RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589452.1

PQLC1-210, Transcript of PQ loop repeat containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene PQLC1, Length 704 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC1-210ENST00000589452 ARHGAP5Q13017 1502 aa46.53■■■■■ 5.04
PQLC1-210ENST00000589452 POGZQ7Z3K3 1410 aa46.52■■■■■ 5.04
PQLC1-210ENST00000589452 YEATS2Q9ULM3 1422 aa46.5■■■■■ 5.03
PQLC1-210ENST00000589452 ADAMTSL3P82987 1691 aa46.48■■■■■ 5.03
PQLC1-210ENST00000589452 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa46.47■■■■■ 5.03
PQLC1-210ENST00000589452 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa46.45■■■■■ 5.03
PQLC1-210ENST00000589452 BCORL1Q5H9F3 1711 aa46.44■■■■■ 5.02
PQLC1-210ENST00000589452 CEP162Q5TB80 1403 aa46.43■■■■■ 5.02
PQLC1-210ENST00000589452 MAGI2Q86UL8 1455 aa46.42■■■■■ 5.02
PQLC1-210ENST00000589452 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa46.37■■■■■ 5.01
PQLC1-210ENST00000589452 PREX2Q70Z35 1606 aa46.36■■■■■ 5.01
PQLC1-210ENST00000589452 AFAP1Q8N556 730 aa46.35■■■■■ 5.01
PQLC1-210ENST00000589452 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa46.34■■■■■ 5.01
PQLC1-210ENST00000589452 PTPRMP28827 1452 aa46.32■■■■■ 5.01
PQLC1-210ENST00000589452 MADDQ8WXG6 1647 aa46.32■■■■■ 5
PQLC1-210ENST00000589452 HECW2Q9P2P5 1572 aa46.31■■■■■ 5
PQLC1-210ENST00000589452 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa46.3■■■■■ 5
PQLC1-210ENST00000589452 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa46.29■■■■■ 5
PQLC1-210ENST00000589452 ATP10AO60312 1499 aa46.24■■■■■ 4.99
PQLC1-210ENST00000589452 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa46.23■■■■■ 4.99
PQLC1-210ENST00000589452 MYT1LQ9UL68 1186 aa46.22■■■■■ 4.99
PQLC1-210ENST00000589452 KDM5CP41229 1560 aa46.22■■■■■ 4.99
PQLC1-210ENST00000589452 MLECQ14165 292 aa46.21■■■■■ 4.99
PQLC1-210ENST00000589452 ABCC1P33527 1531 aa46.2■■■■■ 4.99
PQLC1-210ENST00000589452 MTUS2Q5JR59 1369 aa46.2■■■■■ 4.99
PQLC1-210ENST00000589452 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa46.2■■■■■ 4.99
PQLC1-210ENST00000589452 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP46.19■■■■■ 4.98
PQLC1-210ENST00000589452 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP46.18■■■■■ 4.98
PQLC1-210ENST00000589452 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP46.17■■■■■ 4.98
PQLC1-210ENST00000589452 C9orf84Q5VXU9 1444 aa46.16■■■■■ 4.98
PQLC1-210ENST00000589452 ITSN2Q9NZM3 1697 aa46.14■■■■■ 4.98
PQLC1-210ENST00000589452 CCNB3Q8WWL7 1395 aa46.09■■■■■ 4.97
PQLC1-210ENST00000589452 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa46.08■■■■■ 4.97
PQLC1-210ENST00000589452 MLH3Q9UHC1 1453 aa46.06■■■■■ 4.96
PQLC1-210ENST00000589452 PLPPR3Q6T4P5 718 aa46.06■■■■■ 4.96
PQLC1-210ENST00000589452 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa46.05■■■■■ 4.96
PQLC1-210ENST00000589452 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP46.05■■■■■ 4.96
PQLC1-210ENST00000589452 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP46.02■■■■■ 4.967e-7■■■□□ 18.2
PQLC1-210ENST00000589452 ABCA6Q8N139 1617 aa46.01■■■■■ 4.96
PQLC1-210ENST00000589452 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa46.01■■■■■ 4.96
PQLC1-210ENST00000589452 SYCP2Q9BX26 1530 aa45.98■■■■■ 4.95
PQLC1-210ENST00000589452 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa45.98■■■■■ 4.95
PQLC1-210ENST00000589452 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa45.94■■■■■ 4.95
PQLC1-210ENST00000589452 TIAM1Q13009 1591 aa45.92■■■■■ 4.94
PQLC1-210ENST00000589452 VPS8Q8N3P4 1428 aa45.9■■■■■ 4.94
PQLC1-210ENST00000589452 REREQ9P2R6 1566 aa45.88■■■■■ 4.94
PQLC1-210ENST00000589452 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa45.87■■■■■ 4.93
PQLC1-210ENST00000589452 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP45.87■■■■■ 4.93
PQLC1-210ENST00000589452 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa45.87■■■■■ 4.93
PQLC1-210ENST00000589452 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP45.85■■■■■ 4.93
PQLC1-210ENST00000589452 LMTK3Q96Q04 1460 aa45.8■■■■■ 4.92
PQLC1-210ENST00000589452 NCOA2Q15596 1464 aa45.79■■■■■ 4.92
PQLC1-210ENST00000589452 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP45.78■■■■■ 4.92
PQLC1-210ENST00000589452 AGLP35573 1532 aa45.77■■■■■ 4.92
PQLC1-210ENST00000589452 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP45.77■■■■■ 4.92
PQLC1-210ENST00000589452 ATP7AQ04656 1500 aa45.72■■■■■ 4.91
PQLC1-210ENST00000589452 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP45.68■■■■■ 4.9
PQLC1-210ENST00000589452 HSPA2P54652 639 aa45.68■■■■■ 4.9
PQLC1-210ENST00000589452 MBD5Q9P267 1494 aa45.68■■■■■ 4.9
PQLC1-210ENST00000589452 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa45.67■■■■■ 4.9
PQLC1-210ENST00000589452 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP45.64■■■■■ 4.9
PQLC1-210ENST00000589452 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP45.6■■■■■ 4.89
PQLC1-210ENST00000589452 A2MP01023 1474 aa45.57■■■■■ 4.89
PQLC1-210ENST00000589452 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa45.56■■■■■ 4.88
PQLC1-210ENST00000589452 MAP3K1Q13233 1512 aa45.55■■■■■ 4.88
PQLC1-210ENST00000589452 C3P01024 1663 aa45.51■■■■■ 4.88
PQLC1-210ENST00000589452 PLXNC1O60486 1568 aa45.5■■■■■ 4.87
PQLC1-210ENST00000589452 PREX1Q8TCU6 1659 aa45.48■■■■■ 4.87
PQLC1-210ENST00000589452 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa45.46■■■■■ 4.87
PQLC1-210ENST00000589452 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP45.46■■■■■ 4.87
PQLC1-210ENST00000589452 CCDC141Q6ZP82 1450 aa45.46■■■■■ 4.87
PQLC1-210ENST00000589452 ADGBQ8N7X0 1667 aa45.46■■■■■ 4.87
PQLC1-210ENST00000589452 CNTLNQ9NXG0 1405 aa45.44■■■■■ 4.87
PQLC1-210ENST00000589452 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP45.42■■■■■ 4.86
PQLC1-210ENST00000589452 RSPH4AQ5TD94 716 aa45.41■■■■■ 4.86
PQLC1-210ENST00000589452 GGT6Q6P531 493 aa45.41■■■■■ 4.86
PQLC1-210ENST00000589452 APLP2Q06481 763 aa45.37■■■■■ 4.85
PQLC1-210ENST00000589452 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa45.35■■■■■ 4.85
PQLC1-210ENST00000589452 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP45.34■■■■■ 4.85
PQLC1-210ENST00000589452 ZMYM3Q14202 1370 aa45.33■■■■■ 4.85
PQLC1-210ENST00000589452 ARHGEF5Q12774 1597 aa45.33■■■■■ 4.85
PQLC1-210ENST00000589452 MYOM3Q5VTT5 1437 aa45.32■■■■■ 4.85
PQLC1-210ENST00000589452 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP45.31■■■■■ 4.84
PQLC1-210ENST00000589452 MROH2AA6NES4 1674 aa45.31■■■■■ 4.84
PQLC1-210ENST00000589452 TSPY4P0CV99 314 aa45.29■■■■■ 4.84
PQLC1-210ENST00000589452 TSPY10P0CW01 314 aa45.29■■■■■ 4.84
PQLC1-210ENST00000589452 MIA2Q96PC5 1412 aa45.25■■■■■ 4.83
PQLC1-210ENST00000589452 KIF3BO15066 747 aa45.23■■■■■ 4.83
PQLC1-210ENST00000589452 PPP6R1Q9UPN7 881 aa45.2■■■■■ 4.83
PQLC1-210ENST00000589452 NPATQ14207 1427 aa45.18■■■■■ 4.82
PQLC1-210ENST00000589452 STRCQ7RTU9 1775 aa45.14■■■■■ 4.82
PQLC1-210ENST00000589452 MAST1Q9Y2H9 1570 aa45.11■■■■■ 4.81
PQLC1-210ENST00000589452 PTPRKQ15262 1439 aa45.1■■■■■ 4.81
PQLC1-210ENST00000589452 PTPN23Q9H3S7 1636 aa45.04■■■■■ 4.8
PQLC1-210ENST00000589452 DMRT2Q9Y5R5 561 aa45■■■■■ 4.79
PQLC1-210ENST00000589452 FBXO41Q8TF61 875 aa44.99■■■■■ 4.79
PQLC1-210ENST00000589452 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa44.98■■■■■ 4.79
PQLC1-210ENST00000589452 FGD6Q6ZV73 1430 aa44.97■■■■■ 4.79
PQLC1-210ENST00000589452 ABCC5O15440 1437 aa44.96■■■■■ 4.79
PQLC1-210ENST00000589452 KDM5DQ9BY66 1539 aa44.96■■■■■ 4.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms