RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 NCOA2Q15596 1464 aa51.8■■■■■ 5.88
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARHGAP5Q13017 1502 aa51.79■■■■■ 5.88
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCNB3Q8WWL7 1395 aa51.78■■■■■ 5.88
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP51.78■■■■■ 5.88
CTDNEP1-209ENST00000574205 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa51.75■■■■■ 5.88
CTDNEP1-209ENST00000574205 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP51.74■■■■■ 5.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 AKNAQ7Z591 1439 aa51.74■■■■■ 5.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 ITSN2Q9NZM3 1697 aa51.68■■■■■ 5.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADGRL1O94910 1474 aa51.61■■■■■ 5.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP51.59■■■■■ 5.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP51.52■■■■■ 5.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 SCAPERQ9BY12 1400 aa51.51■■■■■ 5.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa51.49■■■■■ 5.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP51.48■■■■■ 5.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABCC1P33527 1531 aa51.47■■■■■ 5.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAPGEF3O95398 923 aa51.46■■■■■ 5.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 RICTORQ6R327 1708 aa51.45■■■■■ 5.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 MYOM3Q5VTT5 1437 aa51.44■■■■■ 5.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa51.43■■■■■ 5.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 POGZQ7Z3K3 1410 aa51.4■■■■■ 5.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa51.39■■■■■ 5.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 MIA2Q96PC5 1412 aa51.35■■■■■ 5.81
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa51.35■■■■■ 5.81
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa51.35■■■■■ 5.81
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa51.33■■■■■ 5.81
CTDNEP1-209ENST00000574205 SYCP2Q9BX26 1530 aa51.32■■■■■ 5.81
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP51.3■■■■■ 5.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa51.28■■■■■ 5.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa51.27■■■■■ 5.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP51.27■■■■■ 5.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa51.24■■■■■ 5.79
CTDNEP1-209ENST00000574205 KDM5CP41229 1560 aa51.23■■■■■ 5.79
CTDNEP1-209ENST00000574205 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP51.22■■■■■ 5.79
CTDNEP1-209ENST00000574205 AFAP1Q8N556 730 aa51.22■■■■■ 5.79
CTDNEP1-209ENST00000574205 FGD6Q6ZV73 1430 aa51.2■■■■■ 5.79
CTDNEP1-209ENST00000574205 MBD5Q9P267 1494 aa51.17■■■■■ 5.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAGI2Q86UL8 1455 aa51.16■■■■■ 5.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 PTPN23Q9H3S7 1636 aa51.14■■■■■ 5.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 HECW2Q9P2P5 1572 aa51.09■■■■■ 5.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa51.07■■■■■ 5.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa51.06■■■■■ 5.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARHGEF5Q12774 1597 aa51.06■■■■■ 5.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP51.06■■■■■ 5.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 MLH3Q9UHC1 1453 aa51.06■■■■■ 5.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 RSPH4AQ5TD94 716 aa51.06■■■■■ 5.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC141Q6ZP82 1450 aa51.04■■■■■ 5.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 YEATS2Q9ULM3 1422 aa51.01■■■■■ 5.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 MYT1LQ9UL68 1186 aa50.97■■■■■ 5.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP50.97■■■■■ 5.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa50.95■■■■■ 5.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP50.92■■■■■ 5.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP7AQ04656 1500 aa50.91■■■■■ 5.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABCA6Q8N139 1617 aa50.87■■■■■ 5.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa50.86■■■■■ 5.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP10AO60312 1499 aa50.85■■■■■ 5.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa50.85■■■■■ 5.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 TSPY4P0CV99 314 aa50.84■■■■■ 5.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 TSPY10P0CW01 314 aa50.84■■■■■ 5.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP50.84■■■■■ 5.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP50.83■■■■■ 5.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 C9orf84Q5VXU9 1444 aa50.79■■■■■ 5.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 CROCC2H7BZ55 1655 aa50.78■■■■■ 5.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABCC5O15440 1437 aa50.78■■■■■ 5.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 DAPK1P53355 1430 aa50.77■■■■■ 5.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAST1Q9Y2H9 1570 aa50.77■■■■■ 5.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP50.76■■■■■ 5.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 REREQ9P2R6 1566 aa50.73■■■■■ 5.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 SHANK2Q9UPX8 1470 aa50.73■■■■■ 5.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP50.73■■■■■ 5.711e-25■■■■□ 20
CTDNEP1-209ENST00000574205 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa50.67■■■■■ 5.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADGBQ8N7X0 1667 aa50.66■■■■■ 5.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP50.63■■■■■ 5.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 A2MP01023 1474 aa50.6■■■■■ 5.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLXNC1O60486 1568 aa50.59■■■■■ 5.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 AGLP35573 1532 aa50.55■■■■■ 5.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 BCORL1Q5H9F3 1711 aa50.51■■■■■ 5.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP50.49■■■■■ 5.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHIC2Q9UKJ5 165 aa50.47■■■■■ 5.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADGRL2O95490 1459 aa50.46■■■■■ 5.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa50.45■■■■■ 5.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 PTPRKQ15262 1439 aa50.45■■■■■ 5.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa50.41■■■■■ 5.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 NCOA1Q15788 1441 aa50.41■■■■■ 5.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIF15Q9NS87 1388 aa50.41■■■■■ 5.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 ITGAEP38570 1179 aa50.39■■■■■ 5.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADAMTSL3P82987 1691 aa50.38■■■■■ 5.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 DUOX2Q9NRD8 1548 aa50.38■■■■■ 5.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa50.37■■■■■ 5.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 MLECQ14165 292 aa50.36■■■■■ 5.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 ROCK1Q13464 1354 aa50.31■■■■■ 5.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP50.27■■■■■ 5.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 MADDQ8WXG6 1647 aa50.26■■■■■ 5.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 ERBINQ96RT1 1412 aa50.25■■■■■ 5.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIF3BO15066 747 aa50.24■■■■■ 5.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa50.22■■■■■ 5.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 GGT6Q6P531 493 aa50.16■■■■■ 5.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP50.12■■■■■ 5.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP50.12■■■■■ 5.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa50.11■■■■■ 5.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPP6R1Q9UPN7 881 aa50.09■■■■■ 5.61
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