa		26.83	■■□□□ 1.89
MBD1-221	ENST00000589867	ZMYM3	Q14202	1370 aa		26.81	■■□□□ 1.88
MBD1-221	ENST00000589867	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	26.8	■■□□□ 1.88
MBD1-221	ENST00000589867	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		26.79	■■□□□ 1.88
MBD1-221	ENST00000589867	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	26.78	■■□□□ 1.88
MBD1-221	ENST00000589867	KIF15	Q9NS87	1388 aa		26.78	■■□□□ 1.88
MBD1-221	ENST00000589867	PTPRK	Q15262	1439 aa		26.78	■■□□□ 1.88
MBD1-221	ENST00000589867	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		26.78	■■□□□ 1.88
MBD1-221	ENST00000589867	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	26.78	■■□□□ 1.88
MBD1-221	ENST00000589867	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	26.77	■■□□□ 1.88

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