RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580308.5

EPB41L3-218, Transcript of erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3, human

TSL 4

Gene EPB41L3, Length 492 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EPB41L3-218	ENST00000580308	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		43.71	■■■■■ 4.59
EPB41L3-218	ENST00000580308	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		43.68	■■■■■ 4.58
EPB41L3-218	ENST00000580308	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		43.68	■■■■■ 4.58
EPB41L3-218	ENST00000580308	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		43.68	■■■■■ 4.58
EPB41L3-218	ENST00000580308	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		43.67	■■■■■ 4.58
EPB41L3-218	ENST00000580308	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		43.67	■■■■■ 4.58
EPB41L3-218	ENST00000580308	PREX2	Q70Z35	1606 aa		43.65	■■■■■ 4.58
EPB41L3-218	ENST00000580308	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		43.65	■■■■■ 4.58
EPB41L3-218	ENST00000580308	CEP162	Q5TB80	1403 aa		43.61	■■■■■ 4.57
EPB41L3-218	ENST00000580308	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		43.59	■■■■■ 4.57
EPB41L3-218	ENST00000580308	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		43.55	■■■■■ 4.56
EPB41L3-218	ENST00000580308	KDM5C	P41229	1560 aa		43.54	■■■■■ 4.56
EPB41L3-218	ENST00000580308	MADD	Q8WXG6	1647 aa		43.53	■■■■■ 4.56
EPB41L3-218	ENST00000580308	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		43.52	■■■■■ 4.56
EPB41L3-218	ENST00000580308	PTPRM	P28827	1452 aa		43.51	■■■■■ 4.56
EPB41L3-218	ENST00000580308	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	43.5	■■■■■ 4.55
EPB41L3-218	ENST00000580308	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		43.5	■■■■■ 4.55
EPB41L3-218	ENST00000580308	ABCC1	P33527	1531 aa		43.48	■■■■■ 4.55
EPB41L3-218	ENST00000580308	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		43.44	■■■■■ 4.54
EPB41L3-218	ENST00000580308	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		43.42	■■■■■ 4.54
EPB41L3-218	ENST00000580308	ATP10A	O60312	1499 aa		43.41	■■■■■ 4.54
EPB41L3-218	ENST00000580308	AFAP1	Q8N556	730 aa		43.4	■■■■■ 4.54
EPB41L3-218	ENST00000580308	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	43.39	■■■■■ 4.54
EPB41L3-218	ENST00000580308	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		43.38	■■■■■ 4.53
EPB41L3-218	ENST00000580308	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	43.35	■■■■■ 4.53
EPB41L3-218	ENST00000580308	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		43.35	■■■■■ 4.53
EPB41L3-218	ENST00000580308	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		43.33	■■■■■ 4.53
EPB41L3-218	ENST00000580308	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		43.33	■■■■■ 4.53
EPB41L3-218	ENST00000580308	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		43.32	■■■■■ 4.52
EPB41L3-218	ENST00000580308	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		43.31	■■■■■ 4.52
EPB41L3-218	ENST00000580308	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		43.3	■■■■■ 4.52
EPB41L3-218	ENST00000580308	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		43.3	■■■■■ 4.52
EPB41L3-218	ENST00000580308	ABCA6	Q8N139	1617 aa		43.28	■■■■■ 4.52
EPB41L3-218	ENST00000580308	RERE	Q9P2R6	1566 aa		43.27	■■■■■ 4.52
EPB41L3-218	ENST00000580308	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		43.22	■■■■■ 4.51
EPB41L3-218	ENST00000580308	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		43.21	■■■■■ 4.51
EPB41L3-218	ENST00000580308	TIAM1	Q13009	1591 aa		43.2	■■■■■ 4.51
EPB41L3-218	ENST00000580308	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		43.2	■■■■■ 4.51
EPB41L3-218	ENST00000580308	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		43.2	■■■■■ 4.51
EPB41L3-218	ENST00000580308	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		43.15	■■■■■ 4.5
EPB41L3-218	ENST00000580308	MLEC	Q14165	292 aa		43.15	■■■■■ 4.5
EPB41L3-218	ENST00000580308	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		43.14	■■■■■ 4.5
EPB41L3-218	ENST00000580308	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	43.14	■■■■■ 4.5
EPB41L3-218	ENST00000580308	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		43.13	■■■■■ 4.5
EPB41L3-218	ENST00000580308	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	43.13	■■■■■ 4.49
EPB41L3-218	ENST00000580308	AGL	P35573	1532 aa		43.1	■■■■■ 4.49
EPB41L3-218	ENST00000580308	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		43.08	■■■■■ 4.49
EPB41L3-218	ENST00000580308	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		43.07	■■■■■ 4.49
EPB41L3-218	ENST00000580308	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	43.05	■■■■■ 4.48
EPB41L3-218	ENST00000580308	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	43.03	■■■■■ 4.48
EPB41L3-218	ENST00000580308	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	43.02	■■■■■ 4.48
EPB41L3-218	ENST00000580308	NCOA2	Q15596	1464 aa		43.01	■■■■■ 4.48
EPB41L3-218	ENST00000580308	ATP7A	Q04656	1500 aa		42.98	■■■■■ 4.47
EPB41L3-218	ENST00000580308	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	42.97	■■■■■ 4.47
EPB41L3-218	ENST00000580308	MBD5	Q9P267	1494 aa		42.95	■■■■■ 4.47
EPB41L3-218	ENST00000580308	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	42.95	■■■■■ 4.47
EPB41L3-218	ENST00000580308	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		42.92	■■■■■ 4.46
EPB41L3-218	ENST00000580308	MAP3K1	Q13233	1512 aa		42.92	■■■■■ 4.46
EPB41L3-218	ENST00000580308	PLXNC1	O60486	1568 aa		42.89	■■■■■ 4.46
EPB41L3-218	ENST00000580308	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		42.88	■■■■■ 4.45
EPB41L3-218	ENST00000580308	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		42.81	■■■■■ 4.44
EPB41L3-218	ENST00000580308	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	42.8	■■■■■ 4.44
EPB41L3-218	ENST00000580308	A2M	P01023	1474 aa		42.8	■■■■■ 4.44
EPB41L3-218	ENST00000580308	C3	P01024	1663 aa		42.79	■■■■■ 4.44
EPB41L3-218	ENST00000580308	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		42.79	■■■■■ 4.44
EPB41L3-218	ENST00000580308	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		42.77	■■■■■ 4.44
EPB41L3-218	ENST00000580308	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		42.75	■■■■■ 4.43
EPB41L3-218	ENST00000580308	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	42.74	■■■■■ 4.43
EPB41L3-218	ENST00000580308	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		42.73	■■■■■ 4.43
EPB41L3-218	ENST00000580308	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		42.72	■■■■■ 4.43
EPB41L3-218	ENST00000580308	HSPA2	P54652	639 aa		42.71	■■■■■ 4.43
EPB41L3-218	ENST00000580308	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		42.69	■■■■■ 4.42
EPB41L3-218	ENST00000580308	MROH2A	A6NES4	1674 aa		42.68	■■■■■ 4.42
EPB41L3-218	ENST00000580308	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	42.65	■■■■■ 4.42
EPB41L3-218	ENST00000580308	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	42.62	■■■■■ 4.41
EPB41L3-218	ENST00000580308	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		42.61	■■■■■ 4.41
EPB41L3-218	ENST00000580308	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		42.58	■■■■■ 4.41
EPB41L3-218	ENST00000580308	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		42.58	■■■■■ 4.41
EPB41L3-218	ENST00000580308	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	42.56	■■■■■ 4.4
EPB41L3-218	ENST00000580308	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	42.56	■■■■■ 4.4
EPB41L3-218	ENST00000580308	MIA2	Q96PC5	1412 aa		42.55	■■■■■ 4.4
EPB41L3-218	ENST00000580308	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	42.52	■■■■■ 4.4
EPB41L3-218	ENST00000580308	ZMYM3	Q14202	1370 aa		42.51	■■■■■ 4.4
EPB41L3-218	ENST00000580308	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		42.49	■■■■■ 4.39
EPB41L3-218	ENST00000580308	NPAT	Q14207	1427 aa		42.49	■■■■■ 4.39
EPB41L3-218	ENST00000580308	GGT6	Q6P531	493 aa		42.46	■■■■■ 4.39
EPB41L3-218	ENST00000580308	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		42.45	■■■■■ 4.39
EPB41L3-218	ENST00000580308	STRC	Q7RTU9	1775 aa		42.43	■■■■■ 4.38
EPB41L3-218	ENST00000580308	TSPY4	P0CV99	314 aa		42.39	■■■■■ 4.38
EPB41L3-218	ENST00000580308	TSPY10	P0CW01	314 aa		42.39	■■■■■ 4.38
EPB41L3-218	ENST00000580308	APLP2	Q06481	763 aa		42.39	■■■■■ 4.38
EPB41L3-218	ENST00000580308	PTPRK	Q15262	1439 aa		42.37	■■■■■ 4.37
EPB41L3-218	ENST00000580308	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		42.36	■■■■■ 4.37
EPB41L3-218	ENST00000580308	KIF3B	O15066	747 aa		42.33	■■■■■ 4.37
EPB41L3-218	ENST00000580308	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		42.32	■■■■■ 4.37
EPB41L3-218	ENST00000580308	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		42.3	■■■■■ 4.36
EPB41L3-218	ENST00000580308	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		42.3	■■■■■ 4.36
EPB41L3-218	ENST00000580308	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		42.28	■■■■■ 4.36
EPB41L3-218	ENST00000580308	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	42.28	■■■■■ 4.36
EPB41L3-218	ENST00000580308	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	42.26	■■■■■ 4.36

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