RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587385.6

PDCD2L-204, Transcript of programmed cell death 2 like, humanhuman

TSL 5

Gene PDCD2L, Length 1,227 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2L-204ENST00000587385 NCOA2Q15596 1464 aa41.27■■■■■ 4.2
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PDCD2L-204ENST00000587385 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.25■■■■■ 4.19
PDCD2L-204ENST00000587385 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.24■■■■■ 4.19
PDCD2L-204ENST00000587385 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.24■■■■■ 4.19
PDCD2L-204ENST00000587385 AKNAQ7Z591 1439 aa41.22■■■■■ 4.19
PDCD2L-204ENST00000587385 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.19■■■■■ 4.18
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PDCD2L-204ENST00000587385 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.72■■■■■ 4.11
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PDCD2L-204ENST00000587385 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.68■■■■■ 4.1
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PDCD2L-204ENST00000587385 ITGAEP38570 1179 aa40.05■■■■■ 4
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PDCD2L-204ENST00000587385 KIF3BO15066 747 aa40■■■■□ 3.99
PDCD2L-204ENST00000587385 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP39.98■■■■□ 3.99
PDCD2L-204ENST00000587385 PPP6R1Q9UPN7 881 aa39.98■■■■□ 3.99
PDCD2L-204ENST00000587385 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP39.94■■■■□ 3.98
PDCD2L-204ENST00000587385 FAM135AQ9P2D6 1515 aa39.93■■■■□ 3.98
PDCD2L-204ENST00000587385 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa39.92■■■■□ 3.98
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