RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588909.1

TPGS2-208, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 2, human

TSL 5

Gene TPGS2, Length 348 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPGS2-208	ENST00000588909	CEP162	Q5TB80	1403 aa		41.55	■■■■■ 4.24
TPGS2-208	ENST00000588909	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		41.52	■■■■■ 4.24
TPGS2-208	ENST00000588909	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		41.52	■■■■■ 4.24
TPGS2-208	ENST00000588909	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		41.52	■■■■■ 4.24
TPGS2-208	ENST00000588909	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		41.5	■■■■■ 4.23
TPGS2-208	ENST00000588909	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		41.46	■■■■■ 4.23
TPGS2-208	ENST00000588909	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		41.43	■■■■■ 4.22
TPGS2-208	ENST00000588909	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		41.4	■■■■■ 4.22
TPGS2-208	ENST00000588909	PREX2	Q70Z35	1606 aa		41.39	■■■■■ 4.22
TPGS2-208	ENST00000588909	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		41.38	■■■■■ 4.22
TPGS2-208	ENST00000588909	AFAP1	Q8N556	730 aa		41.38	■■■■■ 4.21
TPGS2-208	ENST00000588909	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		41.38	■■■■■ 4.21
TPGS2-208	ENST00000588909	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		41.35	■■■■■ 4.21
TPGS2-208	ENST00000588909	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		41.32	■■■■■ 4.2
TPGS2-208	ENST00000588909	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		41.31	■■■■■ 4.2
TPGS2-208	ENST00000588909	MADD	Q8WXG6	1647 aa		41.31	■■■■■ 4.2
TPGS2-208	ENST00000588909	PTPRM	P28827	1452 aa		41.3	■■■■■ 4.2
TPGS2-208	ENST00000588909	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		41.29	■■■■■ 4.2
TPGS2-208	ENST00000588909	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		41.29	■■■■■ 4.2
TPGS2-208	ENST00000588909	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	41.28	■■■■■ 4.2
TPGS2-208	ENST00000588909	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		41.28	■■■■■ 4.2
TPGS2-208	ENST00000588909	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		41.28	■■■■■ 4.2
TPGS2-208	ENST00000588909	MLEC	Q14165	292 aa		41.27	■■■■■ 4.2
TPGS2-208	ENST00000588909	ABCC1	P33527	1531 aa		41.25	■■■■■ 4.19
TPGS2-208	ENST00000588909	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		41.25	■■■■■ 4.19
TPGS2-208	ENST00000588909	KDM5C	P41229	1560 aa		41.24	■■■■■ 4.19
TPGS2-208	ENST00000588909	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	41.23	■■■■■ 4.19
TPGS2-208	ENST00000588909	ATP10A	O60312	1499 aa		41.23	■■■■■ 4.19
TPGS2-208	ENST00000588909	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		41.18	■■■■■ 4.18
TPGS2-208	ENST00000588909	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		41.18	■■■■■ 4.18
TPGS2-208	ENST00000588909	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	41.17	■■■■■ 4.18
TPGS2-208	ENST00000588909	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		41.17	■■■■■ 4.18
TPGS2-208	ENST00000588909	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		41.17	■■■■■ 4.18
TPGS2-208	ENST00000588909	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		41.15	■■■■■ 4.18
TPGS2-208	ENST00000588909	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	41.13	■■■■■ 4.17
TPGS2-208	ENST00000588909	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		41.12	■■■■■ 4.17
TPGS2-208	ENST00000588909	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	41.1	■■■■■ 4.17
TPGS2-208	ENST00000588909	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		41.1	■■■■■ 4.17
TPGS2-208	ENST00000588909	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		41.09	■■■■■ 4.17
TPGS2-208	ENST00000588909	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		41.09	■■■■■ 4.17
TPGS2-208	ENST00000588909	ABCA6	Q8N139	1617 aa		41.07	■■■■■ 4.17
TPGS2-208	ENST00000588909	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		41.05	■■■■■ 4.16
TPGS2-208	ENST00000588909	TIAM1	Q13009	1591 aa		41.03	■■■■■ 4.16
TPGS2-208	ENST00000588909	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	40.99	■■■■■ 4.15
TPGS2-208	ENST00000588909	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		40.99	■■■■■ 4.15
TPGS2-208	ENST00000588909	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		40.97	■■■■■ 4.15
TPGS2-208	ENST00000588909	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	40.93	■■■■■ 4.14
TPGS2-208	ENST00000588909	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		40.93	■■■■■ 4.14
TPGS2-208	ENST00000588909	NCOA2	Q15596	1464 aa		40.92	■■■■■ 4.14
TPGS2-208	ENST00000588909	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		40.92	■■■■■ 4.14
TPGS2-208	ENST00000588909	RERE	Q9P2R6	1566 aa		40.91	■■■■■ 4.14
TPGS2-208	ENST00000588909	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	40.87	■■■■■ 4.13
TPGS2-208	ENST00000588909	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	40.86	■■■■■ 4.13
TPGS2-208	ENST00000588909	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		40.84	■■■■■ 4.13
TPGS2-208	ENST00000588909	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		40.83	■■■■■ 4.13
TPGS2-208	ENST00000588909	ATP7A	Q04656	1500 aa		40.82	■■■■■ 4.12
TPGS2-208	ENST00000588909	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	40.81	■■■■■ 4.12
TPGS2-208	ENST00000588909	AGL	P35573	1532 aa		40.8	■■■■■ 4.12
TPGS2-208	ENST00000588909	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	40.78	■■■■■ 4.12
TPGS2-208	ENST00000588909	MBD5	Q9P267	1494 aa		40.77	■■■■■ 4.12
TPGS2-208	ENST00000588909	HSPA2	P54652	639 aa		40.75	■■■■■ 4.11
TPGS2-208	ENST00000588909	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		40.72	■■■■■ 4.11
TPGS2-208	ENST00000588909	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	40.7	■■■■■ 4.11
TPGS2-208	ENST00000588909	A2M	P01023	1474 aa		40.67	■■■■■ 4.1
TPGS2-208	ENST00000588909	MAP3K1	Q13233	1512 aa		40.67	■■■■■ 4.1
TPGS2-208	ENST00000588909	PLXNC1	O60486	1568 aa		40.61	■■■■■ 4.09
TPGS2-208	ENST00000588909	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		40.61	■■■■■ 4.09
TPGS2-208	ENST00000588909	C3	P01024	1663 aa		40.58	■■■■■ 4.09
TPGS2-208	ENST00000588909	APLP2	Q06481	763 aa		40.57	■■■■■ 4.09
TPGS2-208	ENST00000588909	GGT6	Q6P531	493 aa		40.56	■■■■■ 4.08
TPGS2-208	ENST00000588909	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		40.56	■■■■■ 4.08
TPGS2-208	ENST00000588909	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		40.53	■■■■■ 4.08
TPGS2-208	ENST00000588909	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		40.53	■■■■■ 4.08
TPGS2-208	ENST00000588909	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		40.51	■■■■■ 4.08
TPGS2-208	ENST00000588909	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		40.5	■■■■■ 4.07
TPGS2-208	ENST00000588909	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		40.48	■■■■■ 4.07
TPGS2-208	ENST00000588909	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		40.47	■■■■■ 4.07
TPGS2-208	ENST00000588909	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		40.46	■■■■■ 4.07
TPGS2-208	ENST00000588909	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	40.46	■■■■■ 4.07
TPGS2-208	ENST00000588909	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	40.46	■■■■■ 4.07
TPGS2-208	ENST00000588909	TSPY4	P0CV99	314 aa		40.44	■■■■■ 4.06
TPGS2-208	ENST00000588909	TSPY10	P0CW01	314 aa		40.44	■■■■■ 4.06
TPGS2-208	ENST00000588909	ZMYM3	Q14202	1370 aa		40.44	■■■■■ 4.06
TPGS2-208	ENST00000588909	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	40.43	■■■■■ 4.06
TPGS2-208	ENST00000588909	MIA2	Q96PC5	1412 aa		40.4	■■■■■ 4.06
TPGS2-208	ENST00000588909	KIF3B	O15066	747 aa		40.38	■■■■■ 4.05
TPGS2-208	ENST00000588909	MROH2A	A6NES4	1674 aa		40.37	■■■■■ 4.05
TPGS2-208	ENST00000588909	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	40.34	■■■■■ 4.05
TPGS2-208	ENST00000588909	NPAT	Q14207	1427 aa		40.27	■■■■■ 4.04
TPGS2-208	ENST00000588909	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		40.26	■■■■■ 4.04
TPGS2-208	ENST00000588909	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		40.26	■■■■■ 4.04
TPGS2-208	ENST00000588909	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		40.24	■■■■■ 4.03
TPGS2-208	ENST00000588909	PTPRK	Q15262	1439 aa		40.24	■■■■■ 4.03
TPGS2-208	ENST00000588909	STRC	Q7RTU9	1775 aa		40.2	■■■■■ 4.03
TPGS2-208	ENST00000588909	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		40.2	■■■■■ 4.03
TPGS2-208	ENST00000588909	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		40.16	■■■■■ 4.02
TPGS2-208	ENST00000588909	ABCC5	O15440	1437 aa		40.16	■■■■■ 4.02
TPGS2-208	ENST00000588909	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		40.14	■■■■■ 4.02
TPGS2-208	ENST00000588909	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	40.12	■■■■■ 4.01
TPGS2-208	ENST00000588909	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		40.11	■■■■■ 4.01

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.4 ms