RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574095.1

NPLOC4-215, Transcript of NPL4 homolog, ubiquitin recognition factor, humanhuman

TSL 3

Gene NPLOC4, Length 277 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPLOC4-215ENST00000574095 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa41.93■■■■■ 4.3
NPLOC4-215ENST00000574095 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP41.92■■■■■ 4.3
NPLOC4-215ENST00000574095 POGZQ7Z3K3 1410 aa41.91■■■■■ 4.3
NPLOC4-215ENST00000574095 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.9■■■■■ 4.3
NPLOC4-215ENST00000574095 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.88■■■■■ 4.29
NPLOC4-215ENST00000574095 YEATS2Q9ULM3 1422 aa41.86■■■■■ 4.29
NPLOC4-215ENST00000574095 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa41.86■■■■■ 4.29
NPLOC4-215ENST00000574095 ADAMTSL3P82987 1691 aa41.84■■■■■ 4.29
NPLOC4-215ENST00000574095 MAGI2Q86UL8 1455 aa41.84■■■■■ 4.29
NPLOC4-215ENST00000574095 PREX2Q70Z35 1606 aa41.83■■■■■ 4.29
NPLOC4-215ENST00000574095 BCORL1Q5H9F3 1711 aa41.82■■■■■ 4.29
NPLOC4-215ENST00000574095 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.78■■■■■ 4.28
NPLOC4-215ENST00000574095 AFAP1Q8N556 730 aa41.76■■■■■ 4.28
NPLOC4-215ENST00000574095 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa41.72■■■■■ 4.27
NPLOC4-215ENST00000574095 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa41.72■■■■■ 4.27
NPLOC4-215ENST00000574095 MADDQ8WXG6 1647 aa41.69■■■■■ 4.27
NPLOC4-215ENST00000574095 PTPRMP28827 1452 aa41.69■■■■■ 4.26
NPLOC4-215ENST00000574095 MTUS2Q5JR59 1369 aa41.68■■■■■ 4.26
NPLOC4-215ENST00000574095 ABCC1P33527 1531 aa41.66■■■■■ 4.26
NPLOC4-215ENST00000574095 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.66■■■■■ 4.26
NPLOC4-215ENST00000574095 KDM5CP41229 1560 aa41.66■■■■■ 4.26
NPLOC4-215ENST00000574095 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP41.65■■■■■ 4.26
NPLOC4-215ENST00000574095 MYT1LQ9UL68 1186 aa41.65■■■■■ 4.26
NPLOC4-215ENST00000574095 ATP10AO60312 1499 aa41.65■■■■■ 4.26
NPLOC4-215ENST00000574095 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.64■■■■■ 4.26
NPLOC4-215ENST00000574095 HECW2Q9P2P5 1572 aa41.63■■■■■ 4.26
NPLOC4-215ENST00000574095 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.62■■■■■ 4.25
NPLOC4-215ENST00000574095 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa41.61■■■■■ 4.25
NPLOC4-215ENST00000574095 MLECQ14165 292 aa41.6■■■■■ 4.25
NPLOC4-215ENST00000574095 C9orf84Q5VXU9 1444 aa41.59■■■■■ 4.25
NPLOC4-215ENST00000574095 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
NPLOC4-215ENST00000574095 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.56■■■■■ 4.24
NPLOC4-215ENST00000574095 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.55■■■■■ 4.24
NPLOC4-215ENST00000574095 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa41.54■■■■■ 4.24
NPLOC4-215ENST00000574095 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.53■■■■■ 4.24
NPLOC4-215ENST00000574095 MLH3Q9UHC1 1453 aa41.52■■■■■ 4.24
NPLOC4-215ENST00000574095 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa41.5■■■■■ 4.23
NPLOC4-215ENST00000574095 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41.47■■■■■ 4.23
NPLOC4-215ENST00000574095 ABCA6Q8N139 1617 aa41.47■■■■■ 4.23
NPLOC4-215ENST00000574095 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.46■■■■■ 4.23
NPLOC4-215ENST00000574095 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.46■■■■■ 4.23
NPLOC4-215ENST00000574095 PLPPR3Q6T4P5 718 aa41.44■■■■■ 4.22
NPLOC4-215ENST00000574095 TIAM1Q13009 1591 aa41.43■■■■■ 4.22
NPLOC4-215ENST00000574095 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa41.42■■■■■ 4.22
NPLOC4-215ENST00000574095 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.42■■■■■ 4.22
NPLOC4-215ENST00000574095 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.37■■■■■ 4.21
NPLOC4-215ENST00000574095 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.37■■■■■ 4.21
NPLOC4-215ENST00000574095 REREQ9P2R6 1566 aa41.37■■■■■ 4.21
NPLOC4-215ENST00000574095 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.35■■■■■ 4.21
NPLOC4-215ENST00000574095 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
NPLOC4-215ENST00000574095 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP41.32■■■■■ 4.21
NPLOC4-215ENST00000574095 NCOA2Q15596 1464 aa41.31■■■■■ 4.2
NPLOC4-215ENST00000574095 AGLP35573 1532 aa41.25■■■■■ 4.19
NPLOC4-215ENST00000574095 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa41.23■■■■■ 4.19
NPLOC4-215ENST00000574095 ATP7AQ04656 1500 aa41.22■■■■■ 4.19
NPLOC4-215ENST00000574095 LMTK3Q96Q04 1460 aa41.21■■■■■ 4.19
NPLOC4-215ENST00000574095 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP41.19■■■■■ 4.18
NPLOC4-215ENST00000574095 MBD5Q9P267 1494 aa41.19■■■■■ 4.18
NPLOC4-215ENST00000574095 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP41.19■■■■■ 4.18
NPLOC4-215ENST00000574095 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.18■■■■■ 4.18
NPLOC4-215ENST00000574095 MAP3K1Q13233 1512 aa41.15■■■■■ 4.18
NPLOC4-215ENST00000574095 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.1■■■■■ 4.17
NPLOC4-215ENST00000574095 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP41.1■■■■■ 4.17
NPLOC4-215ENST00000574095 A2MP01023 1474 aa41.08■■■■■ 4.17
NPLOC4-215ENST00000574095 HSPA2P54652 639 aa41.07■■■■■ 4.17
NPLOC4-215ENST00000574095 PLXNC1O60486 1568 aa41.03■■■■■ 4.16
NPLOC4-215ENST00000574095 C3P01024 1663 aa41.01■■■■■ 4.16
NPLOC4-215ENST00000574095 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.01■■■■■ 4.16
NPLOC4-215ENST00000574095 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa41.01■■■■■ 4.15
NPLOC4-215ENST00000574095 ADGBQ8N7X0 1667 aa41.01■■■■■ 4.15
NPLOC4-215ENST00000574095 APLP2Q06481 763 aa41■■■■■ 4.15
NPLOC4-215ENST00000574095 RSPH4AQ5TD94 716 aa40.98■■■■■ 4.15
NPLOC4-215ENST00000574095 PREX1Q8TCU6 1659 aa40.97■■■■■ 4.15
NPLOC4-215ENST00000574095 CNTLNQ9NXG0 1405 aa40.94■■■■■ 4.14
NPLOC4-215ENST00000574095 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
NPLOC4-215ENST00000574095 GGT6Q6P531 493 aa40.92■■■■■ 4.14
NPLOC4-215ENST00000574095 ARHGEF5Q12774 1597 aa40.91■■■■■ 4.14
NPLOC4-215ENST00000574095 MYOM3Q5VTT5 1437 aa40.9■■■■■ 4.14
NPLOC4-215ENST00000574095 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP40.87■■■■■ 4.13
NPLOC4-215ENST00000574095 TSPY4P0CV99 314 aa40.87■■■■■ 4.13
NPLOC4-215ENST00000574095 TSPY10P0CW01 314 aa40.87■■■■■ 4.13
NPLOC4-215ENST00000574095 MIA2Q96PC5 1412 aa40.85■■■■■ 4.13
NPLOC4-215ENST00000574095 MROH2AA6NES4 1674 aa40.85■■■■■ 4.13
NPLOC4-215ENST00000574095 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP40.85■■■■■ 4.13
NPLOC4-215ENST00000574095 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa40.84■■■■■ 4.13
NPLOC4-215ENST00000574095 ZMYM3Q14202 1370 aa40.84■■■■■ 4.13
NPLOC4-215ENST00000574095 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP40.78■■■■■ 4.12
NPLOC4-215ENST00000574095 KIF3BO15066 747 aa40.76■■■■■ 4.12
NPLOC4-215ENST00000574095 PPP6R1Q9UPN7 881 aa40.75■■■■■ 4.11
NPLOC4-215ENST00000574095 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.71■■■■■ 4.11
NPLOC4-215ENST00000574095 NPATQ14207 1427 aa40.69■■■■■ 4.1
NPLOC4-215ENST00000574095 PTPN23Q9H3S7 1636 aa40.66■■■■■ 4.1
NPLOC4-215ENST00000574095 STRCQ7RTU9 1775 aa40.63■■■■■ 4.1
NPLOC4-215ENST00000574095 PTPRKQ15262 1439 aa40.62■■■■■ 4.09
NPLOC4-215ENST00000574095 FGD6Q6ZV73 1430 aa40.59■■■■■ 4.09
NPLOC4-215ENST00000574095 ABCC5O15440 1437 aa40.56■■■■■ 4.08
NPLOC4-215ENST00000574095 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa40.55■■■■■ 4.08
NPLOC4-215ENST00000574095 KDM5DQ9BY66 1539 aa40.53■■■■■ 4.08
NPLOC4-215ENST00000574095 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP40.52■■■■■ 4.08
NPLOC4-215ENST00000574095 CROCC2H7BZ55 1655 aa40.52■■■■■ 4.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 153 ms