RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579572.1

SLC16A3-208, Transcript of solute carrier family 16 member 3, human

TSL 3

Gene SLC16A3, Length 863 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC16A3-208	ENST00000579572	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		32.29	■■■□□ 2.76
SLC16A3-208	ENST00000579572	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	32.24	■■■□□ 2.75
SLC16A3-208	ENST00000579572	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		32.23	■■■□□ 2.75
SLC16A3-208	ENST00000579572	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		32.23	■■■□□ 2.75
SLC16A3-208	ENST00000579572	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		32.21	■■■□□ 2.75
SLC16A3-208	ENST00000579572	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		32.21	■■■□□ 2.75
SLC16A3-208	ENST00000579572	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		32.18	■■■□□ 2.74
SLC16A3-208	ENST00000579572	PTPRM	P28827	1452 aa		32.13	■■■□□ 2.73
SLC16A3-208	ENST00000579572	PREX2	Q70Z35	1606 aa		32.13	■■■□□ 2.73
SLC16A3-208	ENST00000579572	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		32.13	■■■□□ 2.73
SLC16A3-208	ENST00000579572	CEP162	Q5TB80	1403 aa		32.11	■■■□□ 2.73
SLC16A3-208	ENST00000579572	ATP10A	O60312	1499 aa		32.1	■■■□□ 2.73
SLC16A3-208	ENST00000579572	KDM5C	P41229	1560 aa		32.1	■■■□□ 2.73
SLC16A3-208	ENST00000579572	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		32.09	■■■□□ 2.73
SLC16A3-208	ENST00000579572	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		32.08	■■■□□ 2.73
SLC16A3-208	ENST00000579572	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		32.07	■■■□□ 2.72
SLC16A3-208	ENST00000579572	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		32.04	■■■□□ 2.72
SLC16A3-208	ENST00000579572	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		32.03	■■■□□ 2.72
SLC16A3-208	ENST00000579572	AFAP1	Q8N556	730 aa		32.03	■■■□□ 2.72
SLC16A3-208	ENST00000579572	ABCC1	P33527	1531 aa		32.03	■■■□□ 2.72
SLC16A3-208	ENST00000579572	MADD	Q8WXG6	1647 aa		32.03	■■■□□ 2.72
SLC16A3-208	ENST00000579572	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		32	■■■□□ 2.71
SLC16A3-208	ENST00000579572	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	32	■■■□□ 2.71
SLC16A3-208	ENST00000579572	RERE	Q9P2R6	1566 aa		31.97	■■■□□ 2.71
SLC16A3-208	ENST00000579572	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		31.96	■■■□□ 2.71
SLC16A3-208	ENST00000579572	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		31.96	■■■□□ 2.71
SLC16A3-208	ENST00000579572	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		31.95	■■■□□ 2.71
SLC16A3-208	ENST00000579572	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		31.94	■■■□□ 2.7
SLC16A3-208	ENST00000579572	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		31.93	■■■□□ 2.7
SLC16A3-208	ENST00000579572	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		31.93	■■■□□ 2.7
SLC16A3-208	ENST00000579572	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		31.93	■■■□□ 2.7
SLC16A3-208	ENST00000579572	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		31.92	■■■□□ 2.7
SLC16A3-208	ENST00000579572	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	31.92	■■■□□ 2.7
SLC16A3-208	ENST00000579572	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	31.9	■■■□□ 2.7
SLC16A3-208	ENST00000579572	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		31.89	■■■□□ 2.7
SLC16A3-208	ENST00000579572	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		31.89	■■■□□ 2.69
SLC16A3-208	ENST00000579572	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	31.88	■■■□□ 2.69
SLC16A3-208	ENST00000579572	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		31.86	■■■□□ 2.69
SLC16A3-208	ENST00000579572	MLEC	Q14165	292 aa		31.86	■■■□□ 2.69
SLC16A3-208	ENST00000579572	AGL	P35573	1532 aa		31.85	■■■□□ 2.69
SLC16A3-208	ENST00000579572	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SLC16A3-208	ENST00000579572	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		31.82	■■■□□ 2.68
SLC16A3-208	ENST00000579572	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		31.81	■■■□□ 2.68
SLC16A3-208	ENST00000579572	ABCA6	Q8N139	1617 aa		31.81	■■■□□ 2.68
SLC16A3-208	ENST00000579572	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	31.8	■■■□□ 2.68
SLC16A3-208	ENST00000579572	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		31.8	■■■□□ 2.68
SLC16A3-208	ENST00000579572	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SLC16A3-208	ENST00000579572	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	31.77	■■■□□ 2.68
SLC16A3-208	ENST00000579572	TIAM1	Q13009	1591 aa		31.77	■■■□□ 2.68
SLC16A3-208	ENST00000579572	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		31.76	■■■□□ 2.67
SLC16A3-208	ENST00000579572	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	31.72	■■■□□ 2.67
SLC16A3-208	ENST00000579572	MAP3K1	Q13233	1512 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SLC16A3-208	ENST00000579572	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		31.71	■■■□□ 2.67
SLC16A3-208	ENST00000579572	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	31.71	■■■□□ 2.67
SLC16A3-208	ENST00000579572	NCOA2	Q15596	1464 aa		31.7	■■■□□ 2.66
SLC16A3-208	ENST00000579572	ATP7A	Q04656	1500 aa		31.7	■■■□□ 2.66
SLC16A3-208	ENST00000579572	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		31.69	■■■□□ 2.66
SLC16A3-208	ENST00000579572	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		31.66	■■■□□ 2.66
SLC16A3-208	ENST00000579572	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	31.66	■■■□□ 2.66
SLC16A3-208	ENST00000579572	MBD5	Q9P267	1494 aa		31.65	■■■□□ 2.66
SLC16A3-208	ENST00000579572	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		31.64	■■■□□ 2.66
SLC16A3-208	ENST00000579572	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		31.62	■■■□□ 2.65
SLC16A3-208	ENST00000579572	A2M	P01023	1474 aa		31.61	■■■□□ 2.65
SLC16A3-208	ENST00000579572	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	31.6	■■■□□ 2.65
SLC16A3-208	ENST00000579572	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		31.6	■■■□□ 2.65
SLC16A3-208	ENST00000579572	PLXNC1	O60486	1568 aa		31.58	■■■□□ 2.65
SLC16A3-208	ENST00000579572	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	31.57	■■■□□ 2.64
SLC16A3-208	ENST00000579572	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		31.56	■■■□□ 2.64
SLC16A3-208	ENST00000579572	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		31.56	■■■□□ 2.64
SLC16A3-208	ENST00000579572	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	31.55	■■■□□ 2.64
SLC16A3-208	ENST00000579572	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		31.54	■■■□□ 2.64
SLC16A3-208	ENST00000579572	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		31.54	■■■□□ 2.64
SLC16A3-208	ENST00000579572	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		31.53	■■■□□ 2.64
SLC16A3-208	ENST00000579572	APLP2	Q06481	763 aa		31.51	■■■□□ 2.63
SLC16A3-208	ENST00000579572	MROH2A	A6NES4	1674 aa		31.5	■■■□□ 2.63
SLC16A3-208	ENST00000579572	MIA2	Q96PC5	1412 aa		31.49	■■■□□ 2.63
SLC16A3-208	ENST00000579572	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		31.49	■■■□□ 2.63
SLC16A3-208	ENST00000579572	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	31.49	■■■□□ 2.63
SLC16A3-208	ENST00000579572	HSPA2	P54652	639 aa		31.49	■■■□□ 2.63
SLC16A3-208	ENST00000579572	C3	P01024	1663 aa		31.48	■■■□□ 2.63
SLC16A3-208	ENST00000579572	TSPY4	P0CV99	314 aa		31.48	■■■□□ 2.63
SLC16A3-208	ENST00000579572	TSPY10	P0CW01	314 aa		31.48	■■■□□ 2.63
SLC16A3-208	ENST00000579572	NPAT	Q14207	1427 aa		31.48	■■■□□ 2.63
SLC16A3-208	ENST00000579572	ZMYM3	Q14202	1370 aa		31.44	■■■□□ 2.62
SLC16A3-208	ENST00000579572	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	31.44	■■■□□ 2.62
SLC16A3-208	ENST00000579572	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	31.44	■■■□□ 2.62
SLC16A3-208	ENST00000579572	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		31.43	■■■□□ 2.62
SLC16A3-208	ENST00000579572	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		31.42	■■■□□ 2.62
SLC16A3-208	ENST00000579572	GGT6	Q6P531	493 aa		31.41	■■■□□ 2.62
SLC16A3-208	ENST00000579572	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		31.4	■■■□□ 2.62
SLC16A3-208	ENST00000579572	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		31.33	■■■□□ 2.61
SLC16A3-208	ENST00000579572	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	31.3	■■■□□ 2.6
SLC16A3-208	ENST00000579572	KIF3B	O15066	747 aa		31.3	■■■□□ 2.6
SLC16A3-208	ENST00000579572	FBXO41	Q8TF61	875 aa		31.3	■■■□□ 2.6
SLC16A3-208	ENST00000579572	PTPRK	Q15262	1439 aa		31.27	■■■□□ 2.6
SLC16A3-208	ENST00000579572	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		31.24	■■■□□ 2.59
SLC16A3-208	ENST00000579572	PTPRT	O14522	1441 aa		31.24	■■■□□ 2.59
SLC16A3-208	ENST00000579572	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		31.21	■■■□□ 2.59
SLC16A3-208	ENST00000579572	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		31.2	■■■□□ 2.58
SLC16A3-208	ENST00000579572	STRC	Q7RTU9	1775 aa		31.2	■■■□□ 2.58

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